新生儿与婴幼儿及儿童相比，通常有较卫生的护理，母乳喂养也可保护新生儿。然而，在卫生条件较差的地区或贫穷和拥挤的家庭中，更经常地发生腹泻。医院内也可有暴发流行，特别在拥挤的婴儿室，粪口传播几乎为最常见的途径。大多数新生儿感染是通过被污染的产道时或由父母，同胞及医护人员的双手而传播，其他少见的原因有污染物或污染的奶制品。
