细菌耐药性问题的核心是缺乏快速而通用的抗生素敏感性试验(AST),该试验可以评估感染病原体对抗生素的敏感性,从而直接在临床治疗时提供治疗方案。在3月19日发表在开放获取期刊《PLoS Biology》上的两篇新论文中,来自加州理工学院Rustem Ismagilov实验室的研究人员开发了两种截然不同的,高度创新的AST方法,用于在极短的时间范围(约30分钟)直接测量病原体对β-内酰胺类抗生素的敏感性。
一些快速的“基因型”测试可检测病原体中抗生素抗性基因的存在,但是这些测试只能检测到少数潜在的无数抗生素抗性机制。相比之下,“表型”测试直接测量病原体对抗生素的反应,因此是“金标准”。但是,大多数表型测试都需要培养病原体,因此速度太慢(需要数小时到数天)。
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新的表型测试量化了抗生素暴露后病原体核酸浓度的微小变化,并有望用于快速生长的病原体和影响DNA复制的抗生素。但是,还没有开发出用于检测病原体对不影响DNA复制的抗生素的耐受性的快速AST的手段,例如β-内酰胺类抗生素(最重要的一类)。
β-内酰胺类抗生素通过抑制细菌制造和修复其细胞壁的能力发挥作用。因此,研究人员认为,可以通过测量用药后DNA的暴露情况来评估细菌对β-内酰胺的耐药性或敏感性,从而将细胞壁损伤与快速DNA直接联系在一起。
“该项目最有价值的一点在于,即使所测试的抗生素不会直接影响细菌的DNA复制,我们也可以使用DNA读数来测量抗生素的敏感性”,作者说道。
新开发的AST方法可克服快速确定病原体对β-内酰胺的敏感性所固有的问题。每篇论文都包含对患者样本的试点实验,证明了这些测试的相关性以及最终可以转化为临床检测手段的潜力。
“最终,我们希望设计出可用于临床的诊断测试,”加州理工学院的Emily Savela说: “直接使用患者样本和即时护理时标会增加很多复杂性。我们的研究团队致力于在开发的早期阶段识别并合并这些增加的变量。”
将这些新的AST方法投入临床仍将需要大量工作。但是,研究团队对这些新功能感到乐观,因为它们最终为通向抗生素敏感性的一般快速测试奠定了基础。
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