时空分辨单细胞测序技术中样本处理的一般流程

时空分辨单细胞测序技术中样本处理的一般流程示例，您可以根据具体实验需求和条件进行调整和优化：

1. 样本采集

• 严格遵循临床操作规范，迅速且准确地采集目标样本，如肿瘤组织、血液、脑脊液等。

• 记录样本采集的时间、部位、患者信息等详细数据。

2. 样本运输

• 将采集的样本立即放入预冷的保存容器中，维持低温条件，尽快运输至实验室。

3. 样本预处理

• 检查样本的外观、体积等基本特征。

• 如有需要，进行简单的清洗或去除杂质。

4. 组织解离（针对实体组织）

• 选择合适的酶（如胶原酶、蛋白酶等）和化学试剂，将组织解离成单细胞悬液。

• 控制解离的时间和条件，避免过度消化导致细胞损伤。

5. 细胞过滤

• 使用合适孔径的滤网（通常为 40 - 70 微米）过滤细胞悬液，去除细胞团块和碎片。

6. 细胞计数与活力检测

• 采用血细胞计数板或自动细胞计数仪进行细胞计数。

• 通过台盼蓝染色或其他活力检测方法评估细胞的活力。

7. 细胞分选（可选）

• 根据实验目的，使用荧光激活细胞分选（FACS）或磁珠分选等技术，获取特定类型的细胞。

8. 固定和标记（根据技术要求）

• 选择合适的固定剂（如多聚甲醛）固定细胞，以保持其空间结构和生物分子的稳定性。

• 进行细胞表面标志物或核酸染料的标记。

9. 样本保存

• 将处理好的样本置于低温（如 -80°C 或液氮）中保存，直到进行测序。

10. 质量控制

• 在样本处理的关键步骤，检测细胞活力、RNA 完整性、细胞浓度等指标，确保样本质量符合测序要求。

需要注意的是，不同类型的样本和实验目的可能需要对流程进行相应的调整和优化。