在时空分辨单细胞测序技术的临床应用中,以下是一些样本处理的最佳实践方法:


  1. 样本采集的及时性

    • 尽快采集样本,以减少细胞内基因表达和分子状态的变化。

  2. 低温保存

    • 采集后迅速置于低温环境(如液氮或 -80°C 冰箱)中,抑制酶活性和分子降解。

  3. 避免机械损伤

    • 操作轻柔,减少对细胞和组织的物理损伤,保持其空间结构完整性。

  4. 无菌操作

    • 严格遵循无菌原则,防止样本污染,影响后续分析。

  5. 固定剂的选择

    • 根据样本类型和研究目的,选择合适的固定剂,如多聚甲醛等,既能保持细胞形态和分子结构,又不影响后续测序反应。

  6. 组织解离

    • 采用温和有效的解离方法,将组织分解为单细胞悬液,同时尽量减少对细胞表面标志物和基因表达的影响。

  7. 细胞过滤和分选

    • 使用合适孔径的滤网过滤细胞,去除细胞碎片和团块,并通过荧光激活细胞分选等技术,获取特定类型的细胞。

  8. 质量控制

    • 在处理过程中,定期检测样本的细胞活力、RNA 完整性等指标,确保样本质量符合测序要求。

  9. 标准化操作流程

    • 建立详细、标准化的样本处理操作流程,并对操作人员进行严格培训,以保证不同样本处理的一致性和可靠性。

  10. 记录详细信息

    • 记录样本采集的时间、部位、患者信息以及处理过程中的所有操作和条件,便于后续结果的分析和解读。


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