发布时间:2023-05-12 15:21 原文链接: 机器学习工具可能在症状出现前几年就诊断出帕金森病

  帕金森病(PD)的增长速度比任何其他神经系统疾病都要快,这使得其早期检测如此重要。研究人员已经开发出一种新的机器学习工具,显示出作为早期检测该疾病的一种方式的前景。PD的诊断通常发生在一个人出现传统症状的时候:运动缓慢、震颤、平衡和协调能力差以及肌肉僵硬。

  但非典型症状的出现,如疲劳、睡眠困难、膀胱或肠道问题、抑郁和/或焦虑,以及嗅觉丧失,可能比传统的PD症状早很多年。一种可靠的生物标志物测试方法,导致PD的早期诊断,而不是等待传统症状的出现,将意味着该疾病的治疗可以提前开始。

  现在,新南威尔士大学悉尼分校的研究人员与波士顿大学合作,利用机器学习的力量开发了一种工具,显示出作为PD早期检测器的前景。

  机器学习被广泛用于开发疾病预测的精确模型。而先进的机器学习方法,如神经网络,是处理大量数据的一种方式。然而,为了有效,机器学习算法需要使用没有"噪音"的数据进行教学。代谢组学,对代谢物的大规模研究,在这方面可能存在问题。

  许多代谢物--当身体分解食物、药物和化学品时产生的副产品--与其他代谢物相关,其中一些对疾病预测没有重大贡献。这就是为什么研究人员开发了一个新的机器学习工具,即使用神经网络生成的质谱知识的分类和排名分析或CRANK-MS。

  "为了弄清楚哪些代谢物对疾病与对照组更有意义,研究人员通常会研究涉及特定分子的相关性,"该研究的主要作者J Diana Zhang说。"但在这里,我们考虑到代谢物可能与其他代谢物有关联--这就是机器学习发挥作用的地方。面对成百上千的代谢物,我们利用计算能力来了解发生了什么。"

  研究人员从西班牙欧洲癌症和营养前瞻性调查(EPIC)中获得了代谢组数据,重点是39名已经发展成PD的患者,并通过CRANK-MS进行了分析。在将PD患者与健康患者进行比较后,研究人员能够确定独特的代谢组合,这些组合可能是该疾病的早期预警信号。

  使用CRANK-MS的好处是,研究人员可以使用不含杂质的数据,这简化了过程。

  该研究的通讯作者William Donald说:"通常情况下,使用机器学习来检查代谢物和疾病之间的相关性的研究人员首先减少化学特征的数量,然后再将其输入算法。但在这里,我们把所有的信息都输入了CRANK-MS,而没有在一开始就进行任何数据缩减。由此,我们可以得到模型预测,并确定哪些代谢物对预测的影响最大,所有这些都在一个步骤中完成。这意味着,如果有一些代谢物可能在使用传统方法时被遗漏,我们现在可以把它们找出来。"

  虽然CRANK-MS能够分析指示PD的代谢物,准确率高达96%,但研究人员明白,该研究的小样本量意味着需要进一步研究。

  研究人员说,在未来,CRANK-MS可以在出现不典型症状的第一个迹象时使用,以确保早期诊断PD或排除它。而且机器学习算法是公开的,可供那些可能想使用它的研究人员使用。

  Zhang说:"我们以这样一种方式建立了这个模型,它适合于目的。应用CRANK-MS检测帕金森病只是一个例子,说明人工智能可以改善我们诊断和监测疾病的方式。令人激动的是,CRANK-MS可以很容易地应用于其他疾病,以确定新的感兴趣的生物标志物。"

  该研究发表在ACS中央科学杂志上。

相关文章

表观遗传学治疗癌症,剑桥分拆公司获投资2500万美元

日前,英国生物技术公司CellCentric宣布FDA已授予其治疗多发性骨髓瘤药物孤儿药资格。今日,该公司表示获得辉瑞投资2500万美元,继续支持该药物的临床研究。此外,辉瑞的肿瘤生物学副总裁Astr......

我科研团队研发出帕金森病分子影像学新标志物

7月9日,记者从武汉大学人民医院获悉,该院特聘教授叶克强、神经精神医院教授张振涛和上海交通大学教授李丹创新研发了一种帕金森病的PET分子影像学标志物,首次为帕金森病的早期诊断提供客观的影像学检查方法,......

医用级智能手表或可提前7年诊断帕金森病

帕金森病是一种进行性神经退行性运动障碍,潜伏期较长,并且没有彻底的治疗方法。大多数患者在确诊时,50%-70的运动相关神经元退化[1]。换句话说,患者的大脑早在确诊前几年就开始遭受损害,如果能够提前预......

国际最新研究:运动追踪数据或能帮助发现帕金森病

施普林格·自然旗下专业学术期刊《自然-医学》最新发表的一项健康研究发现,被动采集的运动追踪数据或能作为预测帕金森病未来发展的早期指标。该研究结果表明,这些运动追踪数据或能实现相对低成本且无创的大规模人......

癌症结局,真的男女不同

《自然》杂志最近发表的两项动物模型和一些人类数据研究,揭示了Y染色体在癌症结局的性别差异中起的作用,其中雄性常比雌性受到更大的不利影响。这些发现或能引导开发疗法,降低与性别相关的癌症风险。已知性别影响......

震惊!男女癌症差异竟是因为Y染色体!

《自然》杂志最近发表的两项动物模型和一些人类数据研究,揭示了Y染色体在癌症结局的性别差异中起的作用,其中雄性常比雌性受到更大的不利影响。这些发现或能引导开发疗法,降低与性别相关的癌症风险。已知性别影响......

CellGenomics:新研究揭示糖皮质激素破坏癌症免疫疗法之谜

免疫疗法(immunotherapy)是对抗癌症的最新和最有力的武器之一。它促使免疫系统将肿瘤识别为体内的入侵者并进行攻击。但并非所有患者都对免疫疗法反应良好。为什么呢?科学家们并不总是确定。有时,接......

癌症和糖尿病之间的隐藏机制

早在20世纪20年代,研究人员就发现癌症患者的尿液有甜味。起初,医生们很困惑,但他们很快意识到这是血糖水平升高的结果。“这是我们了解癌症患者的第一件事,”副教授LykkeSylow说。尿液散发出的甜味......

《自然·癌症》:发现了能重塑“癌王”肿瘤微环境的联合疗法

胰腺导管腺癌(PDAC)是个疯狂的“杀手”,PDAC患者的10年生存率约为1%[1]。近20年来,靶向治疗和免疫治疗不断取得进步,改写了很多癌症的治疗范式;遗憾的是,经典腺体亚型对目前的临床治疗方案有......

Nature:探索“破碎染色体”在癌症中的作用

加州大学圣地亚哥分校的科学家们发现,在细胞分裂过程中,破碎的染色体片段在重新排列之前被拴在一起;破坏系链可能有助于防止癌症突变。健康的细胞努力维持我们DNA的完整性,但偶尔,一条染色体会从其他染色体中......