李辉教授PNAS:融合基因组学揭示横纹肌肉瘤细胞起源

基因融合一直被认为是肿瘤独有的特征。弗吉尼亚大学的一组研究人员从干细胞肌肉分化发生的融合基因事件入手，分析了横纹肌肉瘤细胞的起源，这是首次从融合基因的角度来研究肿瘤细胞的起源。

这项研究在线发表于10月31日《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志上，文章的第一作者谢仲秋博士毕业于湖南大学，博士期间从事干细胞转录因子研究，目前在佛吉尼亚大学做博士后。

李辉实验室近几年在融合基因领域取得了很大进展且受邀在Trends in cancer发表综述。李辉博士本科毕业于中国科技大学物理化学专业，在美国凯斯西储大学攻读生物学博士学位，耶鲁大学博士后，目前在弗吉尼亚大学医学院病理系从事肿瘤研究，获得过V Scholarship，Stand Up To Cancer Innovator Award，St. Baldrick’s Scholar，The Ivy Foundation Biomedical Innovation Award，American Cancer Society Research Scholar 等多项荣誉。该课题St. Baldrick’s Scholar资助。

基因融合一直被认为是肿瘤独有的特征。基因融合是指染色体上两个异位的基因嵌合在一起，这种现象一般是由于染色体发生易位、缺失或者倒置造成的，通常在癌症的发生发展扮演着重要的角色，并且可以作为诊断和治疗癌症的靶标。基因融合现象最早在慢性粒细胞白血病中 BCR-ABL基因融合。随着对基因融合的深入研究，科研人员发现，除血液系统肿瘤外，在实体瘤中也存在着基因融合现象，例如横纹肌肉瘤PAX3-FOXO1,前列腺癌中的TMPRSS2-ERG、小细胞肺癌中的EML4-ALK、结直肠癌中的VTI1A-TCF7L2，等基因融合。

横纹肌肉瘤（Rhabdomyosarcoma，RMS）是罕见的一种恶性肿瘤，但在小儿实体瘤中发病率较高，其临床亚型有胚胎型横纹肌肉瘤（ERMS），腺泡型横纹肌肉瘤( ARMS)，在80－85%的ARMS中可检测到特异性染色体易位，两种易位分别形成相应的融合基因PAX3-FKHR(也称为PAX3-FOXO1)或PAX7-FOXO1。

最新这项研究结合生物信息学和干细胞生物学，首次从融合基因的角度来研究肿瘤细胞的起源。在MSCs干细胞骨骼肌分化样品中发现有一个时间点样品和横纹肌肉瘤细胞RH30类似的融合基因组，这种瞬时的融合基因组发生事件提供了肿瘤细胞起源的新线索。