（1）股骨头坏死
股骨头坏死全称股骨头无菌性缺血性坏死，是由于多种原因导致的股骨头局部血运不良，从而引起骨细胞缺血、坏死、骨小梁断裂、股骨头塌陷的一种病变。病程长且致残率高，严重危害人民的健康。 采用经股动脉穿刺微创技术，将基因修饰的自体干细胞超选择性地移植于股骨头区域多条供血动脉内。术后一段时间内，在股骨头局部可出现新生血管，改善股骨头局部血液循环，明显改善局部的缺血症状。同时促进股骨头坏死区成骨细胞的再生，新生的骨细胞填补股骨头的骨缺损部位，逐渐恢复髋关节的生理功能。该治疗方法安全、无痛苦，远期观察疗效确切，尤其适合于股骨头尚未严重变形的早期患者。
优点：
干细胞来源于自体，无交叉感染，也不存在伦理问题
干细胞经过基因修饰后，更有利于转化成成骨细胞；同时转入的基因具有明显的促进血管再生的功能，可有效地改善股骨头局部的血液循环
治疗过程安全、简单。血管介入属于微创治疗，痛苦小，住院时间短（一般需要住院7天左右）
疗效好，早期患者（Ⅰ、Ⅱ期）有效率在90%以上，晚期患者（Ⅲ、Ⅳ期）也可配合常规手术移植干细胞，增加手术疗效
无明显的毒副作用，适合任何年龄的患者
（2）下肢缺血性疾病，包括糖尿病足、动脉血栓闭塞性脉管炎等
糖尿病足、血栓闭塞性脉管炎和动脉硬化闭塞症等，是临床常见的因下肢缺血致残的疾病。以高发病率、高致残率和高死亡率严重影响着人们的生活质量，甚至危及生命。据研究报道，60岁以上人群中慢性下肢动脉硬化缺血的发生率为17-20%，截肢率高达5%。近年来，随着对干细胞研究认识的深入和发展，科学家发现干细胞在缺血的下肢局部可以转化成血管内皮细胞，从而促进局部血管的再生。同时移植到局部的干细胞还可以分泌大量的细胞活性因子营养末梢神经细胞，改善末梢神经的功能。临床研究的结果表明，将干细胞移植到缺血的下肢后，下肢局部出现新生血管，血液循环得到改善，下肢缺血的临床症状得到明显缓解，获得了较好的治疗效果。此方法安全可靠，是一种全新的治疗手段。
优点：
干细胞来源于自体，无交叉感染，不存在伦理问题
基因修饰的干细胞即提供了血管再生的干细胞又提供了血管再生必需的生物活性分子，大大加速了血管再生速度和能力
转染的基因对缺血局部的神经末梢具有营养和修复作用，明显缓解下肢疼痛
治疗的有效率高，毒副作用小，治疗过程安全、方便、有效
（3）肝硬化
自体骨髓干细胞移植治疗肝硬化是最近才在我们国家开展的一项新型的微创介入式手术。远期效果在国外的一些医学网上记载的效果是不错的。我国的自体骨髓干细胞移植治疗肝硬化还没有远期的病例，但是它的近期效果还是非常明显的。原理就是利用干细胞的定向分化的特性使其分化成肝细胞来替换那些已经失去或坏死的肝细胞。从而达到治疗的目的，就像用自己的干细胞为自己换肝一样。手术风险非常小，手术后没有排斥反映，就更不用像肝移植那样以后每月还要花费2000多元的抗排斥的药物来维持了。
但是自体骨髓干细胞移植治疗也是有局限性的如果已经合并肝癌的话就不要去做这个手术了。
（4）自身免疫性疾病，主要包括系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎等
（5）治疗脑血栓和脑出血后遗症
脑血栓形成和脑出血是临床的常见病多发病，致残率、致死率高。随着我国老龄化进程的加速，发病率越来越高。大多数脑血栓和脑出血患者发病后都有不同程度的神经功能损伤症状，如失语、偏瘫、尿便障碍等，如何促进受损脑组织修复和神经功能恢复尤为重要。近年来随着对干细胞研究的深入，由脑血管疾病而产生的种种不可逆性脑损伤的修复与功能再现已经成为现实。很多学者分别应用不同方法将干细胞直接注入缺血性脑中，发现其中部分干细胞可以在脑中成活，并向受损部位迁移，部分增殖分化为损伤缺失的神经细胞。
肝细胞生长因子（HGF）是人体内的一种正常生长因子，是一种多功能生长因子。研究发现HGF具有促进神经细胞的再生和修复神经损伤的作用，同时HGF具有促进缺血部位血管再生的作用。使用HGF基因修饰的干细胞通过微创的手段移植到大脑受损的局部，既提供了神经损伤所需的干细胞又有促进神经细胞增殖和修复神经损伤的细胞因子，同时也促进了缺血局部的血管再生，在多种修复机制的作用下加速了神经功能的恢复。
优点：
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干细胞经过基因修饰后具有三种功能：可以分化成神经细胞；分泌的HGF促进受损的神经细胞再生和修复；HGF促进了缺血部位的血管再生
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血管介入属于微创治疗，痛苦小，仅需治疗一次，全过程安全简单。
