发布时间:2019-04-08 15:32 原文链接: 水稻基因组编辑工具盒再添新成员

  近日,中国农业科学院植物保护研究所周焕斌课题组、周雪平课题组和四川大学生命科学学院林宏辉课题组合作开发了一系列基于Cas9-NG的各种水稻基因组定点编辑工具,并成功用于水稻单基因敲除、多基因敲除、单碱基编辑(碱基对G·C和A·T的互换)以及靶基因转录激活调控。相关研究成果在线发表于《分子植物》(Molecular Plant)。

  来源于化脓链球菌的Cas9核酸酶现已广泛应用于水稻基因组编辑,有效促进了水稻功能基因组学研究和分子育种进程。Cas9在进行基因编辑的过程中需要识别靶DNA序列3’端的保守PAM(前间区序列邻近继续)序列。由于Cas9主要识别NGG PAM序列,这极大限制了基因组范围内的靶DNA序列的选择,尤其是对于特定位点核苷酸进行单碱基编辑时,往往造成无合适PAM可用。扩展PAM识别序列,将有利于扩展水稻基因组编辑应用范围。

  为此,该团队选用Cas9突变体xCas9和Cas9-NG对水稻基因组编辑技术进行了优化和扩展。研究发现,Cas9-NG编辑效果优于xCas9蛋白,并且将识别PAM序列由NGG简化为NG,此外还能识别NAC、NTG、NTT和NCG等PAM序列。

  Cas9-NG在水稻上的成功应用,在一定程度上突破PAM识别序列的限制,将水稻基因组中的可编辑位点增加了8倍,众多之前无法进行碱基编辑的位点如今可进行操作,大大扩展了编辑范围。

  周焕斌指出,该成果对于水稻基因功能解析和分子精准育种具有重要促进作用,加速实现水稻缺陷型基因的修饰矫正,有利于缩短水稻育种进程和延长现有优良品种的应用周期。

  该研究得到了基金委自然科学基金、国家重点研发计划项目和中国农科院创新工程的资助。


相关文章

全球首创!PlumCare与FabricGenomics合作,希腊儿童基因筛查走在前沿

PlumCare与FabricGenomics签署合作协议,共同推动希腊新生儿基因筛查计划2023年12月07日|编辑报道保存以备后用纽约-PlumCare和FabricGenomics周四宣布,它们......

新酶让CRISPR准确靶向绝大多数人类基因

美国杜克大学领导的一个研究团队开发出一种方法,可扩大CRISPR技术的覆盖范围。最初的CRISPR系统只能靶向人类基因组的12.5%,而新方法使CRISPR技术能够准确靶向几乎所有人类基因,使人们通过......

基因组与健康全球联盟与INCF共同打造全球神经科学数据社区

 基因组与健康全球联盟(GA4GH)和国际神经信息学协调中心(INCF)周五宣布,它们已合作建立了被称为神经科学社区的项目,旨在连接全球神经科学和基因组数据。作为近年来由GA4GH创建的几个......

本周要闻:Centogene、ARUP实验室、OxfordNanopore、GenTegra等新动向

Centogene本周表示,已完成与Lifera(沙特阿拉伯公共投资基金(PIF)全资拥有的生物制药公司)组建合资企业的计划。这项交易最初于六月宣布。这家位于利雅得的合资企业将命名为LiferaOmi......

Personalis继续削减成本,裁员65人

Personalis上周在一份监管文件中表示,已经批准裁员多达65名员工,约占其员工总数的20%,预计将在2024年1月底前完成。该公司预计,这一员工减少将为2024财年节省约1,400万美元。与此同......

首个基因测试公司23andMe爆发数据泄露风波,690万用户信息外泄

23andMe于周一披露,10月份的数据泄露影响了总共690万用户档案。在上周五的一份监管文件中,这家消费者基因测试公司表示,它的调查发现0.1%,约14,000个用户账户最初被一名威胁行为者使用从其......

突破性合作!Evonetix与AnalogDevices共建基因合成工厂

Evonetix与模拟器件公司AnalogDevices签署协议,扩大热控酶促DNA合成技术的生产能力 NEWYORK-英国合成生物公司Evonetix周三表示,已与半导体制造商Analog......

基因调控网络深度解读2型糖尿病发展,RFX6基因关键引领早期胰岛细胞缺陷

研究人员通过包括基因表达、遗传风险和功能数据在内的分析,已经开始揭示2型糖尿病(T2D)背后的基因调控网络,强调了转录因子编码基因RFX6的关键作用。《自然》杂志上周一报道称,研究人员依赖于细胞分类的......

抗白叶枯病和细菌性条斑病水稻新种质创制成功

4日,记者从中国农业科学院获悉,该院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队与作物科学研究所等国内科研单位合作,采用基因编辑等方法,快速创制出对白叶枯病和细菌性条斑病具有广谱抗性的水稻新种质,......

一文速览!10月国内外15家生物药企融资超40亿!

据不完全统计,10月份,共有15家国内外创新生物药企完成了融资事件,总金额超40亿人民币。从融资轮次来看,早期融资仍占多数,其中B轮以前融资占比超过75%,仅有2家企业完成B轮融资。从融资金额来看,披......