（1）免疫抑制剂的药物治疗
环磷酰胺是最早用于狼疮肾炎治疗中的一种药物，属于细胞周 期非特异性烷化剂，可抑制B淋巴细胞和T淋巴细胞增殖，抑制淋巴母细胞对抗原的刺激反应，降低机体免疫球蛋白水平。以减轻对肾脏的损伤。
霉酚酸酯是常用于狼疮肾炎中的免疫抑制剂，其可选择性地对肾 系膜细胞和淋巴细胞进行抑制，而对其他细胞几乎无影响，在淋巴细 胞代谢活跃时，霉酚酸酯的作用效果十分显著，因此霉酚酸酯对亢进的体液免疫和细胞免疫有非常强的抑制作用。
硫唑嘌呤是嘌呤类似物，也是免疫抑制剂的一种，通过产生烷基化作用对SH组群进行阻断，对T淋巴细胞产生作用，抑制细胞增生，见效较慢，疗效较为稳定。
他克莫司实验室命名FK506，是现如今广泛用于临床的免疫抑制剂，对狼疮肾炎有着显著的干预作用，用于环磷酰胺或者霉酚酸酯 治疗失败的难治性狼疮肾炎也往往可收到令人满意的疗效。
咪唑立宾是新型的免疫抑制药物，较硫唑嘌呤更加安全，有研究显示，硫唑嘌呤有肝脏毒性和骨髓抑制作用，而咪唑立宾则相对安全，其用于狼疮肾炎的治疗安全性甚至高于他克莫司和霉酚酸酯。其可对难治性狼疮肾炎患者生效，对一般免疫抑制剂和糖皮质激素耐药的患者可以考虑采用咪唑立宾治疗。
（2）免疫净化
从狼疮性肾炎的发病机制来看，清除过多的自身抗体能控制疾病的发展，近年来有许多学者进行了相关研究 。免疫吸附是在血浆置换的基础上发展起来的一种血浆净化方法，能够选择性的去除 ds-DNA 抗体、IgG、抗心磷脂抗体。免疫吸附虽能在一定程度上对机体的免疫功能有一定调节作用，但不能有效阻断免疫复合物的生成。
（3）干细胞移植
有研究认为系统性红斑狼疮可能是造血干细胞异常所致疾病，一些学者尝试以自身造血干细胞移植 (ASCT) 治疗重症系统性红斑狼疮患者。有研究表明，通过运用免疫抑制剂对患者的造血细胞和免疫系统进行深层次的清除，能够重建正常的免疫系统，取得治疗效果。
