浙江大学生命科学学院的研究团队最近在Nature Communications杂志上发表了可变剪接研究的新成果,可以帮助人们进一步了解剪接异构体的惊人多样性。文章的通讯作者是浙江大学生命科学学院的金勇丰(Yongfeng Jin)教授。
可变剪接能从单个基因组位点产生数量惊人的异构体,果蝇Dscam1和脊椎动物Pcdhs是两个经典范例。在黑腹果蝇中Dscam1通过互斥剪接编码38,016个不同的异构体,而脊椎动物Pcdhs通过可变启动子生成异构体多样性。
研究人员揭示了螯肢动物中的一个Dscam基因家族,这些Dscam基因比较短而且具有串联排列的5′表达盒 (cassettes)。这些sDscam通过可变启动子和可变剪接这两种途径产生了大量的异构体。进一步研究显示,sDscam与果蝇Dscam1有很 高的序列相似性,而且sDscam的组织结构与脊椎动物Pcdhs的5′可变区非常相像。这些发现对于理解果蝇Dscam1和脊椎动物Pcdhs的功能相 似性有重要的意义。
前不久,一个跨国团队首次对可变剪接进行了大规模的系统性研究。他们在Cell杂志上发表文章指出,同一个基因编码 的蛋白质异构体常常承担着截然不同的作用,不论它们结构上有多么相似。南方医科大学第一附属医院(南方医院)的Xinping Yang博士是这篇文章的共同第一作者。这一发现将显著影响我们的生物学认识以及未来的研究方向。研究人员认为,我们有必要分别研究各个蛋白质异构体的正 常功能,阐明它们在疾病中扮演的不同角色。
多伦多大学的研究人员此前在Science杂志上发表文章指出,我们人类成为地球上最聪明的动物得益于一个关键性分子事 件。在脊椎动物中,大脑的大小和复杂程度存在着很大的差异。举例来说,人类和青蛙已经独立演化了三亿五千万年,其大脑功能已经有天壤之别。那么这巨大的差 距是如何形成的呢?研究显示,人类和青蛙拥有的基因数相当接近,它们的物种差异主要来自于可变剪接(AS)。PTBP1蛋白的可变剪接控制着神经元的生 成,帮助哺乳动物进化出更大更复杂的大脑。
脊髓性肌萎缩症(SMA)患者的运动神经元缺乏生存所需的一种蛋白,这种疾病一直是种不治之症。罗氏制药(pRED)、 PTC Therapeutics、SMA基金会、南加州大学和哈佛大学的研究者们,合作开发了一个可以口服的小分子药物,这种药物能够改变特定mRNA的剪接, 在运动神经元中恢复关键蛋白的合成。他们用这种药物对SMA小鼠模型进行治疗,成功改善了小鼠的肌肉量、运动机能和生存情况。这一令人兴奋的成果发表在本 期的Science杂志上。
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三维基因组互作与表观遗传修饰是基因表达调控的重要因素,其动态变化与细胞生长发育及癌症等疾病的发生发展密切相关。解析染色质在活细胞内的时空动态,是理解基因调控机制的重要科学问题。现有基于CRISPR-C......
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