发布时间:2024-06-11 14:57 原文链接: 清华大学仪器共享平台Harmony数据分析工作站

仪器名称:Harmony数据分析工作站
仪器编号:A23000084
产地:英国
生产厂家:PerkinElmer
型号:Operetta CLS
出厂日期:20230928
购置日期:20230928


所属单位:医研院>生物医学测试中心>细胞生物学平台>细胞平台光镜机组
放置地点:医学科学楼C119
固定电话:010-62799145
固定手机:
固定email:
联系人:汪晶晶(010-62799145,18514213047,sapphireking@mail.tsinghua.edu.cn)
孙悦(010-62799145,13121649797,sunyue@mail.tsinghua.edu.cn)
分类标签:图像处理 高内涵分析 数据分析 Harmony
技术指标:
  1. 38个预制分析模块:如细胞计数或核计数、活/死细胞计数、质膜标志物定量、胞质向核转位、胞质向膜转位、Spot分析、有丝分裂指数、细胞周期分类、神经细胞分析、脂滴形成分析、亚细胞结构分割、表型分析、神经生长、在线质量控制、纹理分析、3D微组织分析、细胞轨迹追踪等;

  2. 纹理分析功能:Kernel,Region,Indensity,Unnormalized等;

  3. 机器自学习模块:用户教导软件识别不同的细胞类群或区域,创建自定义的分析算法,可自学习细胞大小、形态、亚细胞结构,组织形态结构,信号分布差等参数;

  4. Star分析功能:由软件对图像进行自主分析,无需任何人工干预,帮助使用者找到最合适的分析方法。形态学参数不低于200个;

  5. 预设分析方案数据形式:可针对每孔数据导出统计学数据,细胞实验可导出每一单细胞数据,以便获取细胞异质性信息;

  6. 参数优化功能:可以手动优化分割参数,也可以由软件自动给出最佳参数(Turning优化法);

  7. 支持多种数据类型的导出:除可分析并导出整孔数据,同样可以给出单视野,单细胞的各种参数。

知名用户:暂无
技术团队:

汪晶晶 工程师,多年从事光学显微成像工作。

技术专长:

1.激光共聚焦显微镜成像技术

2.组织全景扫描成像技术

3.荧光光镊技术

4.活细胞显微成像技术

孙悦 工程师,细胞生物平台光镜机组负责人,多年从事光学显微成像工作。

技术专长:

1. 激光共聚焦显微镜成像技术

2.组织全景扫描成像技术

3.受激发射损耗超高分辨显微成像技术

4.荧光寿命成像技术

功能特色:
  1. 丰富的3D可视化功能,提供最大光强重建视图,XYZ多层切正交视图,多种3D重建渲染视图,任意角度层切视图、多层细胞定位视图。

  2. 各种视图下的3D数据分析:通过智能视窗功能对感兴趣区域确认分析参数,通过已确认的分析参数进行批量图像分析。

  3. 可计算细胞体积、3D表面积、3D最大截面积、3D球形程度 、3D投影面积、3D球形内径、3D 球厚度及高度等参数。

  4. 可计算3D位置参数:软件可批量计算3D球彼此距离、找到最近距离的3D球以及3D球与孔边缘距离、细胞在球体内的XYZ坐标参数以及群组细胞的3D共定位比例等。

  5. 多种3D微组织分区分析方式:可计算3D囊肿部及空腔区体积、3D肝组织内部空泡及肝实质区、3D 球体中阳性细胞到某球体边缘或半球边缘距离等,可批量导出单细胞数据、球体数据及整孔数据。

  6. 3D细胞纹理功能:可提供不少于6种的3D纹理学指标计算方式,提取纹理学参数重建的3D图像,批量导出单细胞数据、球体数据及整孔数据。

样品要求:

无。


预约说明:

  1. 所有大型仪器均可通过点击“仪器设备”,查看仪器设备联系人信息,可通过电话及邮件联系。

  2. 预约需至少提前12小时,预约后如有特殊原因无法按时使用仪器,请提前18小时取消预约。若超过取消时限或未取消预约的,按预约机时收费。

  3. 仪器未经预约不得私自使用。预约时间的最小单位为半小时,不足半小时或超过十分钟以上(含十分钟)按半小时记。本人预约本人使用,不得借用他人账号预约使用仪器。若发现该情况将取消借出人账号及权限。

  4. 实验结束请通知平台工作人员实验结束,填写实验登记并上交样品登记表。清理自带的仪器设备。仪器使用记录需如实填写,若出现故障在故障排除后要进行登记。

  5. 未经过培训与考核的同学可以使用自己的账号预约工作时间的辅助测试(周一至周五8:30-17:00),备注请注明:姓名、课题组、手机号、实验内容。第一次做实验的同学请尽量提前联系工作人员讨论实验细节,电话:62799145。

项目名称计价单位费用类别价格备注
测试费元/小时自主上机机时费240.0


相关文章

西安医学院姜超团队的论文被撤回涉数据分析存在不足

肝细胞癌(HCC)对人类健康构成严重威胁。ADCY2基因多态性可能与HCC易感性有关。因此,该研究探索了ADCY2基因多态性是否与中国汉族人群的HCC风险相关。2021年9月1日,西安医学院姜超团队在......

我国科学家开发高效基因组序列分析工具

类的疾病易感性和生理特征等常见性状的差异,往往由DNA序列变化造成,这些DNA片段缺失、增加、异位等变化被统称为遗传变异。全基因组关联研究(Genome-WideAssociationStudy,GW......

百奥智汇推出一站式单细胞数据分析软件OmniAnalyzer

2021年8月3日,百奥智汇发布首款一站式单细胞数据分析软件OmniAnalyzer。该软件内置多种算法,包含从原始数据处理、批次效应校正到细胞分群、细胞类型识别、差异表达分析、轨迹推断等全套数据分析......

妇幼保健检验医学论坛第二日——数据分析助科研曲径通幽

分析测试百科网讯2019年10月26日,第四届北京妇幼保健检验医学论坛第二日会议如期举行。国内外著名检验医学和临床医学专家学者近200人参加了此次会议,分析测试百科网作为此次会议的支持媒体,为您全程跟......

PaulBonnington、KimbalMarriott教授荣获安捷伦“思想领袖奖”

2019年2月18日,安捷伦科技公司(纽约证交所:A)日前宣布授予PaulBonnington和KimbalMarriott“安捷伦思想领袖奖”,以支持他们在数据分析、机器学习、人工智能和信息可视化方......

骐骥联手Waters发布QiMetA软件为组学提供场景化分析利器

分析测试百科网讯2018年9月9日,由北京骐骥生物技术有限公司和沃特世科技有限公司主办的QiMetA软件全球发布会在北京举办。来自临床、科研和投资等多领域的50余人参加了此次活动。活动现场主持人:北京......

高通量测序数据分析

1.是不是一定要用大型计算机?除了序列拼接组装以外,其它分析不是一定要大型计算机,在普通的PC上也可以进行一些处理,当然,买一台或几台高性能的工作站电脑,能显著加快数据处理的速度。2.是不是一定要用L......

23GENEBANK正式发布GBGIAS基因组数据分析一体化服务平台

23GENEBANK的基因组数据分析系统,从GB-CHIP,GB-WGS-REPORT,GB-TARGRUG等一路走来,历经15项核心技术突破,完成了从基因芯片到二代测序,从定制靶向捕获测序到全基因组......

欧盟发布2016年食品和饲料中化学污染物数据分析报告

2017年5月5日,欧洲食品安全局发布2016年度食品和饲料中化学污染物数据分析结果报告。总体来说,从29个国家或地区收集到12.5万个样品,经检测共得到159种化学污染物的83.72万个结果数据。该......

权威学者Nature子刊公布数据分析新方法

生物数据大爆炸带来了无限可能,我们能从浩瀚的数据库中寻找到帮助临床医师们做出更正确判断,进行个体化医疗的许多信息,但是从设想走到现实还有很长的路要做。11月7日的NatureGenetics杂志公布了......