发布时间:2012-07-11 00:00 原文链接: 清华大学施一公最新JBC文章

  来自清华大学生科院的研究人员发表了题为“Crystal structure of the yeast metacaspase Yca1”的文章,报道了一种重要的蛋白酶:Yca1 metacaspase的晶体结构(分辨率为1.7 angstrom),并由此分析了这种酶的作用特点。相关成果公布在The Journal of Biological Chemistry杂志上。

  这项研究由清华大学施一公研究组完成,施一公教授为通讯作者,这是这一研究组在结构生物学研究领域取得了又一重要成果。

  在哺乳动物中,凋亡被一组蛋白酶caspases定向激活,导致特异性底物断裂,触发细胞死亡。而在酵母中,环境损伤、细胞内缺陷、预凋亡基因的异源表达诱导,具有典型凋亡特征的酵母细胞死亡,与一种caspase同系物:metacaspase紧密相关。研究显示,如果缺乏这种酶,那么就可以阻碍不同因素引起的酵母细胞死亡。

  在芽殖酵母Saccharomyces cerevisiae中发现的唯一一个I型metacaspase,称为酵母caspase-1(YCA1),由基因YCA1 或MCA1 (Yor197w)编码,是一种clan CD半胱氨酸蛋白酶。科学家们发现,虽然酵母是一种单细胞真核生物,但是也有细胞死亡进程,这种进程让人联想到细胞凋亡。

  目前的研究显示Yca1在这些凋亡进程中扮演了重要的角色,不过其结构和功能依然是一个未解之谜。为了解开这个谜题,在这项研究中,研究人员揭示了 Yca1 metacaspase的晶体结构(分辨率为1.7 angstrom),并从中证实了其与caspase相似的折叠。

  但是研究人员也通过将其与典型的半胱氨酸比对,发现Yca1可以在溶液和晶体结构中保持单体,而典型的半胱氨酸则包含有一个6β链。而Yca1中一对额外的反平行β链能形成带有6个caspase常见β链的连续β折叠,阻止可能的二聚体形成。

  除此之外,研究人员还发现了一个与之前认知不同的结构——之前的研究曾表明,Yca1在酵母中有一个自我催化处理的过程,细菌中的过表达也会导致Yca1自动分解成两部分。而研究则发现了两个自我催化的过程,Yca1的蛋白活性会通过钙离子极大的得以促进。

  这些研究数据表明,Yca1是一种钙离子激活的半胱氨酸蛋白酶,能在酵母胁迫应答过程中,消化特殊的底物。

  这项研究成果是施一公教授研究组继3月份解析大肠杆菌谷氨酸:γ-氨基丁酸(GABA)反向转运蛋白 (GadC) 的晶体结构后的又一重要成果。

相关文章

AI首次“从零开始”设计蛋白酶

在新一期《科学》期刊上,诺贝尔奖得主、美国华盛顿大学的大卫·贝克及其团队发表了一篇突破性研究论文:他们首次利用人工智能(AI)技术,从零开始设计了具有复杂活性位点的丝氨酸水解酶。这项成就标志着酶工程领......

“透视”晶体内部结构,为开发新光子材料开辟新路

美国纽约大学研究人员开发了一项创新技术。该技术使人能够以前所未有的方式窥视晶体结构,仿佛赋予人眼X射线般的超能力。这项名为“晶莹剔透法”的新技术,将透明粒子、显微镜与激光技术相结合,使科学家能够看到构......

我国科学家发现gasdermin蛋白不依赖于蛋白酶裂解的激活机制

细胞焦亡(pyroptosis)是一种由gasdermin(GSDM)蛋白家族介导的程序性细胞死亡,在机体抵御病原体感染、清除异常或有害细胞等过程中发挥着重要作用。GSDM是一类在进化过程中得到保护的......

细菌效应蛋白拮抗宿主细胞焦亡通路机理获揭示

细胞焦亡作为机体重要的天然免疫反应,在拮抗和清除病原菌感染中发挥关键作用。当革兰氏阴性菌侵入宿主细胞后,其外膜的重要病原分子模式LPS(脂多糖,也称内毒素)会被宿主细胞内的天然免疫受体caspase-......

科学家首次发现促进肌动蛋白成熟的蛋白酶

肌动蛋白参与肌肉收缩、细胞分裂和细胞运动等重要生理过程,但是肌动蛋白如何从非活性的前体被加工成为活性状态尚待揭示。荷兰癌症研究所的科研人员发现了一种调控肌动蛋白成熟的蛋白酶。相关成果在《Science......

广生堂实现国产新冠口服药再突破!3CL蛋白酶抑制剂获批

9月25日,广生堂(30.57+1.02%,诊股)发布公告称控股子公司福建广生中霖生物科技有限公司(简称“广生中霖”)于2022年9月23日收到国家药品监督管理局下发的关于口服小分子广谱抗新型冠状病毒......

重要化学数据库近千个晶体结构可能来自论文工厂

英国剑桥晶体学数据中心(CCDC)收录的近千个晶体结构的数据条目可能是论文工厂的产物,机构已将其标记为可疑条目,并对其进行审查。CCDC是化学家寻求晶体结构信息的一个必查资源库,存放了结晶学领域许多期......

免疫源性细胞死亡机制研究获进展

近日,中山大学药学院教授邹滔滔课题组与广西师范大学教授梁宏课题组合作,在免疫源性细胞死亡(immunogeniccelldeath,ICD)机制研究获进展。相关研究发表于J.Am.Chem.Soc.。......

Science:湘雅三医院团队发现热射病的重要致病机理

热射病(Heatstroke,又称“重度中暑”)是一种由热应激引起的、危及生命的疾病,与循环衰竭和多器官功能障碍有关。随着全球气候变暖,热射病引起的死亡人数逐年增加,但其致病机制尚不清楚。近日,中南大......

吃半个菠萝嘴巴肿胀出血上热搜盐水泡到底管不管用?

近日,安徽合肥一个女大学生和室友,在水果店买了两个菠萝,没泡盐水就吃了。小宋吃了半个后,发现自己口腔粘膜处出现了许多出血点,嘴唇和舌头有肿胀的现象,并且恶心想吐,室友却没出现什么异常。眼下正是吃菠萝的......