2016年7月11日,清华大学生命科学学院陈柱成课题组在《Nature Structural & Molecular Biology》在线发表题为《染色质重塑因子SWI/SNF基态的结构》(Structure of chromatin remodeler Swi2/Snf2 in the resting state)的研究论文,阐述了一类重要的染色质重塑蛋白的结构及调控机制。
在真核生物细胞内,DNA缠绕着组蛋白八聚体形染色质的基本组成单位:核小体。染色质在包装遗传物质等方面发挥着重要作用。然而染色质的高级结构对细胞内的 一些生理过程,如DNA复制、转录、修复等产生了巨大的障碍。SWI/SNF家族染色质重塑复合物是一类多功能的蛋白机器,它通过利用ATP水解的能量调 控染色质的结构。这类复合物从酵母到人都较为保守,但目前为止人们对其发挥功能的分子机理尚不了解。
该 研究通过晶体学的方法解析了第一个高分辨的SWI/SNF家族复合物蛋白Snf2的结构,衍射分辨率达到2.3埃。Snf2的结构说明了它的自抑制机理。Snf2蛋白中的两个核心RecA 结构域通过疏水界面相互作用,从而使蛋白处于抑制状态,其水解ATP的速率很低。该研究同时鉴定出几个保守的DNA结合位点。这些DNA结合位点都朝向溶 剂区。这个结果明白Snf2蛋白时刻准备着与底物结合。当Snf2其底物核小体时,两个RecA 结构域之间发生较大的构像变化,蛋白被激活,ATP水解能力提高了将近5000倍。以此为基础,文中提出了Snf2结合DNA的模型,为人们理解染色质重 塑复合物这一大类蛋白的工作机理提供了很好的基础。
清 华大学生命科学学院陈柱成研究员为本文的通讯作者;清华大学生命科学学院2013级博士研究生夏显和2012级博士研究生刘晓玉为本文的共同第一作者。清 华大学生命科学学院方显杨研究员和博士研究生李同也参与了部分工作。上海同步辐射光源BL17U(SSRF)为数据收集提供了及时有效的支持。
记者近日获悉,中国专家团队首次揭示了一种在哺乳动物细胞中控制染色质分区以及近着丝粒异染色质形成、维持和稳态遗传的新机制。北京时间15日深夜,由华东师范大学翁杰敏教授团队与中国科学院生物化学与细胞生物学......
华东师范大学教授翁杰敏团队与中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)研究员陈德桂团队合作,揭示了哺乳动物细胞近着丝粒异染色质形成、维持和稳定遗传的新机制,对异染色质调控机制有了......
染色质是真核细胞中DNA包装和基因表达调控的核心结构。核小体作为染色质的基本单位,与各种蛋白质的相互作用决定了基因表达的精确调控。理解核小体结合蛋白的结构特征和相互作用机制,对揭示表观遗传调控、疾病发......
染色质是真核细胞中DNA包装和基因表达调控的核心结构。核小体作为染色质的基本单位,与各种蛋白质的相互作用决定了基因表达的精确调控。理解核小体结合蛋白的结构特征和相互作用机制,对揭示表观遗传调控、疾病发......
组蛋白乙酰化是重要的表观遗传修饰。组蛋白乙酰转移酶在染色质结构、基因转录调控和DNA损伤修复过程中发挥重要作用。通常,表观遗传调控中的大部分组蛋白修饰酶具有位点特异性,即一种修饰酶只对组蛋白尾部的某个......
组蛋白乙酰化是重要的表观遗传修饰。组蛋白乙酰转移酶在染色质结构、基因转录调控和DNA损伤修复过程中发挥重要作用。通常,表观遗传调控中的大部分组蛋白修饰酶具有位点特异性,即一种修饰酶只对组蛋白尾部的某个......
中国科学院生物物理研究所朱平研究组与中国科学院物理研究所朱洪涛、陆颖研究组合作,揭示了酵母中组蛋白乙酰转移酶NuA4对核小体进行乙酰化的动态机制。相关论文3月18日发表于美国《国家科学院院刊》(PNA......
法国斯特拉斯堡大学AdamBen-Shem团队近期取得重要工作进展。他们报道了人TIP60-C组蛋白交换和乙酰转移酶复合物的结构。相关论文于2024年9月11日发表于国际顶尖学术期刊《自然》杂志上。据......
中国科学院生物物理研究所朱平研究组和李国红研究组合作,揭示了连接组蛋白H5介导的核小体结合和染色质折叠和高级结构形成机制。相关论文近期发表于《细胞研究》。在真核生物中,基因组DNA被分层包装到细胞核内......
9月13日,中国科学院生物物理研究所朱平研究组在国际期刊《细胞报告》(CellReports)在线发表论文,利用冷冻电子断层三维成像方法,揭示了体外组装和体内染色质纤维一种普遍存在的双螺旋折叠模式。在......