图片.png

  结肠癌是常见的发生于结肠部位的消化道恶性肿瘤,发病率占胃肠道肿瘤的第3位。约60%患者初次诊断时已发展为局部晚期(II/III期),即使手术顺利切除后仍有20-30%的复发风险。因此,对II/III期结肠癌患者的精确风险分层是术后治疗策略的关键所在。目前的分期方法在预测II/III期结肠癌患者的复发风险方面有一定的局限。环状RNA(circRNA)是一种新型的非编码RNA,伴随高通量测序技术的发展和进步,越来越多的环状RNA被证实参与多种生物学功能,影响肿瘤的发生发展。同时,由于其特殊的封闭环状结构,不易被核酸外切酶降解,具有成为肿瘤患者生存相关标记物的潜能。

  2019年9月2日,中山大学附属肿瘤医院徐瑞华团队在EMBO Molecular Medicine杂志上发表了题为“A Circrna Signature Predicts Postoperative Recurrence in Stage II/III Colon Cancer”的研究工作,该研究揭示了环状RNA在预测II/III期结肠癌患者复发风险预测中的重要作用,为结肠癌术后的精准治疗提供了更好的治疗策略。

  该研究团队采用高通量转录组测序技术与LASSO筛选框架的机器学习方法相结合。通过比较20例(复发和未复发各10例)II/III期结肠癌组织标本,分析并鉴定出差异表达的100个环状RNA,并应用qRT-PCR方法在96例(复发和未复发各48例)验证出22个显着高表达的环状RNA。该团队进一步结合列线图(Nomogram)数据挖掘方法,利用大样本的II/III期结肠癌患者队列(训练集,249例;内部验证集,122例;外部验证集,180例),最终构建出一组基于4个环状RNA(hsa_circ_0122319、hsa_circ_0008039、hsa_circ_0079480和hsa_circ_0087391)的分子指标模型(cirScore)。该分子指标模型预测II/III期结肠癌复发风险的准确性显着高于传统的临床病理分期。研究首次揭示了一组由环状RNA组成的分子指标在中期结肠癌复发风险预测中的重要作用,同时开创了基于机器学习的结肠癌分子标记物筛选新方法,为结肠癌的精准诊疗提供了新的思路和新的方法。


相关文章

MolecularCancer:环状RNA通过经典信号通路抑制肿瘤进展

环状RNA(circRNAs)以单链和共价闭环结构为特征,通常由preRNAs的外显子反向剪接而成。以前,circRNA被认为是低丰度剪接错误的副产品。然而,通过深入的RNA测序和生物信息学,circ......

脑卒中多基因遗传风险评分模型建立

鲁向锋教授(中)在指导学生进行科研工作。中国医学科学院阜外医院供图我国居民的第一位死亡原因、患病人群日益年轻化、70%患者均有不同程度残疾、二次复发率高达40%……脑卒中像一个“恶魔”贪婪地“吮吸”着......

NatRevGenetics|环状RNA的合成与功能

环状RNA(circularRNA,circRNA)是一种新兴的内源性非编码RNA(noncodingRNA,ncRNA),是继microRNA(miRNA)以及longnoncodingRNA(In......

研究人员揭示环状RNA或可成为阿尔兹海默症的临床新指标

2019年10月7日,来自美国华盛顿大学医学院的CarlosCruchaga教授研究团队在NatureNeuroscience上在线发表题为“AnatlasofcorticalcircularRNAe......

NatNeurosci∣环状RNA或可成为阿尔兹海默症的临床新指标

阿尔茨海默症(Alzheimer’sdisease,AD)是世界卫生组织公认的全球公共卫生重点。AD是一种由多种原因引起的、不可逆转的神经退行性疾病,是痴呆中最常见的一种类型,主要表现为进行性记忆丧失......

环状RNA在预测II/III期结肠癌患者复发风险预测的重要作用

结肠癌是常见的发生于结肠部位的消化道恶性肿瘤,发病率占胃肠道肿瘤的第3位。约60%患者初次诊断时已发展为局部晚期(II/III期),即使手术顺利切除后仍有20-30%的复发风险。因此,对II/III期......

环状RNA在预测II/III期结肠癌患者复发风险预测的重要作用

结肠癌是常见的发生于结肠部位的消化道恶性肿瘤,发病率占胃肠道肿瘤的第3位。约60%患者初次诊断时已发展为局部晚期(II/III期),即使手术顺利切除后仍有20-30%的复发风险。因此,对II/III期......

环状RNA在预测II/III期结肠癌患者复发风险预测的重要作用

结肠癌是常见的发生于结肠部位的消化道恶性肿瘤,发病率占胃肠道肿瘤的第3位。约60%患者初次诊断时已发展为局部晚期(II/III期),即使手术顺利切除后仍有20-30%的复发风险。因此,对II/III期......

中外学者Nature子刊发文:环状RNA翻译出抑癌蛋白质!

由中山大学、复旦大学、暨南大学、美国安德森癌症中心等多家单位发表一项发现:使用翻译组测序技术,在脑胶质瘤细胞中发现了数千种可能翻译的环状RNA(circRNA),其中320个有差异表达现象,并具体验证......

又是魔剪CRISPR!首次揭秘“环状RNA”与大脑功能有关

近年来,环状RNA(CircularRNAs,circRNAs)越来越受到科学界的关注,但它们在活体内的功能一直是一个谜。8月10日,发表在Science杂志上题为“Lossofamammalianc......