环状RNA研究方法（一）

至2015起云序生物已经完成10000+例环状RNA全转录组测序服务，涵盖了50+疾病，20+物种，帮助众多客户在环状RNA分子的研究中取得突破性进展。客户发表的环状RNA文章高达20篇以上。此外云序生物还提供环状RNA机制研究手段，rip&RNA pull down技术，帮助客户冲刺高分机制文章。本周小编来讲讲云序生物客户利用全转录组测序如何又快速发表了一篇5分以上的文章（前期讲述了好多篇环状RNA测序直接发表5分的文章的案例，感兴趣的伙伴可以点击往期的链接）。 

研究背景：

作为非编码分子的重要成员，环状RNA分子在多种疾病生理学过程当中都扮演着重要的角色。这一次对于环状RNA分子的研究聚焦在了电离辐射对细胞的影响。说起电离辐射，其实在我们的生活中微量辐射几乎无处不在，土壤中有天然辐射源氡气，体检的时候使用的X射线机等等。要知道肠上皮细胞对（intestinal epithelium）电离放射是高度敏感的，腹部或者盆腔肿瘤病人在接受放放射治疗后都会引起放射毒性造成的肠道损伤。那么问题来了，放射引起的肠道损伤较正常的肠道细胞，环状RNA分子这一次是如何变化的？差异性的环状分子功能如何？且听小编慢慢的为您解读这篇文章。

实验设计：

整个实验设计为对照组和照射处理组（实验组），每组三个生物学重复。其中对照组为正常野生型小鼠，实验组小鼠使用Cs137gamma光放射仪以恒定计量进行照射，3.5天后取两组小鼠空肠组织提取RNA。

图1. 技术路线图

研究内容：

1. 环状RNA表达如何？差异表达的有哪些呢？

高质量的测序服务，专业的生信分析，云序生物让环状研究变得容易，这是一条广告。高质量的测序技术对每一个环状的表达都做到精准检测，生信分析可视化从宏观角度（染色体分布、成环位置）给出了所有对于放射处理后在小鼠空肠组织当中环状RNA分子的表达情况。

图2. 放射处理后小鼠空肠组织环状RNA表达情况