应用免疫学方法测定检测血清或体液中真菌的循环抗原 (由真菌释放的部分致病抗原或特异产物等 )对某些深部真菌病的早期诊断具有重要价值。念珠菌感染患者的肝、脾组织的活检标本中抗原检出率高于血清 ,另外 ,测定 (1 -3) -β-Ｄ葡萄糖 (念球菌胞壁的一个成分 )的血中的浓度 ,可作为念珠菌早期的诊断指标 ,其浓度与症状的消长成正比。此外 ,可用ＥＬＩＳＡ法检测曲霉菌的糖蛋白抗原 ,灵敏度可达 1ｎｇ.ｍＬ -1,如含量达 100ｎｇ .ｍＬ -1,可诊断侵袭性曲霉菌病。近年来 ,以特异性基因片段经聚合酶链反应 (ＰＣＲ)扩增可简化测定手段 ,虽ＰＣＲ技术在临床应用上有异议 ,但因真菌生长缓慢 ,难以培养 ,该技术对真菌病检测不失为一个好方法。