翻译与代谢的相互调控是细胞可塑性的基础。胚胎早期发育可分为着床前和着床后两个阶段,对应体外培养时两种稳定且可互相转变的多能性干细胞状态:原始态(Naïve)与始发态(Primed)。早期发育与多能干细胞命运在表观遗传、转录、代谢等层次已有研究,而在翻译阶段,此前主要聚焦于已知蛋白的翻译,基因组中是否存在未被挖掘的“暗物质蛋白”调控代谢与早期发育尚不明确。

  基因组中大量“非编码区”曾被视作 “暗物质”。近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院科研团队,揭示了PLUM新蛋白掌控着干细胞命运的“开关”, 是迄今为止少数能实现“决定性诱导”的细胞因子之一。

  团队利用核糖体测序技术发现,在Primed多能干细胞中,Lin28b的5’UTR区特异性翻译产生微蛋白PLUM,且呈胞质点状聚集分布。研究通过构建基因敲除模型证实,PLUM缺失会使Primed多能干细胞以近100%效率转变为Naïve状态,导致胚胎着床明显受损,这表明PLUM对多能干细胞命运具有决定性作用。

  机制研究表明,PLUM与RNA结合蛋白L1td1直接互作,调控其胞质凝聚体和相分离,进而改变其结合的下游RNA,使Tfcp2l1、Zfp42等Naïve多能性基因的RNA稳定性提高,进而激活氧化磷酸化基因表达。同时,PLUM缺失也破坏了细胞中负责mRNA降解的P颗粒,其中富集编码线粒体复合物I和V的基因mRNA,提示PLUM可能通过P颗粒组装调控线粒体功能。

  研究进一步证明,PLUM缺失会导致小鼠胚胎着床失败,这说明它在生命最初阶段扮演着不可或缺的角色。同时,机制研究将“RNA调控—相分离—线粒体代谢”三者串联,揭示了细胞质事件如何反向决定细胞核的多能性状态。该研究为理解多能干细胞命运决定提供了新视角,也为优化多能干细胞状态、改善辅助生殖胚胎质量提供了新的理论基础与潜在干预靶点。

  相关研究成果发表在《自然-通讯》(Nature Communications)上。研究工作得到国家自然科学基金委员会等的支持。

研究发现新“暗物质蛋白”作为胚胎发育命运的细胞质“开关”

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