第七届中国蛋白质组学大会暨第三届国际论坛大会报告

发布时间：2011-04-19 18:05 原文链接：第七届中国蛋白质组学大会暨第三届国际论坛大会报告

第七届中国蛋白质组学大会暨第三届国际蛋白质组学论坛圆满闭幕

　　2011年4月15～17日，第七届中国蛋白质组学大会暨第三届国际蛋白质组学论坛在美丽的杭州成功召开。本次会议由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)、国际蛋白质组学论坛(IFP)主办，北京蛋白质组研究中心(BPRC)、国际蛋白质组学论坛(IFP)、浙江大学(ZJU)和洛杉矶加州大学(UCLA)承办，会议主题是“蛋白质组学与转化医学”。来自世界各地的蛋白质组学著名专家学者汇聚一堂，分别介绍自己在该领域的研究内容、进展和成果，共同探讨蛋白质组学现状、前沿技术及发展趋势。

报告专家：中华人民共和国卫生部部长陈竺院士

报告题目：系统生物学：东西方医学汇聚

　　陈部长比较中西医的差异：中医是整体论，强调各个器官、组织间的相互作用；西医是还原论，是从人体到器官、细胞、分子…… 山水、植物、动物，天、地、人，相互作用，和谐相处。中医“八纲”（阴阳、表里、寒热、虚实）是辩证法；“君臣佐使”复方则是系统论。作为我国人类基因组计划领衔人之一，陈部长发现，“因人施治”吻合药物基因组学的个体化治疗理念，“天人合一”与环境基因组学呼应……进入“后基因组”时代，研究生物系统中成分构成及其相互作用规律的系统生物学正在升温，其整体性、系统性方法与中医共通之处更多。

　　现代医学的教育背景，并不妨碍陈部长从传统医学中寻找灵感。他把中药砒霜（三氧化二砷）与维甲酸结合治疗APL，诱导恶性白血病细胞消亡或转好，目前52个临床病例处于无病生存状态——其间，中医药和中国哲学的复方、以毒攻毒、祛邪扶正、好坏转化等智慧处处闪光。现代医学开始讲求系统论，现代中医药研究也已深入基因层面。我国在推进中医药现代化时，要抓住当前系统生物学的上升时机， “中西医结合，也许一些最难医治的疾病也能治愈。”

报告专家：美国加州大学洛杉矶分校(UCLA)国家心肺和血液研究所(NHLBI)蛋白质组学中心主任John R.Yates 教授

报告题目：运用质谱技术了解蛋白质错误折叠症

　　了解生物过程，要确定细胞中表达的蛋白以及它们的修改和过程动力学。几种主要技术，特别是质谱技术，已从大规模生物基因组测序中获益。这些努力获得的测序数据可以被用于解释蛋白质的质谱数据，然后就能通过实验进行高速、高通量的蛋白质分析。多级分离以及质谱技术的发展，提高了蛋白质鉴定实验的通量，这也改善了蛋白复合物及更复杂蛋白质混合物的分析。定量质谱技术可以用于研究生物过程，如蛋白与蛋白指间的相互作用、发育或者路径上基因变异的影响。John R.Yates 教授介绍了他的最新研究，有关囊性纤维化运输调节器(Δ508)通过折叠路径时，功能突变形式丢失的问题，通过蛋白质相互作用的研究，John R.Yates 教授开始明白排出或破坏中最关键的调节路径的相互作用。John R.Yates 教授又讲到了他的另外一个研究是用细胞毒素的功能增加去鉴定蛋白活动，这对于清除聚合蛋白或许很重要。

报告专家：浙江大学药学院郑树森院士

报告题目：肝癌与蛋白质组学

　　原发性肝癌是全球性恶性肿瘤，高复发和转移性强导致高死亡率。据我们所知，慢性HBV或HCV病毒感染，酒精性肝炎和肝硬化仍然是导致肝癌的主要风险。我国乙肝(HCC)患者每年增加的数量超过世界的50%，因为带有持续性乙肝病毒(HBV)感染的病人在中国非常普遍。疾病初期是隐性的，当大多数病人出现症状而转向治疗时，他们已是肝癌的晚期，以至于外科切除手术成功率低，复发率高，而且难以预测。为了解决这一全球性的复杂的健康问题，肝癌的机理需要进一步研究。

　　随着基因组时代的到来，人们认识到蛋白质作为生命活动的执行者，对病情的发展起着关键的作用。蛋白质组学的兴起和发展无疑为肝癌研究提供了有力支持，肿瘤蛋白质组学不仅揭示了癌变的基本机制，而且为肝癌早期发现和预测潜在的复发和转移筛选新型的肿瘤标志物。蛋白质组学将成为肝癌研究的有效方法，筛选用于诊断的生物标志物并搜索新的抑制剂或药靶点，但是，复杂程序和高成本限制了它在临床医学研究中的应用。

报告专家：清华大学结构生物学中心饶子和院士

报告题目：冠状病毒结构与功能的复制转录机制

　　冠状病毒，包括SARS冠状病毒、鼠肝炎病毒(MHV)和几个人类冠状病毒(HCoV)，它们同属一个大类，并与重大的人类和动物疾病密切相关。冠状病毒是一种正链RNA病毒，紧随病毒进入时，使用核糖体翻译复制和转录机制的蛋白质。该过程使用病毒基因RNA作为模板去生成几个多肽，然后再自行到十五或十六个非结构蛋白(NSP)，它们将在病毒复制和转录中心(RTC)执行特殊功能。RTC的主要组成部分包括nsp2，nsp4，nsp5（主蛋白酶），nsp7-8（引物酶或二次聚合酶），nsp10，nsp12（RdRP的），nsp13（解旋酶），nsp14（3'到5'核酸外切酶（鸟嘌呤- N7的）-甲基），nsp15（尿苷酸特定内切核糖核酸酶）和nsp16（2'- O -核糖甲基）。了解RTC的结构、功能和组成，对于冠状病毒复制转录的精确的分子机制的解释是至关重要的，并且提供一个对付冠状病毒威胁的抗病毒药物发现的结构基础。

报告专家：欧洲生物信息研究所(EBI)资深科学家 Rolf Apweiler 教授

报告题目：生命科学家数据库：UniProt and Beyond

　　基因组测序的进程已从破译序列转移到编码组成的识别和描述。转录组、蛋白质组和代谢组的功能注释和鉴定是这里的特殊兴趣，并实现了从基因转录鉴定到许多细胞成分的功能信息。公共领域数据库，如Ensembl、UniProt和许多其它资源，要求管理和核对这些信息，并将其提供给用户群体(包括人读和机读方式)去搜索数据。Rolf Apweiler 教授的演讲集中在细胞成分解释的现状、优缺点及其更复杂细胞产品描述的发展前景，特别是在UniProt工程中注释的努力。

报告专家：美国密歇根大学癌症研究中心主任 Gilbert S.Omunm 教授

报告题目：另类作为血浆和组织中蛋白肿瘤生物标记物新的结合变异体与人的血浆有机体有关系

　　另类结合产生蛋白多样化，而并没有增加基因组大小，这是对人体中相对不多的蛋白质编码基因有趣的解释。蛋白质和mRNA的结合变异体代表了对结构功能分析的主要的新挑战，我们的分析通道从MS/MS确定的缩氨酸测序中鉴定和定量已知的异常的结合亚型，分别对来自移入人类胰腺癌和乳腺癌基因的实验鼠的血浆和组织样本进行大规模的蛋白质组学分析。我们通过TPP或MPPI处理从肽段到蛋白质的搜索结果，RT- PCR检测验证了过表达的新变种。我们发现了许多这些癌症的相当有趣的生物解释，在蛋白质与成对亚型相比，产生了结构变化计算模型。另外，Gilbert S.Omunm 教授把这些研究和已知的多肽蛋白质组联系起来，成为新兴的人类蛋白质工程的一部分。

报告专家：美国国家癌症研究所 Henry Rodriguez 教授

报告题目：新型肿瘤蛋白质组学通道：连接基因组学与蛋白质组学

　　基因组计划为定义癌症基因的大量变化和更多分子目标干涉的发展奠定了基础，然而，要承诺实现这些多维的基因组数据集，对这些来自基因变化的理解是必要的。蛋白质组学通过应用新的研究方法和先进的分析工具，可以促进蛋白质组补充调查这一进程。现在蛋白质组学技术提供强大的新工具去测量复杂的蛋白质和翻译后修饰，同时，蛋白质组学测量中的再现性和可变性议题必须优先被解决。关于这方面，国家癌症研究所认为，临床蛋白质组学团体缺乏技术测量再现性以及实验室可转移性、技术发展和广泛有效的资源（有特点的亲和试剂、仪器参考资料和数据参考集）。为此，国家癌症研究所发起了癌症临床蛋白质组学(CPTC)计划，这将突出主动的科学工作，建立一个更可靠有效的蛋白质组学工作流程，它包括三个发展阶段——发现，确认和定量。另外，这次演讲还讨论了国家癌症研究所如何在癌症生物学的理解中继续前进，并提供研究数据作为共同资源。

报告专家：美国约翰霍普金斯大学临床化学部 Daniel W. Chan 教授

报告题目：临床蛋白质组学：癌症生物标志物发现与翻译策略

　　在过去的十年中，蛋白质组学研究在人类蛋白质组的理解中已经取得了重大进展，许多潜在的生物标志物被发现。然而就，在这些用于临床诊断的生物标记物的翻译却取得了很少的进展。癌症是全球性的主要疾病，不幸的是，癌症往往在晚期才被诊断，而到那时治愈癌症的几率已经很低。我们需要做的是在早期发现恶性肿瘤，蛋白质组学生物标记物在抗击癌症的战争中提供了能起积极作用的最佳机会。在Daniel W. Chan 教授的报告中，主要介绍了从癌症标记物发现到翻译的策略。

　　闭幕式

　　4月17日，第七届中国蛋白质组学大会暨第三届国际蛋白质组学论坛于圆满闭幕。闭幕式由北京蛋白质组研究中心主任秦钧教授主持，出席闭幕式的领导和专家有：中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会副主任杨芃原教授，中国科学院北京基因组研究所研究员刘斯奇教授，美国加利福尼亚大学洛杉矶分校(UCLA)平琲琲教授和安捷伦科技公司大中华区学术业务发展经理舒放先生。杨芃原教授、平琲琲教授和刘斯奇教授分别致闭幕词。同时，大会对六个优秀青年学者报告奖及十个优秀墙报奖颁奖。最后，大会通报了第八届蛋白质组学大会将在重庆举行。