发布时间:2019-04-05 22:08 原文链接: 细胞系的DNASTR谱_利用ABI377DNA测序仪进行凝胶电泳

试剂、试剂盒

TEMEDSGM Plus®凝胶上样混合液

仪器、耗材

ABI377 DNA 测序仪制胶材料凝胶装置材料冰或者电制冷板热循环仪凝胶板和凝胶盒缓冲液梢热传导板

实验步骤

1. 在烧杯中混合以下各成分,制备 4 % 聚丙烯酰胺凝胶(制胶材料:量筒、天平、过滤器(如 Sartolab 150 ml 滤器),真空泵、梳子、0.2 mm 胶隔板、磁力搅拌器、尿素(如 Fisher)、丙烯酰胺贮存液(如Bio-Rad 40 % 丙烯酰胺/BIS 19:1)、无菌纯水(如 Fisher AR 级水)、混合床基树脂(如 Sigma)、过硫酸铵(如 Sigma)、10× TBE (如 National Diagnostics)、TEMED (如 Sigma)):

(a)尿素 18 g;

(b)40 % 丙烯酰胺贮存液 5.2 ml;

(c)水 27 ml;

(d)混合床基树脂 0.5 g 。

2. 灌胶。

3. 参照技术手册,安装 ABI377 DNA 测序仪,准备跑胶。

4. 从热循环仪中取出样品,制备上样混合物(甲醛、葡聚糖蓝色染料(试剂盒提供)、Gene Scan500(GS500 ROX)内尺寸标准(试剂盒提供)),每管如下:

(a)甲醛 1.2 μl;

(b)GS500 ROX 0.13 μl;

(c)葡聚糖蓝色上样缓冲液 0.2 μl。

5. 吸 1.5 μl 上样混合物,加入适当的管或板中。同时制备 2 个等位梯度(试剂盒提供)的上样混合物。向适当的管或板中加入 PCR 扩增产物或等位梯度,轻轻混合。

6. 加热含 PCR 扩增产物的上样混合物,使 DNA 变性,95°C 约 3 min,立即移入冰浴中或设定在 0°C 的电子冰盒中。

7. 参照 ABI 技术手册,完成 DNA 测序仪的安装,装上凝胶,从单数泳道开始上样。

8. 跑胶需 2.5 h 。

展开


相关文章

“DNA花朵”微型机器人可自适应环境变化

美国北卡罗来纳大学研究团队研发出一种名为“DNA花朵”的微型机器人。这种机器人具有独特的自适应环境变化能力,能够像生物体一样,根据周围环境改变形状和行为。“DNA花朵”机器人由DNA与无机材料结合形成......

DNA搜索引擎MetaGraph研发成功

瑞士苏黎世联邦理工学院科学家在最新一期《自然》杂志上发表论文称,他们开发出一款名为MetaGraph的DNA搜索引擎,能快速、高效地检索公共生物学数据库中的海量信息,为研究生命科学提供了强大的专业工具......

破解人脑独特性的关键DNA片段发现

究竟是什么让人脑与众不同?美国加州大学圣迭戈分校研究团队发现了一个名为HAR123的小型DNA片段,这将是解开人类大脑独特性之谜的关键。相关研究成果发表于新一期《科学进展》杂志。最新研究表明,HAR1......

破解人脑独特性的关键DNA片段发现

究竟是什么让人脑与众不同?美国加州大学圣迭戈分校研究团队发现了一个名为HAR123的小型DNA片段,这将是解开人类大脑独特性之谜的关键。相关研究成果发表于新一期《科学进展》杂志。最新研究表明,HAR1......

科学家开发出超大片段DNA精准无痕编辑新方法

基因组编辑技术作为生命科学领域的一项重要突破,为基础研究和应用开发提供了技术支撑。以CRISPR及其衍生技术为代表的编辑系统通过可编程的向导RNA引导Cas9等核酸酶靶向基因组特定位点,被广泛应用于特......

在动物大脑中直接修复DNA——神经科学研究新突破系列之一

神经元中基因编辑的插图。图片来源:杰克逊实验室哪怕在五年前,人们也会认为在活体大脑中进行DNA修复是科幻小说中才有的情节。但现在,科学家已能进入大脑、修复突变,并让细胞在整个生命周期中维持住这种修复效......

古DNA为揭示早期埃及人遗传多样性提供新线索

国际知名学术期刊《自然》北京时间7月2日夜间在线发表一篇基因组学论文称,研究人员从上埃及Nuwayrat地区一个古王国墓葬中提取到一名古埃及个体的全基因组测序数据,这些数据分析可追溯至古埃及第三至第四......

古DNA揭示埃及人祖先

在一项研究中,科学家对埃及一座墓葬中的一名古埃及人进行了全基因组测序。这些数据可追溯至古埃及第三至第四王朝,揭示了其与北非及中东地区,包括美索不达米亚古人群的亲缘关系,为早期埃及人的遗传多样性研究提供......

这一分子工具有望成基因调控新“秘钥”

近年来,环状单链DNA(CssDNA)因其稳定性高、免疫原性弱、可编程性强,成为基因调控、细胞治疗等医学合成生物学领域很有潜力的分子工具之一。近期,中国科学院杭州医学研究所研究员宋杰团队针对此前开发的......

天大学者提出全新DNA存储系统

随着信息技术的飞速发展,传统存储方式已经逐渐无法满足大数据时代的需求。在此背景下,DNA信息存储技术应运而生,通过利用DNA分子存储数据,已经被视为未来大规模数据存储的潜力介质。每克DNA能够存储数百......