不同的色谱柱有不同的测试方法，来自不同厂家的同类色谱柱也往往采用不同的测试条件，所以最好按照色谱柱说明书中的测试报告测定柱效。一般工作站的数据处理都有自动计算柱效的功能，若没有工作站，可由公式计算：柱效（理论塔板数）等于保留时间与峰宽的比值的平方再乘以16，或保留时间与半峰宽之比值的平方再乘以5.54。
测定柱效时，不要接保护柱，同时注意连接的管路尽可能短，以减少死体积。
自己测定的柱效有时会低于出厂时测试报告给出的值，因为一般情况下，应用实验室没有专门用于测试柱效的仪器。当然，使用了一段时间的色谱柱的柱效是会下降的。
作为一个例子，下面给出Sepax的参考测试条件可用于C18（C8）柱效的测定。
流动相：乙腈/水（65：35）(v/v)
流速：1.0mL/min
检测波长：254nm
测试样品：Aniline（0.1%），Anisole（0.2%），Toluene（0.5%）(v/v)
进样体积：2.0uL
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