苏州大学GenomeBiology：聚焦基因组中的新基因

　　来自苏州大学、芝加哥大学的研究人员在新研究中，调查了人类和小鼠基因组中新基因驱动基因间相互作用（GGI）网络的速度及模式。这项研究发布在近期的《基因组生物学》（Genome Biology）杂志上。

　　苏州大学的沈百荣（Bairong Shen）教授及芝加哥大学遗传与进化系终身教授龙漫远(Manyuan Long)是这篇论文的共同通讯作者。

　　新基因为生物体创造了遗传和表型多样性，往往是重要的生物学过程和结构中一些谱系特异性或物种特异性元件的遗传基础。一些生物学特征主要是通过细胞元件间复杂的互作而产生，新基因不可避免地被整合到祖先基因间相互作用(GGI)网络中并重塑这一网络来获取它们相应的生物学功能。近期，一些个案研究证实，在果蝇、芽殖酵母和植物中个别新基因可以参与到局部祖先GGI网络中获得重要的功能。但目前对于新基因整合到祖先网络中去的机制及它们的进化意义还不是很清楚。

　　在新研究中，研究人员探讨了在人类及小鼠基因组中新基因驱动GGI网络进化的速度和模式。通过构建及分析三个不同的GGI数据集，他们调查了起源于人类和小鼠谱系不同阶段的新基因的网络拓扑结构及功能进化。他们发现大量新基因是在脊椎动物进化过程中整合到GGI网络中。这些基因经历了逐步整合过程进入到GGI网络中，一开始在网络的边缘，逐渐变为高度连接的中枢，获得多效及基本的功能，最后，他们探讨了驱动这一GGI网络进化的潜在机制及观察到的新基因整合过程的模式。

　　新研究揭示出了新基因逐步整合到祖先GGI网络中一个非稳健但快速的进化过程。他们鉴别出了一些特异性存在于人类基因组中的年轻基因进化为GGI网络的中枢，在脑发育中生成了重要的表型效应。