基线：是指扩增曲线的水平部分。是指在PCR扩增反应的最初数个循环里，荧光信号变化不大。接近一条直线，这样的直线即是基线。每个样品孔都设置独立基线。
阈值：是一个荧光强度值，荧光域值必须设定在 PCR扩增的指数期。
阈值线：穿过阈值与X轴平行的直线称为阈值线；
Ct值：是阈值线与扩增曲线的交点对应在X轴上的值，是循环数。
