解码唯一一种不会飞的鹦鹉

　　不知大家是否还记得呆萌的鸮鹦鹉？这种挑战达尔文进化论的生物近日登上了《新西兰地理》杂志的封面。题为“解码鸮鹦鹉”的文章生动地介绍了鸮鹦鹉的测序工作，不是一只，而是每一只。

　　鸮鹦鹉（kākāpō）是新西兰特有的一种鹦鹉。与鹦鹉家族中的其他表兄弟不同，它是世界上唯一一种不会飞的鹦鹉。不仅不会飞，它们还非常胖，也没有什么防御敌人的手段。在遇到危险时，这种动物的绝招就是静止不动。此外，它们身上还有一种果香或蜜糖的气味。嗯，鸮鹦鹉能存活到现在，简直就是奇迹。

　　不过，鸮鹦鹉虽然没有灭绝，但数量也不多了。它是全球最濒危的物种之一，数量一度不足50头。得益于新西兰全国性的鸮鹦鹉复育计划，目前大约有125头。在这篇文章中，作者Rebekah White就介绍了科学家如何解码这125头鸮鹦鹉的基因组。

　　Jason Howard是杜克大学Erich Jarvis实验室中的一员，这个机构正参与B10K（万种鸟类基因组计划）。它的最终目标是测序所有现存鸟类的基因组，重建鸟类的生命之树。鸮鹦鹉也在这个计划之中，但排在比较靠后的位置。Howard认为，这种鸟类已处于濒危状态，因此有必要插队。

　　不过，Howard在获取了鸮鹦鹉Jane的血液样本之后，又遇到了资金问题。Jarvis实验室刚刚花了10万美元来测序虎皮鹦鹉的基因组，它没有资金来支持另外一种鹦鹉。好在，Howard遇上了测序公司Pacific Biosciences。这家公司的首席科学家Jonas Korlach曾住在新西兰。他了解鸮鹦鹉，并同意合作，从而降低了费用。

　　他们最终解码了鸮鹦鹉的基因组。Jane的基因组将作为参考序列，这意味着其他鸮鹦鹉基因组的测序将变得更经济、更快速。基因组测序最困难的部分在于将它按正确的顺序组装，而Jane的基因组将作为支架，让其他的基因组能成功拼凑。

　　同时，新西兰人David Iorns也参与进来，发起一个众筹项目，希望对全部125头鸮鹦鹉进行重测序。在筹集到25,000美元之后，他们开始对40个基因组进行测序。之后借助PacBio的Genome Galaxy Initiative平台，他们又成功筹集到45,400美元，可以对第二批40个基因组进行测序。最后45个基因组将依赖遗传拯救基金会筹集到的资金。

　　这些基因组数据将是公开的，让全世界的科学家可利用此信息来更好地了解进化，发声等性状，以及更多。