美国太平洋西北国家实验室和罗切斯特大学领导的研究团队近日利用质谱分析技术,绘制出第一张人体器官特异的脂质组图谱–肺部。
近年来,不同类型细胞的转录组和蛋白质组已经陆续发布,包括大脑、心脏和肝脏中的主要细胞类型,这些有助于我们更好地了解人体每个器官的功能。不过到目前为止,还没有类似的脂质组(lipidome)图谱。
美国太平洋西北国家实验室和罗切斯特大学领导的研究团队近日利用质谱分析技术,绘制出第一张人体器官特异的脂质组图谱–肺部。这项成果于本周发表在《Scientific Reports》杂志上。
“对人体肺部各个细胞类型的脂质组进行鉴定,将有助于我们更好地了解肺部形成和功能的调控过程,”研究团队在论文中指出。“基于液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)的脂质组学为检测生物样本的脂质组学特征提供了一种以无偏向的强大方法。”
研究人员从三名20个月大的捐赠者那里获得了肺部组织样本。他们利用荧光激活细胞分选(FACS)技术,分离出四种主要的细胞类型:内皮细胞,上皮细胞,间充质细胞和混合免疫细胞。之后通过LC-MS/MS分析每种细胞类型特定的脂质组和蛋白质组。
为了鉴定和量化所得到的脂质数据,研究人员使用了一种开源软件LIQUID,这是他们在去年为脂质鉴定而开发的。他们发现了多种不同的脂质,具体包括5种脂类和21种亚类中的311种独特脂质。这份独特的图谱似乎揭示了肺细胞如何相互作用和合作。
“基于LC-MS/MS的四种肺细胞的脂质组学分析突出了各种细胞的独特图谱,揭示了肺脏内高度相关且协调的细胞网络,它们支持关键的气体交换功能和先天宿主反应。”研究人员总结道。
“这些细胞类型特异的脂质数据,再加上细胞类型特异的转录物和蛋白质组数据,为研究肺部发育和功能提供了丰富资源。”他们写道。
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