由上海交通大学领导的一个研究小组报告称,他们采用外显子组测序技术绘制出了自然杀伤/T细胞淋巴瘤(NKTCL)基因组学图谱。这一重要的研究成果发布在7月20日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。
上海交通大学系统生物医学协同创新中心的陈赛娟(Sai-Juan Chen)院士、陈竺(Zhu Chen)院士及赵维莅(Wei-Li Zhao)教授是这篇论文的共同通讯作者。陈赛娟和陈竺这对令业界羡慕的院士伉俪师出同门,在同一个实验室工作二十余载,在血液学、分子生物学研究领域共 同发表了大量重要的科研成果。赵维莅教授擅长恶性淋巴瘤、造血干细胞移植。
NKTCL是鼻咽部最多见的原发性淋巴瘤,主要发生于鼻腔、中轴面部及上呼吸道,约占80%,也可累及皮肤、胃肠道、睾丸、中枢神经系统、肺等部 位。患者早期可无明显症状,鼻部主要有鼻塞、鼻出血、鼻面部肿胀、咽痛等;较晚期时可出现鼻咽部粘膜溃疡,覆以干痂或脓痂,伴恶臭气味,鼻外部位病变如皮 肤,可表现为结节、溃疡、粘膜红斑等;发生于胃肠道者,可引起腹痛、肠梗阻或穿孔等;发生于肺部者可有咳嗽、咯血、肺部肿块等症状。NKTCL常伴EBV 持续感染,因此患者常见嗜血细胞综合征,临床表现为高热、肝脾肿大、外周血三系减少。NKTCL主要在亚洲人和南美洲人流行,发病凶险,预后较差,然而直 到现在对于NKTCL的分子发病机理仍不是很清楚。
在这篇文章中,研究人员首先采用全外显子组测序鉴别了25名NKTCL患者的体细胞突变,然后采用靶向测序在扩大的80名NKTCL患者中进行了验证。测序结果揭示出在NKTCL中RNA解旋酶DDX3X, 肿瘤抑制子(TP53和MGA),JAK-STAT信号通路分子(STAT3和STAT5B)和表观遗传修饰子(MLL2、ARID1A、EP300 和ASXL3)频发突变,其中DDX3X突变频率最高(21/105名受试者,20.0%)。研究人员证实相比于野生型蛋白,在NK细胞中DDX3X突变 体显示RNA解旋活性下降,丧失对细胞周期进程的抑制效应,导致了NF-κB和MAPK信号通路转录激活。在临床上DDX3X突变患者显示预后不良。
新研究对于推动深入了解NKTCL的发病机制,及促使开发出针对这种淋巴瘤的精准预后诊断及治疗方法具有重要的意义。
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