发布时间:2019-01-21 16:17 原文链接: 香港基因组计划将启动,测序2万名患者

  根据香港食物及卫生局近日提交的一份文件,香港计划对2万名患者(在某些情况下包括家属)的基因组进行测序和分析,作为香港基因组计划(Hong Kong Genome Project,简称HKGP)的一部分。

  根据香港食物及卫生局近日提交的一份文件,香港计划对2万名患者(在某些情况下包括家属)的基因组进行测序和分析,作为香港基因组计划(Hong Kong Genome Project,简称HKGP)的一部分。立法会下周将对这份文件进行讨论。

  对于香港基因组计划,香港政府最初将划拨6.82亿港元,之后将在六年时间内,平均每年拨款8700万港元,以支持政府全资公司的运作,包括患者招募、样本处理、测序和解释、生物信息学和遗传咨询。

  香港基因组计划拟对患者、患者家属和研究队列开展全基因组测序,并利用这些数据来协助临床管理,如诊断、治疗或预后。参与者还可以同意将其匿名化处理的基因组和临床数据用于医学研究。

  这项计划的目标是覆盖2万个病例,其中每个病例可能涉及到多个基因组序列。例如,癌症患者需要肿瘤-正常样本的基因组测序,而遗传病患者需要家系基因组测序。因此,预计总共将测序4万到5万个基因组。

  香港基因组计划将分为两个阶段实施。试验阶段将测序2,000个病例,关注未确诊的疾病和癌症;而主要阶段将追踪18,000个病例,包括试验阶段覆盖的疾病和其他疾病,以及可能受益于全基因组测序的研究队列。

  参与者将由香港医院管理局、卫生署及当地大学推荐,而这些大学也将在测序后提供临床护理和遗传咨询。文件中指出:“HKGP设计和范围的具体细节将由工作组进一步确定,并由指导委员会批准。”

  经过批准的研究人员将能够访问匿名化处理的数据,以开展癌症基因组学、药物基因组学、表型-基因型关联、表观基因组学及其他领域的研究,而所需的数据库将分阶段实施。

  文件中指出,HKGP是一个催化剂项目,旨在建立本地人群的基因组数据库,测试基础设施和人才库。它有两个目标:一是提高罕见遗传病的诊断率;二是更好地了解引起癌症的基因组变化,从而改善诊断和治疗。

  此外,来自香港基因组计划的数据将有助于产生中国人群的优质基因组数据,而这正是全球医学研究所缺少的。此计划将实现生物医学研究和创新的大数据分析,为香港科学园内的生物医学、信息技术和通讯技术集群带来增益。


相关文章

高精度完整基因组助橡胶育种驶入“快车道”

橡胶树是天然橡胶的主要来源。“橡胶树育种面临的主要困难在于周期长和效率低,通过常规育种方法将多抗、高产性状聚合往往需要30~40年。”中国热带农业科学院橡胶研究所研究员程汉告诉《中国科学报》。然而,目......

小麦野生近缘种基因组“密码”被破解

记者宋喜群、冯帆从山东农业大学获悉,该校农学院教授孔令让研究团队首次组装了小麦远缘杂交常用物种中间偃麦草和鹅观草染色体水平的高质量基因组序列,解析了二者基因组结构差异与独立多倍化演化路径,对两者携带的......

烟草分枝发育的“开关基因”被发现

近日,中国农业科学院烟草研究所烟草功能基因组创新团队发现烟草分枝发育“开关基因”,预示着未来作物株型调控有了新靶点。相关研究成果发表在《植物生物技术》(PlantBiotechnologyJourna......

新研究破译薇甘菊入侵基因密码

薇甘菊作为全球十大最具危害的恶性入侵杂草之一,以其惊人的繁殖速度和强大的环境适应性,在亚洲、太平洋地区及中国华南地区造成严重生态破坏。然而,其基因组层面的适应性进化机制长期未被系统解析,制约了科学防控......

研究开发出酵母泛基因组数字模型与代谢网络分析方法

近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员周雍进团队与上海交通大学副教授鲁洪中合作,在酵母系统生物学研究中取得新进展。研究团队通过整合分析全球1807株酿酒酵母菌株的基因组与生态位数据,构建了高覆盖度的......

基因组大数据还原野猪横跨欧亚的百万年迁徙历程

近日,中国农业科学院农业基因组研究所农业基因编辑技术创新团队深入解析了中亚野猪种群在跨越欧亚大陆百万年的迁徙历程中适应环境的独特遗传密码,为理解大型哺乳动物如何应对环境变化提供了全新视角。相关研究成果......

基因组密码被解锁:深度学习模型破解非编码区奥秘

人类基因组中超98%的遗传变异位于非编码区,这些变异通过调控染色质可及性、三维构象、剪接加工等多种分子机制影响基因表达,最终导致疾病发生。由于调控机制的复杂性和细胞类型特异性,目前解读非编码变异的分子......

香港恒生大学(南沙)中心启用

香港恒生大学(南沙)中心启用礼暨大湾区青年创业论坛21日在广州举行。作为香港恒生大学在内地设立的首个办公室,该中心将不仅是其在粤港澳大湾区的重要支点,也是构建粤港青年联系交流的实体枢纽。香港恒生大学校......

“女娲”基因组计划发布第八项成果

近日,中国科学院生物物理研究所徐涛研究组和何顺民研究组在《基因组、蛋白质组与生物信息学报》杂志发表论文。两位科学家牵头的“女娲”中国人群基因组计划旨在构建中国人群的全基因组数据资源,支撑中国人群的疾病......

适应雨林?古人类混血?东南亚人群基因组被破译

中外团队历时10年,在东南亚人群基因组研究领域取得里程碑式突破。北京时间14日晚,“东南亚人群基因组计划”首期成果发表在国际期刊《自然》上,东南亚人群的遗传演化之谜被揭开。论文通讯作者之一、中国科学院......