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Cell重要成果:RNA剪切视图

来自耶鲁大学的科学家以最详细的细节描述了RNA执行基因表达化学过程的特征。在发表于10月26日《细胞》(Cell)杂志上的论文中,研究人员报告了 II型内含子(group II introns)的14个晶体结构。II型内含子是一种具有酶催化功能的内含子,参与RNA剪切这一遗传复制的关键阶段。这些新视图捕获了这一内含子的工作部件及运作的多个步骤,揭示了运作的化学机制。 首席研究员、耶鲁大学化学教授及分子、细胞与发育生物学教授Anna Pyle说:“我们不仅仅是得到了一个快照,我们捕获了运行中的内含子。” RNA的一个主要功能是复制所有的遗传信息,使其能够被细胞蛋白质工厂――核糖体读取。然而RNA需要编辑,编辑的一个早期步骤就是剪切。 RNA剪接是将DNA模板链转录出的最初转录产物中的内含子除去,将外显子片段重新连接形成一个连续的RNA分子的过程,通过这种方式在任何特定的时间生成生物体所需的正确蛋白。在......阅读全文

“垃圾DNA”不“垃圾”

   就像从电影中删掉的片段一样,生物基因中的一些序列最终也会被剪掉,细胞不会利用它们制造蛋白质。现在,两项研究发现,这些被称为内含子的片段有助于酵母在艰难时期存活。这项研究揭示了DNA的另一种可能的功能,科学家曾认为这种功能是无用的。  未参与该研究的美国加州旧金山州立大学进化分子生物学家Scot

Mol Cell:基因的剪接作用如何影响机体的患病风险

  没人知道一天中有多少次,甚至在一个小时内,我们体内的数万亿个细胞需要制造多少蛋白质,但我们知道,细胞会以大规模的方式在不断制造蛋白质,一旦该过程发生的话,细胞核中就会发生一种称之为RNA剪接(RNA splicing)的编辑过程,其能够确保RNA指令被传送至与机体基因蓝图精确对应的细胞工厂中。图

PLoS Genet:科学家深度解析基因组的“黑暗面”:内含子

  近日,一项刊登在国际杂志PLoS Genetics上的一篇研究报告中,来自纽卡斯尔大学等机构的科学家们通过研究揭示了内含子突变与人类种群变异之间的直接关联;科学家们在基因组学研究中所面临的最大挑战之一就是揭示人类基因组的“黑暗面”所扮演的关键角色,这些区域即科学家们尚未找到携带特殊功能的基因组区

两篇Nature发现内含子的新作用:帮助细胞应对压力

  一直以来,科学家们对许多真核蛋白编码基因中散布的没有明显生物学功能的非编码DNA片段到底起什么作用感到困惑。这些被称为内含子的序列通常在转录和翻译的时候,从它们的原始序列剪接出来并在蛋白质产生之前迅速被破坏。  1月16日Nature杂志上发表的两项最新研究意外发现了内含子的新作用(至少在酵母中

中国科技大学Nature子刊聚焦环状RNA

  来自中国科技大学、华中师范大学等处的研究人员报告称,他们鉴别出了一类与RNA聚合酶Ⅱ相关的环状RNA(circRNAs),将之命名为外显子-内含子circRNAs(EIciRNAs)。并证实这些EIciRNAs调控了细胞核中的转录。这些研究成果在线发表在2月9日的《自然结构与分子生物学

Nature:肥胖的真相

  现代女性以瘦为美。最佳减肥的方法就是吃得少,动得多,但是这对于群体水平肥胖来说好似过于简单,科学家们认为减肥的有效策略需要将神经科学,遗传学和行为科学结合起来,多方面入手。  日前,《自然-展望》(Nature Outlook)以“Obesity”为题,介绍了包括肥胖与遗传、肥胖与微生物组、肥胖

PNAS破解新物种进化的难题

  经过将近5000亿次的尝试,美国德克萨斯大学(UT)奥斯汀分校的研究人员,见证了一个罕见的事件,也许解决了一个进化的难题:内含子——位于基因中的非编码DNA序列,在基因组中是如何增加的。研究结果发表在《PNAS》杂志上,解决了关于新物种进化的基本问题,并可以增进我们对于“基因表达以及癌

内含子的重要功能:帮助酵母应对压力下的生存

  内含子(intron)的存在,是真核细胞蛋白质编码基因与原核细胞最大的区别。在真核细胞基因表达的过程中,需要经过RNA剪接反应将其去除。一般来说,内含子的长度远比编码蛋白的外显子序列长,并且执行剪接反应的酶——剪接体高度复杂,由170多个相关蛋白组成。剪接反应需要高度精准,移码错位一个碱基都会导

Nature Genetics报道重量级发现:开启人类生命的基因

  人类胚胎的形成始于精子细胞和卵母细胞的结合。  这只初生的受精卵携带了分别来自母亲和父亲的一个拷贝的基因组。但是,这些遗传信息只有在受精卵分裂几次后才会被表达,这一事件被称为 “合子基因组激活(zygotic genome activation,ZGA)”,是什么触发了ZGA?有研究报道过斑马鱼

《Nature》1月最受关注的五篇论文

  哥伦比亚大学的一项小鼠研究发现了其中惊人的奥秘:基因组可以通过三维空间重新排列,协调每个神经元中这些基因的调控,从而产生生物多样性,检测到这许许多多种的气味。  英国著名杂志《Nature》周刊是世界上最早的国际性科技期刊,自从1869年创刊以来,始终如一地报道和评论全球科技领域里最重要的突破。

一项地质学研究显示硫化物氧化反应会诱发钻石形成

  硫化物竟是钻石的“好朋友”?根据21日发表在英国《自然—通讯》杂志上的一项地质学研究,地幔中硫化物的氧化反应可能会诱发钻石的形成。这项发现构成了一个直接证据,可以证明钻石是在地幔中硫化物之上成核形成的。   钻石是在地球深部高压、高温条件下形成的一种由碳元素组成的单质晶体,钻石中包裹的细小矿物和

硫化物氧化反应会诱发钻石形成

  硫化物竟是钻石的“好朋友”?根据21日发表在英国《自然—通讯》杂志上的一项地质学研究,地幔中硫化物的氧化反应可能会诱发钻石的形成。这项发现构成了一个直接证据,可以证明钻石是在地幔中硫化物之上成核形成的。   钻石是在地球深部高压、高温条件下形成的一种由碳元素组成的单质晶体,钻石中包裹的细小矿物和

嗜热细菌或可解开高等生物早期进化谜团

  据物理学家组织网报道,生存在日本温泉中的一种嗜热细菌或许可解开高等复杂生物体早期进化的谜团,并可能成为21世纪生物燃料生产的关键。相关研究报告发表在《公共科学图书馆·生物学》(Public Library of Science Biology)杂志上。   分子生物学教授艾伦·兰博维兹介绍说,

单细胞分析重大突破

生物学家对单个细胞的行为而不是对整个细胞群体的行为越来越感兴趣。在一项新的研究中,来自瑞士联邦理工学院(ETH)的研究人员开发出一种新方法可能引发单细胞分析变革。这一技术利用世界上zui小的注射器来对单个细胞的内含物进行取样以便进行分子分析。相关研究结果发表在2016年7月14日那期Cell期刊上,

令人吃惊的最古老DNA

来自加州大学伯克利分校,美国能源部基因研究所(U.S. Department of Energy Joint Genome Institute-- DOE JGI),挪威卑尔根大学等处的研究人员发现地球上最古老的动物物种之一:海洋海葵的基因组与脊椎动物的基因组存在令人惊讶的相似性。 而且这一研究也

震撼!癌细胞竟成抗癌先锋

分泌杀伤配体的癌细胞(绿色)向复发肿瘤细胞(红色)所在区域迁移浸润。  随着研究水平的不断提高,科学界也在努力寻找更高效的癌症治疗手段。但往期的研究总是不能攻克肿瘤的复发与转移性这一难题。如今,哈佛大学的科学家通过结合癌细胞的自我归巢特性和CRIPSR编辑手段,给这一问题提供了一个解决方案。  在过

华大基因再发PNAS文章

  作为基因组测序领域的排头兵,近期深圳华大基因研究院与中科院系统,以及韩国,美国等处的科学家合作,发表了题为“Insights into salt tolerance from the genome of Thellungiella salsuginea(《小盐芥基因组研究揭示其耐逆奥妙》

台湾学者发现预测双相障碍锂疗效的SNPs

  双相障碍(Bipolar disorder)属于心境障碍的一种类型,指既有躁狂发作又有抑郁发作的一类疾病。研究发现,躁狂发作往往有轻微和短暂的抑郁发作,所以多数学者认为躁狂发作就是双相发作,只有抑郁发作的才是单相障碍。DSM-IV(即《精神疾病的诊断和统计手册》)中将双相障碍分为两个亚型,双

Adv Fun Mat:研究人员开发出可以诊断治疗癌症的新系统

  一组来自慕尼黑工业大学、亥姆霍兹慕尼黑德国研究环境健康中心等单位的研究人员已经开发了一种系统可以帮助医生提高恶性肿瘤细胞检测准确率并提供额外治疗机会。而磁性铁蛋白复合物是这个系统的主要组成部分,这项研究成果于近日发表在《Advanced Functional Materials》上,题为“Gen

英国研发出新成分使食物更有饱足感 有助胖人减肥

  据“中央社”11日报道,英国科学家研发出一种成分菊糖-丙酸酯,能让食物更具饱足感。科学家说,针对过重民众的初期测试显示,这种成分能防止他们变得更胖。   由伦敦帝国学院(Imperial College London)和苏格兰格拉斯哥大学(University of Glasgow)研究人员研发

山东农业大学独家发Cell子刊文章

  来自山东农业大学生命科学学院发现了连接植物miRNA和环境胁迫之间的调控新机制,指出选择性剪接在其中扮演的关键角色。相关成果公布在Molecular Cell杂志在线版上。   文章的通讯作者是山东农业大学生命科学学院院长郑成超教授,其研究组主要研究方向包括:植物重要功能基因的克隆、鉴定与

中国学者发表6篇Nature,在生命科学领域取得重大进展

  iNature  2019年9月4日,中国学者在Nature连续发表了6项成果,涉及生命科学,天文学,地球科学等不同的领域,iNature系统介绍这些成果:  【1】混合谱系白血病(MLL)家族的甲基转移酶  -包括MLL1,MLL2,MLL3,MLL4,SET1A和SET1B-在赖氨

生物学家的160小时 vs 人工智能的10分钟

  阿尔法狗的高超棋艺让人们惊叹不已,其实,人工智能不仅能用于下棋,还能用来治病。近日,研究人员将全基因组测序与人工智能分析相结合,能够快速地鉴定出脑瘤样本中的可操作突变。  纽约基因组中心、洛克菲勒大学和IBM的研究人员近日通过集合检测和全基因组测序分析了一个胶质母细胞瘤样本。随后,生物信息学家、

日本研究发现柠檬可预防脂肪肝

  日本研究人员日前宣布,柠檬内含有的成分能够预防脂肪肝。由于脂肪肝会导致肝硬化和肝癌,持续摄取柠檬将有助于预防上述疾病。   意大利和希腊等地中海沿岸的居民,代谢综合征和心血管疾病发病率较低,其饮食中的橄榄油、红酒等被认为发挥了重要作用。不过日本三重大学等机构的研究人员注意到,地中海地区的柠檬消

上海生科院揭示植物糖-ABA级联途径中的负反馈机制

  3月13日,中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所滕胜研究组在PLoS Genetics上在线发表题为The ABI4-Induced Arabidopsis ANAC060 Transcription Factor Attenuates ABA Signaling and Rend

一种修复受损神经元技术将首次进入人体试验

  近日,由匹兹堡大学(University of Pittsburgh)衍生的初创公司AxoMax Technologies开发了一种可生物降解的神经导管(一种聚合物管),其中装有促进生长的蛋白质,可以修复受损神经,而无需移植干细胞或供体神经。到目前为止,该技术已经在猴子中进行了测试,实验结果已发

美培育遗传多样性新型实验鼠

  据《自然》网络版近日消息,具有遗传多样性的新型实验鼠品种即将培育成功。   科学家们曾花费近一个世纪的时间才完成对第一批实验鼠的饲养。早期实验鼠只携带部分野生老鼠遗传多样性片段,如今实验鼠的品种已达成百上千种,但它们具备人类遗传特征的性状却非常少,对引发人类疾病基因的研究有很大局限性。为改变这

数字PCR—外泌体相关肿瘤分子标志物筛查

近几年外泌体研究的热度以及文章数量一直居高不下。人体几乎所有类型的细胞都能分泌外泌体,它是一种直径为 30~150 nm 的小囊泡,外泌体广泛存在并分布于各种体液中,携带多种蛋白质、RNA成分(编码RNA、非编码RNA)和脂类物质等。外泌体作为重要的传递信号分子,形成了一种全新的细胞间信息传递系

诺奖风向标:近年自身免疫性疾病研究重大成果!

  2019年9月24日科睿唯安发布了2019年的引文桂冠奖,迄今为止,已有50位“引文桂冠奖”得主获得诺贝尔奖,其中29位在获奖两年内即斩获诺奖,因此引文桂冠奖也成为名副其实的诺奖风向标。  来自美国国立犹太医学中心的研究者John W. Kappler和Philippa Marrack就获得了2

超分辨率荧光显微镜技术成功运用于外泌体的成像和追踪

  外泌体是由细胞分泌的小膜泡,富含大量的蛋白质。考虑到外泌体在不同生理活动中的显著作用以及在诊断、药物释放方面潜在的价值,研究人员在外泌体的体外追踪和内含物分析方面做了很大的努力。  目前,各种超分辨率显微镜的出现为外泌体的研究提供了强大的工具。2016 年 9 月,东南大学先进光子学中心主任崔一