蛋白质组学实用分析技术一览
分析其实也属于技术的一部分，且在蛋白质组学研究中显得尤为重要，因为蛋白质组学研究提供的数据是生物学上最庞大的，而且蛋白质组比基因组具有更大的复杂性，因此蛋白质组信息学更有挑战性。今天小编先抛砖引玉地介绍几个常用的分析方法和软件。蛋白质定性分析蛋白质定性分析通常是指利用质谱法进行蛋白质鉴定和序列分析。蛋白质定性分析分为top-down分析和bottom-up分析两种策略。目前，bottom-up分析策略被更广泛的应用于蛋白质定性分析工作。根据使用仪器可分为：MALDI-TOF/TOF、LC-ESI-MS/MS根据样本类型可分为：蛋白质全谱分析（即shotgun分析） 、蛋白质胶条/混合液分析、蛋白质胶点分析蛋白质全谱分析定义：蛋白质全谱分析也可称为质谱shotgun分析，是指组分分析，能够鉴定出尽可能多的肽和蛋白质分子。原理：将溶液内蛋白质分子或SDS-PAGE条带的复杂混合物酶解成肽段混合物，通过液相色谱分离。串联质谱测试，最后......阅读全文
质谱样本制备技术资料
试剂耗材： Milli-Q water、Non-powder gloves、Face mask、Hat、10μl and 200μl tips（eppendorf）、Menthol(Fisher M/4056/17)、Acetonitrile(Fisher A/0626/17)、Try
Creative Proteomics发布两款质谱产品
分析测试百科网讯 2016年7月4日，Creative Proteomics，一家提供蛋白质组学相关领域，药物开发服务和产品的供应商，发布了两款质谱新产品——天然化合物MS Std和Sialic acids，这也标志着Creative Proteomics质谱产品的扩张。 质谱，在很
PNNL发表开源蛋白质组学软件Informed-Proteomics
分析测试百科网讯 一则消息可能对蛋白组学研究者们最头痛的事有一定的缓解。美国一机构介绍了一款用于分析鉴定完整蛋白质的新型开源软件。 ProMex中的LS-MS特征查找，该功能是Informed-Proteomics软件套件的第一个组件的特征检测算法。 它被开发用于检测完整蛋白质离子的同位素包膜
质谱和蛋白质组学：击中目标
Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008) 作者：Nathan Blow 分析测试百科 译 近年来，质谱仪大幅提高了动态范围和灵敏度，使研究者们在疾病生物标志物的发现和验证方面，更从容地面对挑战。 在2008年6月的美国质谱大会（ASMS）
质谱样本前处理步骤
生物样品基质复杂，且待测目标物多为内源性的化合物，如血清样本含有蛋白质、多肽、氨基酸、脂类、糖类、无机盐、维生素、有机酸、激素等。因此为了降低基质干扰、延长色谱柱使用寿命、防止系统堵塞损坏、提高检测灵敏度和特异性，往往需要对样品进行沉淀、萃取、净化、富集等前处理。 目前常用的样本前处理方法有：蛋白沉
质谱样本前处理步骤
生物样品基质复杂，且待测目标物多为内源性的化合物，如血清样本含有蛋白质、多肽、氨基酸、脂类、糖类、无机盐、维生素、有机酸、激素等。因此为了降低基质干扰、延长色谱柱使用寿命、防止系统堵塞损坏、提高检测灵敏度和特异性，往往需要对样品进行沉淀、萃取、净化、富集等前处理。 目前常用的样本前处理方法有：蛋白沉
Orbitrap质谱蛋白质组沙龙在京举行
【导语】使用质谱仪器进行蛋白质组研究中有三个关键环节，第一个是样品的处理阶段，这是最简单，也是最重要的一个步骤。第二个阶段是仪器的操作部分，使用液相、质谱等仪器把蛋白质进行分离、分析。主要涉及仪器参数的优化调整。第三步是生物信息学分析部分，这也是最难的部分。本期沙龙中中科院生物物理所的
细菌表达蛋白质和样本制备
一般直接用SDS凝胶加样缓冲液裂解，具体方法如下：[试剂与设备]（1）表达待检测蛋白质的细菌。（2）50mmoL／LTris-HCl（pH7.4）。（3）2xSDS凝胶加样缓冲液：100mmol／L Tris—HCl（pH6.8）200mmol／L 二硫苏糖醇（DTT）4％ SDS（电泳级）0.2％
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（四）
无论是相对定量还是绝对定量方法,DIA很好地克服了DDA鸟枪法和SRM目标监测的种种不足, 在定量蛋白质组学中具有良好的应用前景。然而,目前DIA 方法的循环时间仍然较长,只能与纳流液相联用,并使用较长的梯度以获得足够的色谱峰宽,限制了DIA 的应用范围。这也是DIA 技术下一步需要解决
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（三）
然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同时监测最多10 ~15 个母离子,而SRM 能同时监测上百个离子对,因为高分辨质谱的有效扫描速度通常只有10 ~15 Hz,远慢于SRM 的有效扫描速度。但是这一问题正逐步得到解决,多重累积(Multiplexing, MSX)技术的发展和使用有