2025蛋白质组学大会之跨物种蛋白质组学研究

　　2025年10月14日下午，第12届AOHUPO大会、第8届AOAPO大会、π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会“Cross-species Proteomics（跨物种蛋白质组学）”分会场于广州白云国际会议中心国际会堂顺利举行。会议由中国科学院北京基因组研究所 （国家生物信息中心）张维绮研究员与杨平仿教授共同主持，汇聚了来自中国科学院、广州实验室、浙江大学、南方医科大学南方医院等国家顶尖高校与科研机构的杰出学者。演讲嘉宾们围绕不同物种间蛋白质组学的系统研究、物种进化适应机制解析及多组学融合分析等前沿方向展开深入交流。报告精彩纷呈，生动展示了蛋白质组学在解码生命演化、疾病机制与衰老过程中的强大力量，为疾病诊断、药物靶点发现和生物学基础研究开辟了全新的视野。

分会报告

郑萍 研究员

中国科学院昆明动物研究所

Naïve Pluripotency and Genomic Stability are Coordinated in Mouse Embryonic Stem Cells by a Novel Pluripotency Regulator Zfp998

　　郑萍研究员通过对小鼠胚胎干细胞多能性维持机制的系统解析，发现新型多能性调控因子Zfp998在维持基因组稳定性与干性状态之间发挥了关键的桥梁作用。该研究揭示了Zfp998通过协调核心多能性网络与DNA损伤修复通路，为干细胞治疗的临床安全转化提供了关键的技术支持。

詹祥江 研究员

中国科学院动物研究所

Qinghai-Tibet Plateau Adaptation of a Top Predator-Saker Falcons

　　詹祥江研究员基于整合种群基因组学、三维基因组学及生态学方法，系统揭示了青藏高原猎隼在极端环境下的分子适应机制。研究整合转录组、代谢组和关键蛋白数据，发现其能量代谢和氧化应激相关通路的进化重塑，是高原物种适应低氧的重要分子基础。这些工作阐释了动物通过顺式调控元件空间重构与代谢通路协同进化实现快速适应的新机制，为系统理解物种适应性进化提供了全新范式。

姚红杰 研究员

广州实验室

Capturing R-loops at Base-Pair Resolution Reveals Clustered R-Loops Activating Gene Expression and YMCAG-Contained R-Loops Inducing DNA Damage

　　姚红杰研究员开发了一种无需抗体、低成本、高分辨率的R-loop全基因组定位新技术，首次揭示了R-loop在基因组中成簇存在的组织规律，并鉴定出导致DNA损伤的特异性序列特征，为理解R-loop在基因表达调控和基因组稳定性维护中的双重作用提供了全新视角。

郭国骥 教授

浙江大学

Mapping and Modeling Cell Landscapes at Single-Cell Level

　　郭国骥教授团队利用单细胞组学与人工智能的交叉创新，系统构建了跨物种、多组织的细胞景观图谱以及多层次预测模型。其研究团队构建了跨物种单细胞泛基因组AI模型“女娲”，实现了基于DNA序列的特异性染色质开放性预测。开发“神农”药物虚拟筛选平台，通过单细胞水平的药物扰动模拟，为精准药物组合设计和个体化治疗提供了新的计算策略。郭国骥教授的系列工作推动了生命科学研究进入“虚拟细胞”（Virtual Cell）的新时代，展示了AI在揭示生命调控与创新药物研发中的巨大潜力。

周丽丽 教授

南方医科大学南方医院

Proteomics and Metabolomics: Discovering the Eye of Storm in Kidney Diseases

周丽丽教授在肾脏疾病蛋白质组学与代谢组学领域取得系列进展，系统揭示了肾脏疾病关键致病机制并识别潜在干预靶点。该团队发现外泌体来源OPN蛋白是肾脏纤维化过程的关键驱动因子，并证实线粒体蛋白FAM3A通过影响肾小管上皮细胞焦亡，参与急性肾损伤的发生发展。该系列工作为肾病早期诊断与精准干预提供了可转化的分子工具和路径。

张维绮 研究员

中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）

Deciphering Aging Mechanisms and Developing Interventions Based on Aging Clocks

　　张维绮研究员聚焦衰老的分子机制及干预策略，建立了从衰老评估到机制解析再到干预策略的完整科研体系，为衰老科学从基础研究向临床转化提供了关键理论支持和技术平台。其研究团队构建了首个中国女性衰老时钟，实现生物学年龄以及衰老干预评估的精准量化；通过跨越50年的人体多器官蛋白质组学研究，团队绘制出人类器官衰老全景图谱，并鉴定RNA结合蛋白 ARID5A 为驱动心脏炎症性衰老的重要节点；结合人群组学与肠道菌群分析，鉴定出具有延缓衰老作用的益生菌及其代谢物5-AVAB，可在动物模型中显著延长健康寿命。该系列研究系统揭示了衰老的分子驱动力与组织异步性，构建了可衡量、可干预的多维衰老评估体系，为精准衰老诊断与干预提供了理论依据与技术支撑。

本次“跨物种蛋白质组学”论坛的成功举办，不仅展现了蛋白质组学技术从微观细胞到宏观物种演化、从基础研究到临床转化的广泛应用，更凸显了多学科交叉融合在破解复杂生命现象中的巨大潜力。六场报告层层递进，为未来跨物种、多维度的生命科学研究注入了新的活力与灵感。