Nature重要论文：阐析生物学“暗物质”
在我们的基因组中有一些基因并不编码蛋白质，而是生成长链非编码RNA。近日来自瑞士洛桑大学、洛桑联邦理工学院(EPFL)和瑞士生物信息学研究所(SIB -SIB)的生物学家们，研究了这些知之甚少的基因类型的功能。发现其中一些基因历经进化过程保存下来，存在于从人类到青蛙等11个物种之中。研究结果发表在1月19日的《自然》(Nature)杂志上。 基因的“经典”作用是，生成对细胞功能至关重要的蛋白质。不过，我们的基因组也编码了一些生成长链非编码RNAs的基因，它们的功能颇为神秘。自 4、5年前人们知道在人类和小鼠的基因组中存在有数以千计、这样仍了解甚少的基因以来，一直想了解它们是如何被激活的?以及在哪些器官中被激活?这样的生物学“暗物质”有无意义? 现在来自瑞士洛桑大学整合基因组学中心(CIG)的Henrik Kaessmann教授领导研究小组，编译出了11个物种长链非编码RNAs的目录。通过采用一种进化方......阅读全文
长链非编码 RNA 测序案例分析
背景：人类寿命的延长伴随着神经退行性疾病的发病几率的增加，因而价格不贵的血液诊断的发展迫在眉睫。通过 RNA-seq 分析血液细胞的转录本是发现新的生物标志物的非常高效的途径。 目的：利用 Illumina 测序平台对帕金森病人白血球中 lncRNAs 进行分析，探讨其对 mRNA 选择性剪接的
长链非编码RNA调控肿瘤生长
人类基因组能够产生10000多种长链非编码RNA(lncRNA)，但是至今为止，人们只知道几十种lncRNA分子的功能。 加州大学圣地亚哥分校的Liuqing Yang等人发表在Nature上的一项研究成果表明，两种lncRNAs可以与雄激素受体结合并控制其功能。雄激素受体是一种转录因
长链非编码 RNA（lncRNA）研究策略
长链非编码 RNA（long noncoding RNA，lncRNA）指的是转录本长度在 200-100000 nt 之间的 RNA 分子，它们不编码蛋白，位于细胞核或胞质内，具有保守的二级结构。研究显示，lncRNA 并非以前所认识的那样没有功能，它可与蛋白质、DNA 和 RNA 相互作
带你走进神秘的长链非编码RNA
长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子，它们并不编码蛋白，而是以RNA的形式在多种层面上（表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等）调控基因的表达水平。lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”，是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能。然而，近年来的研究
长链非编码RNA: 从科研到临床
长链非编码RNA (LncRNA)是一类真核生物中长度大于200 nt的非编码RNA分子；根据其与邻近基因的位置可以分为反义lncRNA、增强子lncRNA、基因间lncRNA、双向lncRNA、和内含子lncRNA；它具有多种作用机制，比如在细胞核中作为分子支架、协助可变剪接、调节染色体结构
长链非编码RNA与淋巴瘤
类基因组中仅有1.5%~2.0%编码蛋白的基因得以稳定转录，而剩余的绝大多数RNA无编码蛋白的功能。长链非编码RNA（lncRNA）是一类异质性的非编码RNA，根据lncRNA的功能，可将其分为信号分子、诱饵分子、引导分子和骨架分子4类。人们以往仅将这些不具编码功能的RNA视为进化过程中产生的废
长链非编码RNA: 从科研到临床（二）
脂类代谢和脂肪生成最新的研究表明，lncRNA控制肝脏中的脂类代谢，调控脂肪生成，从而维持机体的脂质稳态[9]。APOA1编码蛋白是高密度脂蛋白的重要组分。其反义转录本APOA1-AS可以在体内和体外抑制APOA1的表达。LncRNA NEAT1在脂肪生成过程中调节PPARγ2的可变剪接，它还介
【盘点】长链非编码RNA的研究进展
非编码RNA在生命调控过程中扮演着重要角色，近年来的研究成果常入选CNS年度十大科学突破。人类基因组转录区高达76％，但转录产物中只有不到2％是编码蛋白质的mRNA，其他均为非编码RNA，其中microRNA (miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA（circRNA）等调控
长链非编码RNA: 从科研到临床（三）
肾脏疾病与糖尿病 糖尿病经常伴随着肾病的发生[5]. 比如基因间lncRNA PVT1与二类疾病都紧密关联。研究人员在II型糖尿病人的晚期肾病进程中发现了PVT1的基因变异。高糖处理可以诱导人的肾间质细胞中PVT1和纤连蛋白1、IV型胶原蛋白、TGF β1、PAI 1等因子的高表达。相反，敲除P
长链非编码RNA: 从科研到临床（一）
概述长链非编码RNA (LncRNA)是一类真核生物中长度大于200 nt的非编码RNA分子；根据其与邻近基因的位置可以分为反义lncRNA、增强子lncRNA、基因间lncRNA、双向lncRNA、和内含子lncRNA；它具有多种作用机制，比如在细胞核中作为分子支架、协助可变剪接、调节染色体结