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植物基因沉默怎么搞?

“植物的种子时期,大量基因都被沉默,直到植物成年以后才按需活化,”植物生化和光合作用研究所(IBVF)的Myriam Calonje Macaya博士解释道。细胞分裂后,基因沉默状态还会传递给子细胞,从而建立细胞记忆。多梳蛋白家族(Polycomb-group proteins,PcG蛋白)参与基因沉默。PcG蛋白包括两个核心蛋白质复合体,PRC1和PRC2,作用是配合组蛋白和DNA构成染色质。组蛋白修饰不会影响DNA序列,却能改变染色质结构,从而影响基因表达。 植物和动物都能通过染色质标签控制基因沉默。PcG复合体在动物体内的表征结果显示,PRC1利用泛素化修饰组蛋白H2A,PRC2有组蛋白H3三甲基转移酶(trimethyltransferase)活性。十多年来,人们一直认为植物PcG复合体活动机制与在动物中观察到的类似:PRC2建立的三甲基化标签用于锚定PRC1,与此同时PRC1对H2A产生泛素化影响。但是,当Zho......阅读全文

高冠军/戴俊彪合作果蝇组蛋白H3/H4系统解析组蛋白剂量

  组蛋白(Histone)在真核生物染色体中扮演着重要的角色,是染色体结构单元核小体的重要组成部分。由核心组蛋白H3,H4,H2A,H2B形成的八聚体是DNA缠绕的主要承载体【1】。除了用以装配染色体外,组蛋白的另外一个重要功能是参与基因组信息的表达调控。组蛋白氨基酸残基上的翻译后修饰如乙酰化、甲

生命科学:染色质修饰沉默植物基因表达领域获重要突破

  在国家自然科学基金(项目编号:31721001)等资助下,中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心何跃辉课题组在染色质修饰沉默植物基因表达领域获重要突破,发现了植物特有的染色质凝缩蛋白EMF1与含BAH结构域的蛋白形成BAH-EMF1蛋白复合体,以介导高等植物基因沉默的分子机制。研究成

表观遗传学修饰

组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节,这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映,这些表观遗传学因素相互作用以调节基因

PLoS Medicine:子宫内膜癌最新研究进展

  来自英国伦敦大学学院妇女癌症部的研究人员在11月12日的PLOS Medicine杂志上发表了一项最新研究:发现HAND2基因是子宫内膜癌中的一种差异甲基化热点,这个基因的表观遗传学修饰在子宫内膜癌的发展中起着关键的作用。   作为一种能够引起全球13%死亡人数的疾病,癌症能够在人体的任何

Nature 表观遗传学进展将遗传学、环境与疾病联系了起来!

  21世纪,表观遗传学的研究得到了快速发展,同时其产生了让研究人员感兴趣和憧憬的东西,当然了,这其中也存在一些大肆宣传的成分,本文中,我们回顾了表观遗传学在过去几十年里是如何演变的,同时分析了近年来改变科学家们对生物学理解的一些研究进展;我们讨论了表观遗传学和DNA序列改变之间的相互作用,以及表观

Nat Struct & Mol Biol:鉴别出激活肿瘤抑制基因表达的新方法

  近日,一项刊登在国际杂志Nature Structural and Molecular Biology上的研究报告中,来自伦敦大学学院的科学家们通过研究发现了一种新方法能重新激活肿瘤抑制基因,相关研究结果有望帮助开发出治疗癌症的新型靶向性疗法。图片来源:National Institutes o

解读重要表观调控因子:保护端粒的非编码RNAs

  在2008年,西班牙国家癌症研究中心(CNIO)的Maria A. Blasco博士领导的端粒和端粒酶研究组是世上首个发现TERRAs的团队。这是一段非编码端粒RNAs,属于染色质端粒的一部分。从那时起,该团队就致力于研究这些序列有什么作用。  最近他们在《Nature Communicatio

长链非编码RNA与淋巴瘤

  类基因组中仅有1.5%~2.0%编码蛋白的基因得以稳定转录,而剩余的绝大多数RNA无编码蛋白的功能。长链非编码RNA(lncRNA)是一类异质性的非编码RNA,根据lncRNA的功能,可将其分为信号分子、诱饵分子、引导分子和骨架分子4类。人们以往仅将这些不具编码功能的RNA视为进化过程中产生的废

出人意料的新才能:非编码RNA

  在《来自基因组暗物质的lncRNA、ciRNA和miRNA》一文中我们提到:人类基因组中也存在大量被称为基因组“暗物质(dark matter)”的非编码序列,包括基因间非编码序列、内含子非编码序列等。所谓基因组“暗物质”,其实就是基因组中的非编码RNA——不包含用于制造蛋白质的版图,构成了超过

上海交大LncRNA研究刊登国际期刊

  长非编码RNA(lncRNA)不编码蛋白质,最初被认为是基因组“暗物质”的一部分。最近,有研究表明,lncRNAs在染色质修饰复合物的招募过程中发挥作用,并能影响基因的表达。然而,是否lncRNAs以类似的方式在癌症中发挥作用,尚不明确。延伸阅读:中美学者JBC解析lncRNA在EMT中的作用。

Science杂志9月最受关注的文章

  美国的《Science》杂志由爱迪生投资创办,是国际上著名的自然科学综合类学术期刊,与英国的《Nature》杂志被誉为世界上两大自然科学顶级杂志。Science杂志主要发表原始性科学成果、新闻和评论,许多世界上重要的科学报道都是首先出现在Science杂志上的,比如艾滋病与人类免疫缺陷病毒之间的

中山大学特聘教授Cancer Research发表结直肠癌新研究成果

  生物通报道:多梳色素框(CBX)蛋白参与多梳抑制复合物(PRC1),介导表观遗传基因沉默,并根据细胞的类型赋予PRC1明显的致癌或抑癌功能。12月6日,在国际肿瘤学权威杂志《Cancer Research》上发表的一项研究中,来自中山大学肿瘤防治中心的康铁邦教授带领的研究小组报道称,抑制结直肠癌

研究揭示H2AK119ub1在染色质蔓延以及跨细胞周期继承机制

  3月23日,中国科学院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室李国红课题组在Nature Cell Biology上发表了题为RYBP/YAF2-PRC1 complexes and histone H1-dependent chromatin compaction mediate propaga

2017年6月9日Science期刊精华

  本周又有一期新的Science期刊(2017年6月9日)发布,它有哪些精彩研究呢?让小编一一道来。  1.Science:针对药物BIA 10-2474的神经毒性提出一种潜在的新解释  doi:10.1126/science.aaf7497  如今,在一项新的研究中,来自荷兰、美国和意大利的一个

华裔学者Cell子刊干细胞命运的决定子

  干细胞沿着定义路线重编程,发育形成如心脏、肺脏或肾脏等特定器官的分子机制,长期以来是科学家们侧重研究的焦点。近日来自北卡罗来纳大学教堂山分校医学院的研究人员,在新研究中揭示了表观遗传信号协同作用决定干细胞最终命运的机制。相关论文发表在12月27日的《分子细胞》(Molecular Cell)

小鼠卵子竟然具有一种特殊染色质高级结构?

  在真核生物中,线性的DNA通过多层级地折叠,以一定的三维结构存在于细胞核中。正确的染色质三维结构在基因表达调控和细胞分裂等细胞生命活动中发挥着至关重要的作用。哺乳动物卵子发生中伴随着剧烈的染色体高级结构的重编程。比如伴随小鼠卵泡发育,初级卵母细胞从相对松散、高度活跃转录的状态逐渐转化成转录沉默,

科学家揭示细胞表观信息稳定遗传的相关分子机制

  北京时间3月24日凌晨,中国科学院生物物理研究所李国红课题组在《自然—细胞生物学》上发表文章,揭示了PRC1复合物和组蛋白H1协同维持细胞表观遗传信息稳定的分子机制。  在多细胞生物中,表观遗传信息的稳定传播是维持细胞身份的重要途径。多梳抑制复合物1(PRC1)是一类重要的表观遗传调控因子,它主

果蝇细胞中发现五种主要染色质类型

该发现构成了描述表观基因组的新框架荷兰科学家在果蝇细胞中发现五种主要染色质类型  转录活性常染色质与受阻遏异染色质的染色质传统分类曾是一个有用的模型,但它应该进行升级,以适应人们日益增加的有关染色质功能域的知识。一项在果蝇中对与蛋白质有关的53种染色质进行的大规模综合性全基

3月14日《自然》杂志精选

新方法可发挥核磁共振更大潜力  虽然核磁共振对很多科学和医学领域来说是一个强大的分析工具,但通常其潜在功能只有一部分得到利用。大多数应用都是定性的,限于所研究的相关性质。Dan Ma及其同事推出一种新方法,称之为“磁共振指纹获取法”,旨在大大增加从一次测量中可以获得的定量信息量。他们

3月14日《自然》杂志内容精选

  新方法可发挥核磁共振更大潜力  虽然核磁共振对很多科学和医学领域来说是一个强大的分析工具,但通常其潜在功能只有一部分得到利用。大多数应用都是定性的,限于所研究的相关性质。Dan Ma及其同事推出一种新方法,称之为“磁共振指纹获取法”,旨在大大增加从一次测量中可以获得的定量信息量。他们的方法结合了

【段子手】两个凄美的生物学故事

  PCR的小女孩《卖火柴的小女孩》改编  实验室里冷极了,没有窗户,不知道是白天还是黑夜。这是一周的最后一天——周末。在这又冷又黑的晚上,一个蓬头散发的小女孩在试验台前坐着。她从家里出来的时候还穿着一件外套,但是有什么用呢?那是一件很大的外套──那么大,不知是哪一年买的。她工作的时候的,就穿上白大