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新的长非编码RNA在神经系统中的作用机制

10月15日,Nucleic Acid Research杂志在线发表了中科院生物物理研究所刘力研究组和陈润生研究组合作的最新研究成果The novel long non-coding RNA CRGregulates Drosophila locomotor behavior。该研究发现了一个神经系统特异性的长非编码RNA在调控果蝇行为方面的作用,并阐明了其调控行为的分子机制。 长非编码RNA是一类长于200nt的非编码RNA。虽然有很多长RNA陆续被发现,但只有少数长非编码RNA的功能被阐明。本研究通过生物学信息预测得到了一批果蝇的长非编码RNA,通过RT-PCR筛选和原位杂交验证,发现其中一种长非编码RNA――CASK Regulatory Gene(CRG)在神经系统中具有特异性表达。随后,通过生物信息学和实验方法,研究确定了CRG为长非编码RNA。通过生物信息学预测,研究得到了编码CRG的DNA......阅读全文

PCR技术 PCR技术的应用

一滴残留在裙子上的精液使得美国总统Bill Clinton不得不坦承他与白宫实习生有不正当的关系。因为他知道现在的生物科技就连一个精子也能被用来做为证据。这种将极微量的生物标本化为可供鉴定的现代技术正是PCR(Polymerase chain reaction)--聚合

分子生物学常用实验技术(page 3)

分子杂交技术    互补的核苷酸序列通过Walson-Crick 碱基配对形成稳定的杂合双链分子DNA 分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。该检测对象可以是克隆化的基因组DNA,也可以是细胞总DN

增加PCR特异性

引物设计  细心地进行引物设计是PCR中zui重要的一步。理想的引物对只同目的序列两侧的单一序列而非其他序列退火。设计糟糕的引物可能会同扩增其他的非目的序列。下面的指导描述了一个可以增加特异性的引物所具有的令人满意的特点:  1.典型的引物18到24个核苷长。引物需要足

增加PCR特异性

增加PCR特异性(一)引物设计细心地进行引物设计是PCR中最重要的一步。理想的引物对只同目的序列两侧的单一序列而非其他序列退火。设计糟糕的引物可能会同扩增其他的非目的序列。下面的指导描述了一个可以增加特异性的引物所具有的令人满意的特点:1.典型的引物18到24个核苷长。引物需要足够长,保证序列独特性

如何做原核表达(prokaryotic expression)(二)

几个常用的启动子和诱导调控表达系统最早应用于的表达系统是Lac乳糖操纵子,由 启动子Plac + 操纵基因lacO +结构基因组成。其转录受CAP正调控和lacI负调控。lacUV5突变能够在没有CAP的存在下更有效地起始转录,该启动子在转录水平上只受lacI 的调控,因而随后得到了更广泛采用。la

原核表达载体的重要调控元件(启动子、SD序列与终止子)

1.启动子 启动子是DNA链上一段能与RNA聚合酶结合并起始RNA合成的序列,它是基因表达不可缺少的重要调控序列。没有启动子,基因就不能转录。由于细菌RNA聚合酶不能识别真核基因的启动子,因此原核表达载体所用的启动子必须是原核启动子。 原核启动子是由两段彼此分开且又高度保守的核苷酸序列组成,

TNT偶联网织红细胞裂解物系统问题与解答

1)什么是TNT偶联网织红细胞裂解物系统?TNT偶联网织红细胞裂解物系统为研究人员提供了一种可供选择的真核体外翻译系统,一种单管、偶联转录/翻译系统。将转录产物掺入到翻译混合物中,TNT偶联网织红细胞裂解物系统简化了体外翻译的过程,缩短了翻译所需的时间。标准兔网织红细胞裂解物翻译系统所用的RNA来源

RNAi的作用机制及siRNA的合成方法

RNAi的作用机制及siRNA的合成方法RNA干扰(RNA interference,RNAi)是由双链RNA(double strandedRNA, dsRNA)分子在mRNA水平关闭相应序列基因表达或使其沉默的过程。dsRNA可以抑制不同类型细胞的靶向基因表达,用特异性的抗体几乎检测不到靶向

DNA重组(DNA recombination)技术:外源基因的蛋白表达-1

通过外源DNA的重组、克隆、以及鉴定,可以获得所需的特异DNA克隆。外源克隆基因在某种表达载体及适宜的宿主细胞中可表达为相应的蛋白质,这就组成了外源基因的蛋白表达系统。表达后的蛋白质必须具有原来的生物学活性,这是基于正确的基因转录、转录后加工、mRNA翻译及翻译后修饰,同时与表达载体的结构和表达体系

RNAi的作用机制及siRNA的合成方法(二)

2.3 倍增阶段    siRNA在RNA依赖性RNA聚合酶(RdRP)的作用下,以mRNA为模板,siRNA为引物,扩增产生足够数量的dsRNA作为底物提供给Dicer酶,产生更多的siRNA, 可再次形成RISC,并继续降解mRNA,从而产生级联放大效应

mRNA 3'末端体外加工

实验材料 对数生长期的 HcLa 细胞与所使用启动子相对的 RNA 聚合酶酵母 tRNA经超卢断裂鲑精 DNAS1 核酸酶 KlenowDNA 聚合酶仪器、耗材 MWCO3500(1 ml cm) 透析袋Dounce 匀浆器 Gorrex 离心管15 mlFalcon 或 Corning 离心管Ec

PCR使用技巧

增加PCR的特异性:1. primers design这是最重要的一步。理想的,只同目的序列两侧的单一序列而非其他序列退火的引物要符合下面的 一些条件a. 足够长,18-24bp,以保证特异性.当然不是说越长越好,太长的引物同样会降低特异性,并且降低产量b. GC% 40%~~~~60% c. 5&

mRNA 3'末端体外加工

            实验材料 对数生长期的 HcLa 细胞 与所使用启动子相对的 RNA 聚合酶 酵母 tRNA 经超卢断裂鲑精 DNA

3.9 mRNA 3'末端体外加工

体外实验有两种策略;一是将 包 含 Po ly( A) 位点目标基因的质粒与无细胞提取物共同孵育,以 使 RNA 聚 合 酶 II 转录目标基因,并对最初的转录进行加工;另一种策略是利用标准的噬菌体聚合酶驱动系统合 成 前 mRNA,然后与无细胞提取物共同孵 育 。实验材料对数生长期的 HcLa 细

最受关注Cell文章:转录的奥秘

  来自德国慕尼黑大学生物化学系的研究人员发表了题为“A Movie of RNA Polymerase II Transcription”的文章,提供了一份关于转录关键元件:RNA聚合酶II启动和延伸的分子动画,其中涉及了这一过程中的关键动力学步骤,对于解析转录过程具有重要意义,也为分子生物学

多聚酶链式反应技术(PCR技术)

多聚酶链式反应即PCR(polymerase chain reaction)技术,应用这一技术可以将微量目的基因(DNA片段)扩增一百万倍以上。PCR反应理论的提出和技术的完善对于分子生物学的发展具有特殊的意义,它以敏感度高、特异性强、产率高、重复性好以及快速简便等优点迅速成为分子生物学研究中应用最

多聚酶链式反应技术(PCR技术)

多聚酶链式反应即PCR(polymerase chain reaction)技术,应用这一技术可以将微量目的基因(DNA片段)扩增一百万倍以上。PCR反应理论的提出和技术的完善对于分子生物学的发展具有特殊的意义,它以敏感度高、特异性强、产率高、重复性好以及快速简便等优点迅速成为分子生物学研究中应用最

体外转录与体外翻译耦联的快速反应系统

            实验材料 质粒 DNA 模板 试剂、试剂盒 无核酸酶污染的水

4.5 体外转录与体外翻译耦联的快速反应系统

TNT 耦联网织红细胞裂解物系统乂可以分为:TNTT7 系统、TNTSP6 系统和 TN 下 PCR 系统。其屮,TNTT7 系统可以从线状和环状 DNA 中翻译蛋白质,SP6 系统只能使用环状 DNA 进行翻译,而 PCR 模板可使用 TNTPCR 系统迸行翻译实验材料质粒 DNA 模板试剂、试剂

体外转录与体外翻译耦联的快速反应系统

实验材料 质粒 DNA 模板试剂、试剂盒 无核酸酶污染的水 [35S] 标记的甲硫氧酸 TNT 快速超级混合液 T7TNTPCR 增强液仪器、耗材 一 70°C 冰箱 冰浴 微量移液器 离心机 水浴槽 聚丙烯酰胺凝胶电泳装置实验步骤 ―、材料与设备1) 无核酸酶污染的水。2)[35S] 标记的甲硫氧

用PCR扩增cDNA库中的特异序列

最常用的基因分离方法需要建立组织或细胞RNA的cDNA库,然后用抗体或 DNA探针筛选出感兴趣的基因。虽然这个方法已成功地克隆了大量基因,但建立和筛 选CDNA库是一项非常耗时.费力的工作,而且用寡聚核苷酸作探针进行筛选需大量蛋 白质序列结构的资料。聚合酶链的反应(PCR)方法可使一种特

PCR技术(十七):用PCR扩增cDNA库中的特异序列

最常用的基因分离方法需要建立组织或细胞RNA的cDNA库,然后用抗体或 DNA探针筛选出感兴趣的基因。虽然这个方法已成功地克隆了大量基因,但建立和筛 选CDNA库是一项非常耗时.费力的工作,而且用寡聚核苷酸作探针进行筛选需大量蛋 白质序列结构的资料。聚合酶链的反应(PCR)方法可使一种特异DNA扩增

PCR扩增CDNA库中的特异序列策略

    最常用的基因分离方法需要建立组织或细胞RNA的cDNA库,然后用抗体或 DNA探针筛选出感兴趣的基因。虽然这个方法已成功地克隆了大量基因,但建立和筛 选CDNA库是一项非常耗时.费力的工作,而且用寡聚核苷酸作探针进行筛选需大量蛋 白质序列结构的资料。聚合酶链的反应(PCR

如何阅读基因载体图谱

  基因载体是基因工程的核心,也是基因治疗中强有力的生物工具,我们先来认识和阅读载体图谱吧。   一、载体分类及载体组成元件   载体分类   1、按属性分类:病毒载体和非病毒载体   病毒载体是一种常见的分子生物学工具,可将遗传物质带入细胞,原理是利用病毒具有传送其基因组进入目

如何阅读基因载体图谱

  基因载体是基因工程的核心,也是基因治疗中强有力的生物工具,我们先来认识和阅读载体图谱吧。   一、载体分类及载体组成元件   载体分类   1、按属性分类:病毒载体和非病毒载体   病毒载体是一种常见的分子生物学工具,可将遗传物质带入细胞,原理是利用病毒具有传送其基因组进入目的细

核糖核酸酶保护(用核糖核酸酶和放射性标记RNA探针)

            实验方法原理 核糖核酸酶保护分析用于度量特异性 mRNA 的丰度以及为它们的拓扑异构特征作图。这种方法包括测试 RNA 与互补的放射标记的 RNA 探针(核糖探针)杂交,然后未杂交的

核糖核酸酶保护(用核糖核酸酶和放射性标记的RNA探针...

核糖核酸酶保护(用核糖核酸酶和放射性标记的RNA探针对RNA作图)实验方法原理 核糖核酸酶保护分析用于度量特异性 mRNA 的丰度以及为它们的拓扑异构特征作图。这种方法包括测试 RNA 与互补的放射标记的 RNA 探针(核糖探针)杂交,然后未杂交的序列被一种或几种单链特异性的核糖核酸酶裂解。实验材料

慢病毒的包装简介及其应用范围

  慢病毒,( Lentivirus )载体是以 HIV-1 (人类免疫缺陷 I 型病毒)为基础发展起来的基因治疗载体。区别一般的逆转录病毒载体,它对分裂细胞和非分裂细胞均具有感染能力。慢病毒载体的研究发展得很快,研究的也非常深入。慢病毒载体可以将外源基因有效地整合到宿主染色体上,从而达到持久性表达

慢病毒的包装简介及其应用范围

  慢病毒,( Lentivirus )载体是以 HIV-1 (人类免疫缺陷 I 型病毒)为基础发展起来的基因治疗载体。区别一般的逆转录病毒载体,它对分裂细胞和非分裂细胞均具有感染能力。慢病毒载体的研究发展得很快,研究的也非常深入。慢病毒载体可以将外源基因有效地整合到宿主染色体上,从而达到持久性表达

慢病毒的包装简介及其应用范围

  慢病毒,( Lentivirus )载体是以 HIV-1 (人类免疫缺陷 I 型病毒)为基础发展起来的基因治疗载体。区别一般的逆转录病毒载体,它对分裂细胞和非分裂细胞均具有感染能力。慢病毒载体的研究发展得很快,研究的也非常深入。慢病毒载体可以将外源基因有效地整合到宿主染色体上,从而达到持久性表达