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蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点(二)

由此可见,泛素化相关基金无论是申请项目数还是金额数均在向磷酸化逼近,甚至从重点项目数看,18年泛素化的项目数已然超过了磷酸化。进一步统计表明,泛素化研究资助项目在医学部中一共98项,总资助金额高达4700万元。由此可见,泛素化的相关研究正是科研界的“当红小生”,基金申请的一大热点。图2.国自然基金项目统计-泛素化除基金之外,近几年,泛素化更是频频出现在各大CNS顶级杂志上,成为CNS杂志综述讨论的热点话题,从各种生理过程、到肿瘤、衰老等疾病、再到药物开发。可见,其在医学领域的重要作用、巨大潜力越来越得到重视,并有望成为继磷酸化之后的第二大明星修饰类型。▲ 泛素化修饰组研究方案的技术注意点:● 泛素化修饰肽段富集的选择?目前,泛素化修饰肽段的富集还是采用基于赖氨素修饰基序抗体(K-GG)进行富集(同样,中科新生命是采用来自CST公司的抗体进行富集)。● 泛素化修饰组的结果如何解读?后续验证有什么注意点?由于泛素化修饰的蛋......阅读全文

中国医学科学院蛋白质组学大会报告集锦

  组蛋白翻译后修饰研究进展   中国科学院生物物理所的杨福全研究员在研讨会上做了题为《组蛋白翻译后修饰研究进展》的精彩报告。  中国科学院生物物理所 杨福全 研究员 杨研究员从以下几个方面,就近年来组蛋白翻译后修饰的研究进展做了综述。染色体和染色质   

优化基因表达的关键因素

在基因表达研究中,研究者比较注意选择合适的表达载体和宿主系统,而往往忽视基因本身是否与载体和宿主系统为最佳匹配这样一个实质性问题。基因的最佳化表达可以通过对基因的重新设计和合成来实现,如消除稀有密码子而利用最佳化密码子,二级结构最小化,调整GC含量等。以下就密码子最佳化、翻译终止效率和真核细胞

优化基因表达的关键因素

 在基因表达研究中,研究者比较注意选择合适的表达载体和宿主系统,而往往忽视基因本身是否与载体和宿主系统为最佳匹配这样一个实质性问题。基因的最佳化表达可以通过对基因的重新设计和合成来实现,如消除稀有密码子而利用最佳化密码子,二级结构最小化,调整GC含量等。以下就密码子最佳化、翻译终止效率和真

简述细胞蛋白水平与mRNA丰度间的依赖关系

  近20年来,高通量技术的发展支持了大规模的基因组、转录组和蛋白质组定量分析。这些数据被用来分析在不同系统和条件下转录组与蛋白质组的定量关系。这些研究有时候会导致一些冲突的结论,尤其是究竟在何种程度上mRNA的量控制了蛋白质的量。    基础生命科学研究和转化生命科学研究的一个核心问题是:基因组

【盘点】定量蛋白组学将在未来10年飞速发展

  人类基因组计划的成功实施,我们已初步掌握了自身的遗传信息。但阐明人类基因组整体功能的功能基因组学仍任重而道远。蛋白质作为生命活动的"执行者",自然成为生命科学研究的新"宠儿"。几乎在所有生命科学领域内,科学研究工作者都需要对细胞、组织或完整生物体的蛋白进行定性描述或定量检测。对一种细胞、组织或完

细胞蛋白水平与mRNA丰度间的依赖关系(二)

在稳定状态的时候,mRNA的水平决定了蛋白质的水平,而且蛋白质的合成会有延迟(Figures 3A and 3B)。很难严格地定义“稳定的状态”,姑且认为我们通常做组学实验时收集的细胞,如果在某个时间段内(通常几小时)的蛋白或者mRNA水平保持相对恒定,则被看做是 “稳定的状态”。在短暂的适

真核生物翻译的调控(2)

5′端非翻译区的二极结构影响到调控蛋白与帽结构的接近,阻碍40S前起始复合体的装配和在mRNA上的扫描,起负调控的作用。但若二极结构位于 AUG的近下游,(最佳距离为14 nt),将会使移动的40亚基停靠在AUG位点,增强起始反应。真核的系列翻译起始因子可使二极结构解链,使翻译复合体顺利通过

无细胞蛋白表达系统的选择

图1.  与细胞内蛋白表达相比,无细胞蛋白表达系统能够显著地节约时间。 与基于细胞的蛋白表达系统相比较,无细胞蛋白表达系统具有独特的优势,包括节约时间、提高具有功能的、可溶的、全长蛋白的总体产量。本文介绍了根据模板类型、期望产率以及下游实验等因素来选择无细胞蛋白表达系统的标

原创]分子生物学软件集总结

1. DNASIS 2.5 DNASIS for Windows 2.5版是日立软件公司(Hitachi Sofeware Engineering Co.,Ltd.)97年推出的一个功能强大的序列分析软件。包含有大部分分子生物学软件的常用功能,可进行DNA,RNA,蛋白质序列的编辑和分析,

Nature:蛋白质组学揭示新冠治疗靶标 抑制病毒复制!

  新冠肺炎已迅速在全球蔓延,对全球公共卫生造成严重威胁并对全球经济造成严重影响。目前针对新冠主要是一些支持性和对症治疗,因此迫切需要开发抑制SARS-CoV-2感染或复制的疗法。尽管SARS-CoV-2与其他冠状病毒有相似之处。但目前仍然缺乏对SARS-CoV-2感染机制的理解以及针对新冠的潜在治

环状RNA研究深度剖析(二)

目标circRNA的机制研究 a RIP-qPCR:挑选功能最为明显的1个circRNA做RIP-qPCR实验,检测circRNA是否与AGO2蛋白结合。(AGO2是circRNA发挥海绵作用的指示蛋白) b RNA pull down:对上述circRNA进行RNA pull down实验,拉

2010全国质谱大会大会报告(二)

美国北卡大学Chaple Hill医学院 Chen, Xian(陈先)教授  来自美国北卡大学Chaple Hill医学院的 Chen, Xian(陈先)教授,做了题为“Systems Dissection of Signal Transduction by Using Quantitative P

一文详解信号肽作用

  输送  信号肽可使正在翻译的核糖体附着到rER膜上。  在信号肽指引下蛋白质在细胞内的输运  核糖体是通过信号肽的功能而附着并合成分泌蛋白的。因此游离的核糖体和膜结合核糖体之间本身并无差异。信号肽是作为一种附着到ER膜上的信号识别,此可能通过开始合成出的N-端头几个氨基酸的疏水功能。然后蛋白链插

高光侠组揭示机体抗病毒新机制:抑制病毒蛋白翻译过程

  病毒感染可以引起多种疾病,严重威胁人类健康。但机体也并非坐以待毙,而是进化出多种方式感知病毒的感染并通过激活自身的免疫系统清除体内的病毒。病毒的感染诱导干扰素产生,而干扰素上调多种干扰素刺激基因(ISGs)的表达。根据已有报道,ISGs在HIV-1 病毒复制期的多个步骤以不同机制抑制病毒【1】。

Nature:向着癌症相关mRNA开炮

  大多数癌症药物都被设计来阻止细胞生长,这是癌症的一个标志,控制细胞生成成千上万种蛋白质的信号通路是一个受欢迎的靶标。  来自加州大学伯克利分校的研究人员现在发现了这一信号通路中一个有前景的新药物靶标,其之所以具有吸引力,部分原因在于它似乎控制了机体一小部分蛋白质的生成,而这些蛋白对于调控生长和细

Blast基本介绍

什么是BLAST?BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较。BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明。BLAST 采用一种局部的算法获得两

Nature:科学家发布人类蛋白质组草图里程碑成果

两个独立研究小组绘制了人体组织和细胞系质谱分析图谱,公布了近乎完整的人类蛋白质组草图。  日前,两个国际小组均在《自然》杂志上公布了人类蛋白质组第一张草图,这些在大部分非患病人体组织和器官中表达的精选蛋白,为更好的理解疾病状态下发生的机体变化,奠定了坚实的基础。这两项最新研究揭示了人类基因组的更多复

徐宇君组报道精准调控小鼠个体与器官大小的作用机制

  众所周知,自然界中各种动物个体有着不同体型大小,例如非洲象体型庞大,成年后体重可达5吨,而同样是哺乳动物的成年小鼠,体重却难以超过50克,这主要是由动物身体中细胞数目的差异导致的,但是动物个体的大小细胞是怎样被调节?在同一个种的不同个体也有大小差别,这种细小的个体差异是否存在遗传学的控制还是主要

环状RNA研究深度剖析

  1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?   2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀

2018国自然研究热点一:环状RNA研究深度剖析

  1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?   2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀

生物物理所等研究揭示核糖体对翻译因子调控的新机制

  3月11日,中国科学院生物物理研究所秦燕研究员指导的一项科研成果登上了《自然—结构和分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology) 最新一期电子版。该文章标题为A conserved proline switch on the

Cell Metabolism:代谢性疾病生化机理并发现新的潜在药物靶标

  蛋白翻译后修饰是细胞生命活动的基本形式之一,也是细胞精细调控其诸多生理过程关键生物学通路之一,并与很多疾病的发生发展休戚相关。因此,负责蛋白翻译后修饰的调控酶成为当今新药研究领域的前沿和热点靶标。以其中蛋白激酶为例,近十年来在美国年销售额超过十亿美元的抗肿瘤药超过一半是靶向此类蛋白翻译后修饰调控

Nature:向着癌症相关mRNA开炮

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生物反应器的应用

应用1.改良乳汁品质;2.生产药用蛋白。3.外源基因在动物体内的位点整合问题;4.乳蛋白基因表达组织特异性问题;5.目的蛋白的翻译后修饰问题;6.转基因表达产物的分离和纯化问题;7.转基因的技术与方法问题;8.伦理道德问题。膀胱生物反应器膀胱反应器有着和乳腺反应器一样的优点:收集产物蛋白比较容易,不

蛋白质组最新研究进展

  蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组,或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,一个蛋白质组不是一个基因组的直接产物,蛋白质组中蛋

6月王牌聚焦:蛋白质组和干细胞研究的重大进展

  六月艳阳高照,生命科学领域的两大研究方向:蛋白质组和干细胞研究均获得了重大突破性成果,可谓是年中时交出了满意答卷。  说起第一张人类基因组图谱,那已经是十几年前的事了,当年科学家们破解了24对染色体之后,满以为就此人体的奥秘可以破解了,然而时间过去了许多年,我们对于人体的功能,发育的过程,疾病的

新剪切模式揭示两千多种新蛋白

  十多年前,人们就已经完成了对人类和小鼠基因组的测序,现在每个人都可以通过数据库使用这些信息。然而,人类和小鼠的蛋白质列表还未完成,最近研究人员还在一种新剪切模式的基础上,发现了两千多种新的哺乳动物蛋白。数据库中列有编码这些蛋白的核苷酸序列,只不过人们原先认为它们没有得到翻译。   “我们在研究

如何阅读基因载体图谱

  基因载体是基因工程的核心,也是基因治疗中强有力的生物工具,我们先来认识和阅读载体图谱吧。   一、载体分类及载体组成元件   载体分类   1、按属性分类:病毒载体和非病毒载体   病毒载体是一种常见的分子生物学工具,可将遗传物质带入细胞,原理是利用病毒具有传送其基因组进入目

如何阅读基因载体图谱

  基因载体是基因工程的核心,也是基因治疗中强有力的生物工具,我们先来认识和阅读载体图谱吧。   一、载体分类及载体组成元件   载体分类   1、按属性分类:病毒载体和非病毒载体   病毒载体是一种常见的分子生物学工具,可将遗传物质带入细胞,原理是利用病毒具有传送其基因组进入目的细

上海药物所阐明代谢性疾病生化机理并发现潜在药物靶标

  蛋白翻译后修饰是细胞生命活动的基本形式之一,也是细胞精细调控其诸多生理过程关键生物学通路之一,并与很多疾病的发生发展休戚相关。因此,负责蛋白翻译后修饰的调控酶成为当今新药研究领域的前沿和热点靶标。以其中蛋白激酶为例,近十年来在美国年销售额超过十亿美元的抗肿瘤药超过一半是靶向此类蛋白翻译