发布时间:2019-03-27 19:50 原文链接: 3.5RNA反转录

利用 RNA 模板通过反转录获得 DNA,进而复制和感染细胞

实验材料

poly(A)+RNA反转录酶鼠源反转酶 或禽源反转录酶

试剂、试剂盒

oligo(dT)12-18lmol LTris-Cl1mol LTris-Cllmol LKC125 mmol LMgCl2dNTP 混合物0.lmol LDTTRNasin

实验步骤

一材料与设备

1)poly(A)+RNA,lmg/ml

Z)oligo(dT)12-18,lmg/ml

3)lmol/LTris-Cl(pH7.6)。

4)1mol/LTris-Cl(pH8.3)

5)lmol/LKC1

6)25 mmol/LMgCl2

7)dNTP 混合物,各 5 mmol/L

8)0.lmol/LDTT

9)RNasin。

10) 反转录酶,鼠源反转酶 (Pharmacia 公司,200U/ul) 或禽源反转录酶(20U/ul)


二、操作方法

(一) 使用鼠源反转录酶合成 cDNA

1) 在灭菌微量离心管中混合下列物质,并置于冰上:

Poly(A)+4RNA,lmg/ml                                          10ul

oligo(dT)12-18,lmg/ml                                          10ul

lmol/LTris-Cl(pH7.6)                                             2.5ul

lmol/LKC1                                                          3.5ul

250 mmol/LMgCl2                                                2ul

dNTP 混合物,各 5 mmol/L                                 10ul

0.lmol/LDTT                                                        2ul

RNasin                                                             25U

鼠源反转录酶                                                    200U

加水至总体积为                                                 50ul

2) 于 37°C 反应 lh

3) 纯化回收. 保存于一 20℃

(二)使用禽源反转录酶合成 cDNA

1) 在火菌微量离心管中混合下列物质,井置于冰上:

poly(A)+RNA,lmg/ml                                             10ul

oligo(dT)12-18,lmg/ml                                           10u1

lmol/LTris-Cl(pH8.3)                                              2.5uI

lmol/LKC1                                                            3.5ul

250 mmol/LMgCI2                                                 2ul

dNTP 混合物,各 3 mmol/L                                   10ul

0.lmol/LDTT                                                          2ul

RNasin                                                                25U

禽源反转斌酶                                                       40U

加水至总体积为                                                    50ul

2) 于 42℃ 反应 lh

3) 纯化冋收,保存于一 20℃



收起 
注意事项

1) 可以先进行小规模的预实验以确定反转录酶的用量。

2) 在反应中加入 [α32P]dCTP,可以通过放射性自显影检测反转录的质量和产率

3) 对于具有不利于转录反应的二级结构的 mRNA 的转录,使用最适温度为 42℃ 的禽源反转录酶可能取得较好的结果。

4)除使用 oligo(dt)12-18 外,在反转录反府中也可以使用长度为 6 的随机寡聚核苷酸。

5) 随若基因芯片技术的发展和逐渐普及应用,产生了由 mRNA 反转彔而获得荧光标记 cDNA 探针的方法。与常用的 RNA 探针同位素标记不同之处就在于其加入了荧光染料 Cy3 或 Cy5 代替了冋位素标记的 dNTP。


相关文章

陈捷凯课题组发现RNAm6A修饰调控异染色质形成的新机制

近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员陈捷凯课题组发现了RNAm6A修饰调控异染色质形成的新机制,阐明了RNAm6A阅读器YTHDC1在这一机制中的关键作用:抑制基因组中广泛分布的ERVK、I......

陈玲玲课题组等发表长非编码RNA功能及调控机制综述论文

近期,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员陈玲玲课题组等在NatureReviewMolecularCellBiology上,在线发表了题为Generegulationbylongnon-codi......

科学家首次展示RNA剪接分子时钟精确原子模型

  西湖大学生命科学学院施一公教授研究组题为《ATP水解酶/解旋酶Prp2及其激活因子Spp2催化剪接体激活过程中结构重塑的分子机理》的论文,11月27日在《科学》杂志以长文形式发......

曹雪涛/侯晋揭示非编码RNA调控肝细胞癌的潜在机制

肝细胞癌(HCC)是一种致命的恶性原发性肝癌,在与癌症相关的死亡中排名第四,在全球突发事件中排名第六,其5年生存率低。持续的肝损伤会引起慢性肝炎和反复代偿性肝细胞增生,最终导致肝癌的发生。肝癌发生的潜......

Science子刊:一种检测新冠病毒RNA的双色RTLAMP检测方法

新型冠状病毒SARS-CoV-2导致2019年冠状病毒病(COVID-19),如今正在全球肆虐。基于此,人类面临着一项重大的公共卫生挑战。快速检测现有的SARS-CoV-2感染和评估病毒传播至关重要。......

单颗粒冷冻电镜技术解析核糖体组装的动态过程

核糖体是所有生物用来合成蛋白质的分子机器,是生命的基本元件。核糖体包括大亚基和小亚基,两个亚基都是由核糖体RNA和大量蛋白质构成的大型复合物。在真核细胞中,核糖体的组装是一个高度复杂、动态的过程,两个......

安捷伦:用于RNA测序的文库制备与靶向序列捕获解决方案

简化的RNA和DNA测序解决方案,用于精简临床NGS2020年9月1日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日宣布推出SureSelectXTHS2RNA试剂盒。该解决方案采用模块化设计,为RN......

一文了解RNA甲基化机制

1.什么是RNA甲基化修饰?我们知道DNA的甲基化修饰是发生在胞嘧啶(C)上的,而最常见的RNA的甲基化修饰是m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺嘌呤)和尿苷化修饰(uridyla......

新冠样本准确度达91.4%陈德喜团队提出基于mNGS的新方法

在大多数严重的急性呼吸道感染病例中,RNA病毒是主要病原体,如2019年12月以来的新冠病毒(SARS-CoV-2),已导致全球超过400万人感染,超过30万名患者死亡[1,2]。mNGS因无需培养、......

如何确定非编码rna的启动子?

长链非编码RNA(Longnon-codingRNA,lncRNA)是长度大于200个核苷酸的非编码RNA。研究表明,lncRNA在剂量补偿效应(Dosagecompensationeffect)、表......