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测序牛人发布蛋白单分子测序技术

人类生命的蓝图是三十亿碱基对组成的人类基因组。而DNA编码的蛋白质是几乎所有生命过程的主要执行者。 现在,美国亚利桑纳州立大学Biodesign研究所的Stuart Lindsay及其同事,在纳米孔DNA测序技术的基础上,开发了能够精确鉴定氨基酸的蛋白单分子测序技术。这一技术不仅可以用来在临床上测序蛋白质和检测新生物指标,还有望给医疗领域带来彻底的改变,在单分子水平上精确监控患者对治疗的应答情况。 Lindsay及其团队让单链肽段穿过纳米孔,纳米孔两边的电极可记录每个氨基酸通过时产生的电信号。他们使用一种机器学习算法,让电脑能够识别代表不同氨基酸的特征信号。这些信号可以作为可靠的指纹,帮助人们鉴别氨基酸的种类,以及氨基酸发生的微妙改变。 从基因组到蛋白组 蛋白对于细胞的生长、分化和修复至关重要,它们能够催化化学反应,抵御疾病,具有各种各样的重要功能。 与线虫等简单生物相比,人类的基因数相......阅读全文

氨基酸的测序的方法和原理

建议参考王镜岩的生物化学携苏丹来奔以色列缬氨酸 苏氨酸 蛋氨酸(甲硫氨酸) 赖氨酸苯丙氨酸 异亮氨酸 色氨酸 亮氨酸

氨基酸的测序的方法和原理

氨基酸测序分为N端测序和C端测序,原理是用氨肽酶(N端测序法)或羧肽酶(C端测序法)将肽链从一端依次切下,并在一段时间内检测切下的氨基酸的种类(时间过长则会出现多种氨基酸),并且重复该过程。必需氨基酸有9种:甲硫氨酸、缬氨酸、赖氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸、亮氨酸、色氨酸、苏氨酸(可以用“甲借来一本两色

基因测序未来研究方向

研究人员对基因测序数据的需求越来越大。Eric Green、Edward Rubin和Maynard Olson三位科学家对未来40年基因测序技术的应用进行了展望。四十年前,也就是1997年前,两篇论文首次报道了确定DNA片段中化学碱基顺序的简易方法。在此之前,分子生物学家们只能检测DNA片段,而不

限制性氨基酸的研究意义

蛋白质的种类不向,其具有的营养价值一般也不相同。蛋白质的营养价值,主要决定于它能在多大的程度上满足机体的总氮平衡或正氮平衡和必需氨基酸的需要。一般来讲,对于量的保证要容易些,大多数情况下,只需要提供给足够的蛋白质就可以了。但是,质的要求,则必须参照机体的需要以及蛋白质本身所能提供的必需氨基酸盼量两个

PNAS:新测序方法助力癌症研究

  在去年圣诞节期间的加拿大落基山脉冰攀之旅中,两位来自华盛顿大学的年轻研究人员:Michael Schmitt和Jesse Salk突发奇想,谈到了一个简单但功能强大,可用于检测癌细胞,获得更好结果的新方法――如果他们能降低DNA测序中的错误率,那么就可以更好的检测出这些细胞中的变异,这种改进

tRF测序应用于Biomarker研究

南京医科大学第一附属医院肿瘤科副主任医师殷咏梅教授长期从事消化道肿瘤和乳腺肿瘤的内科治疗,近来,其实验室利用tRF&tiRNA测序,发现在曲妥单抗敏感和耐受的乳腺癌细胞中,tRNA来源的小非编码RNA分子tRF&tiRNA表达差异显著。其中tRF-30-JZOYJE22RR33和tRF-27-ZDX

近期基因测序研究领域新成果!

  本文中,小编整理了多篇研究报道,共同聚焦科学家们在测序研究领域取得的新成就,与大家一起学习!图片来源:Nature  【1】Nature:中国科学家使用单细胞测序来揭示人类胚胎植入的秘密  doi:10.1038/s41586-019-1500-0  近日,中国多家机构的一个研究团队利用单细胞测

简述限制性氨基酸的研究意义

  蛋白质的种类不向,其具有的营养价值一般也不相同。蛋白质的营养价值,主要决定于它能在多大的程度上满足机体的总氮平衡或正氮平衡和必需氨基酸的需要。一般来讲,对于量的保证要容易些,大多数情况下,只需要提供给足够的蛋白质就可以了。但是,质的要求,则必须参照机体的需要以及蛋白质本身所能提供的必需氨基酸盼量

应用Arraystar ChIRP测序和RNA测序于糖尿病性肾病研究

  美国德克萨斯大学安德森癌症研究中心Farhad R. Danesh教授主要从事肾脏病理的基础与临床研究。近期,其实验室通过Arraystar RNA-seq发现lncRNA分子——Tug1在糖尿病小鼠体内低表达。表达谱芯片及Arraystar CHIRP-seq等证明,Tug1能够直接结合PGC

应用Arraystar ChIRP测序和RNA测序于糖尿病性肾病研究

  美国德克萨斯大学安德森癌症研究中心Farhad R. Danesh教授主要从事肾脏病理的基础与临床研究。近期,其实验室通过Arraystar RNA-seq发现lncRNA分子——Tug1在糖尿病小鼠体内低表达。表达谱芯片及Arraystar CHIRP-seq等证明,Tug1能够直接结合PGC