核酸序列的一般分析流程
核酸序列的一般分析流程1.1 核酸序列的检索http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide 1.2 核酸序列的同源性分析 1.2.1 基于NCBI/Blast软件的核酸序列同源性分析 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/blast.cgi 1.2.2 核酸序列的两两比较 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/bl2.html 1.2.3 核酸序列的批量联网同源性分析(方案) 1.3 核酸序列的电子延伸 1.3.1 利用UniGene数据库进行电子延伸(方案) 1.3.2 利用Tigem的EST Machine进行电子延伸 EST Extractor: http://gcg.tigem.it/blastextract/estextract.html E......阅读全文
核酸序列分析
【实验目的】1、 掌握已知或未知序列接受号的核酸序列检索的基本步骤；2、 掌握使用BioEdit软件进行核酸序列的基本分析；3、 熟悉基于核酸序列比对分析的真核基因结构分析（内含子/外显子分析）；4、 了解基因的电子表达谱分析。【实验原理】针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因，找出基因的位置和
核酸序列分析实验
实验方法原理针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因，找出基因的位置和功能位点的位置，以及标记已知的序列模式等过程。在此过程中，确认一段 DNA 序列是一个基因需要有多个证据的支持。一般而言，在重复片段频繁出现的区域里，基因编码区和调控区不太可能出现；如果某段 DNA 片段的假想产物与某个已知的蛋
核酸序列的检索实验
实验方法原理掌握核酸序列检索的操作方法；熟悉GenBank数据库序列格式及其主要字段的含义；了解EMBL数据库序列格式及其主要字段的含义；熟悉GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存；实验材料电脑仪器、耗材笔记本笔实验步骤1. 使用Entrez信息查询系统检索核酸序列BC0608
什么是标准核酸序列？
标准核酸序列系指供药品标准中要求的种属源性鉴别或鉴定的核酸序列,其具有确定的碱基排列顺序,是实施核酸检测的基础,用于药品检验、药品质量控制中涉及的动物、植物、微生物以及重组生物制品的种属鉴别或鉴定。
标准核酸序列的分类
标准核酸序列可分为植物来源、动物来源、微生物来源及重组生物制品的鉴别或鉴定用标准核酸序列等。 1.植物来源 植物来源的标准核酸序列系指用种属来源明确的植物样本按DNA测序技术指导原则测定得到的标准序列，可用于植物来源的物种如中药材、中药饮片或提取物等的原植物鉴别或鉴定。 2.动物来源 动
依赖核酸序列的扩增技术叙述
国内外的研究结果均表明，草莓组织中富含多糖等物质，分离优质核酸较困难，核酸巾的杂质影响taq DNA聚合酶的活性，从而影响PCR技术在草莓病毒检测中的应用。为了提高利用PCR技术草莓病毒检测的稳定性，国内外的学者在草莓核酸提取方法做了较多的研究，利用OIAGEN公司生产的植物RNA提取试剂盒(P
依赖核酸序列的扩增技术相关
NASBA的简要过程如下：1.RNA模板链进入反应混合物后，第一个引物首先与模板链的3'端结束。2. 反转录酶，合成反义的补偿的DNA链。3. RNA 酶H（一种核糖核酸内切酶，能够特异性地水解杂交到DNA链上的RNA磷酸二酯键，分解RNA/DNA杂交体系中的RNA链，但不能消化单链或双
标准核酸序列的使用和维护
标准核酸序列的使用 将按DNA测序技术指导原则测定得到的供试品DNA序列与标准核酸序列进行计算比对，进而结合判定标准进行种属鉴别或鉴定。判定标准的制定应考虑不同物种的变异范围，并在相应通则或品种项下予以明确。核酸序列比对方法一般建议根据样品特点从以下三种方法中选择采用。 1.BLAST法
依赖核酸序列的扩增技术检测
1 核酸提取 NASBA 方法的核酸提取可按照常规的RNA提取方法进行，根据实际需要可以采取不同的方法。 2 核酸扩增 将纯化的RNA 加到标准的NASBA 反应体系中后，先在65 ℃条件下作用5 min 去除RNA 的二级结构，然后在恒温的42 ℃条件下开始扩增反应。 3 产物的检测
核酸序列的扩增技术优势
相对于免疫学方法或其他基因检测法，NASBA在试验的快速、敏感性、特异性方面有更多的优势。 特异性强：NASBA是一种快速、等温的RNA扩增技术，通过AMV逆转录酶和T7 RNA聚合酶进行的扩增反应，因为反应条件温和以及比PCR短的反应时间，因此转录更加忠实于模板，错配率很低，因而特异性更强。