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盘绕螺旋结构的设计和优化技巧实验

虽然表观上简单，盘绕螺旋（coiled coil ) 模体是高度专一的，并在理解三级结构及其形成方面具有重要意义。最常观察到的盘绕螺旋形态——平行二聚态，其一般的结构类型仍有待全面的描述。尽管如此，其结构已呈现出在某些特定位置需要某些特定类型氨基酸的严格规则。本实验来源「现代蛋白质工程实验指南」〔德〕K.M.实验步骤本节讨论盘绕螺旋特异性设计所涉及的几个不同方面。我们的目标是在核心处和边沿位置选择氨基酸以得到期望的寡聚态（ 见 3. 2.1)、特异性（见 3. 2. 2 ) 和螺旋取向 ( 见 3.2.3 )。这里，我们也把针对特定稳定性的不同设计方案联系起来。第 4 小节（见 3. 2.4 ) 涉及整体稳定性，集中在外部位点（b、c 和 f )。本章我们把所有内容分为小节逐一讨论。但是，正是由于所讨论的导致盘绕螺旋形成的相互影响的各因子的本性，本节的讨论会在几个地方互相交叉。因此，对于处理同一残基位置所起的不同作用的小节可以被......阅读全文