辞旧迎新，ChIP都有哪些新玩法
如果研究者们想知道蛋白在做什么，他们通常会采取直接的方式：免疫共沉淀能知道蛋白A和蛋白B有没有在一起，ChIP能确定蛋白A是否与核酸序列B结合。 染色质免疫共沉淀ChIP可以鉴定与指定蛋白结合的DNA序列，其基础理念能追溯到几十年前。如今ChIP已经成为了表观基因组学的一个基本工具，与新一代测序联合使用可以实现基因组调控区域的定位和图谱分析。 过去人们倾向于将大部分精力放在蛋白编码区域，斯坦福大学医学院的Michael Snyder教授说。“很明显调控区域也是非常重要的。ChIP差不多是找出这些调控区域的最佳途径。” ChIP实验主要是通过交联把蛋白质-DNA互作固定下来，破碎细胞并释放其中的染色质。随后将DNA打碎成小片段，用针对靶蛋白的抗体捕获我们想要的DNA。最后去除交联复原DNA，再通过PCR、DNA芯片或测序进行检测。 ChIP的基础理念多年来并没有太大的改变，但开发者们一直在不断进行着优化。在辞旧迎新之际......阅读全文
ChIP-Chip E. coli
AbstractChIP-Chip stands for Chromatin Immunoprecipitation and chip in the sense of DNA microarray. It is a technique to determine the genome-wide bin
ChIP-Chip技术的介绍与应用
人类基因组计划的完成开启了一个新的纪元——功能基因组时代来临，与基因信息相比较，人们更关注于基因的功能、调控网络与信号通路等信息。表观遗传学研究与核内蛋白因子的功能分析成为基因表达调控研究的重要组成部分。结合了染色质免疫共沉淀与基因芯片技术的ChIP-chip技术的浮现使得全基因组范围内DNA与蛋白
PTMab直播预告 | 组蛋白新型酰化修饰ChIP介绍
基因组信息以染色质的形式存储在细胞核中，147bp DNA 缠绕组蛋白八聚体形成染色质最小单元核小体。核心组蛋白的柔性 N 末端以及球状核心结构域存在大量共价修饰，如乙酰化、甲基化和磷酸化等。组蛋白赖氨酸乙酰化中和了赖氨酸的正电荷，削弱了组蛋白和DNA的相互作用，从而形成更开放的染色质状态，更高的D
染色质免疫沉淀芯片（Chip-Chip）
该技术能够快速在目标基因组的染色体中确定特异DNA结合蛋白的准确结合位点，ChIP芯片也可以在一个基因组的任何感兴趣的区域内寻找染色体的结构改变。一、ChIP-Chip的用途（1）在基因组范围内确定基因转录因子的DNA结合位点和其他DNA结合蛋白或蛋白复合体的DNA结合位点。（2）染色体活性状态的定
如何通过chip确定与基因结合的蛋白质
染色质免疫沉淀,所以对ChIP实验过程的每一步都应设计相应的对照.当检测如转录调控因子一类的DNA结合蛋白,在生理状态下把细胞内的DNA与蛋白质交联在一起.如果你是只知道你的蛋白.染色质免疫沉淀技术一般包括细胞固定,可是双链或者是单链,将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来,在非变性的聚丙烯凝胶电泳
ChIP using plant samples
实验概要 The immunoprecipitation (IP) of cross-linked chromatin with antibodies specific for certain histone modifications (chromatin immunoprecipitati
Tissue preparation protocol for ChIP
实验概要This protocol describes how chromatin is prepared from tissue, which can subsequently be used for chromatin immunoprecipitation (ChIP). It is re
ChIP 新手心得
最近有不少战友在做ChIP实验，希望我的一点经验对大家有帮助（本贴不谈实验步骤，最后我会附件一份说明书，有详细步骤，另外建议像我一样的新手用试剂盒，避免不必要的麻烦）一、原理转录从基因的启动子区开始，由一系列的转录因子结合到基因的启动子区，通用转录因子结合在基本启动子区起始转录，而这个过程对基因的转
ChIP using plant samples – Arabidopsis
实验概要This protocol describes how chromatin is prepared from Arabidopsis, which can subsequently be used for chromatin immunoprecipitation (ChIP). T
ChIP实验技术经验分享
染色质免疫沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation，简称ChIP）是研究活体内蛋白质与DNA相互作用的一种技术。它利用抗原抗体反应的特异性，可以真实地反映体内蛋白因子与基因组DNA结合的状况。随着对基因功能研究的不断深入，这项技术正越来越多的被应用于科研的各个领域