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AffymetrixBarley基因芯片筛选发现小麦白粉病抗性基因StpkV

小麦是目前世界上种植最广泛的粮食作物,全球至少三分之一的人口以小麦为主食。而小麦白粉病(powdery mildew)严重影响小麦的产量,小麦白粉病是由白粉菌(Blumeria graminis f. sp. tri1ci,Bgt)引起的世界性真菌病害,培养小麦白粉病抗性品种是控制白粉病的有效途径。 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室的陈佩度教授是小麦遗传育种的专家,他曾将簇毛麦(Haynaldia villosa)抗白粉病基因定位于6V染色体短臂,这一染色体区段后来被命名为Pm21。簇小麦-普通小麦易位系T6VS-6AL具有持久、广谱的白粉病抗性,这也从一个侧面证明了Pm21具有稳定的白粉病抗性功能。然而Pm21染色体区段上白粉病抗性基因的精细定位用传统的分子遗传方法却很难实现,因为簇毛麦的6VS染色体区段与普通小麦的6AS不配对。 在本研究中,陈佩度教授领导研究小组利用基因芯片等技术......阅读全文

植物生物学研究数据库

实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webt

实质等同性(转录组学)实验

实验材料:小麦  试剂、试剂盒:β-巯基乙醇                                   &nb

实质等同性(转录组学)实验2

3.9 芯片数据介绍对简单的实质等同性实验来说,一个比较转基因系与对照之间基因表达的散点图就已足够了。文献 [ 5 ] 中参与两个实验的样品都标注在图15. 2中。结果用 GeneSpring 软件包显示,绘制了每组比较小麦系之间每个基因成对的平均强度,并突出显示少数感兴趣的基因(统计上显著差异表达

基因芯片的制备、应用与前景

 摘要:基因芯片技术是90年代中期以来快速发展起来的分子生物学高新技术,是各学科交叉综合的崭新科学。其原理是采用光导原位合成或显微印刷等方法,将大量DNA探针片段有序地固化予支持物的表面,然后与已标记的生物样品中DNA分子杂交,再对杂交信号进行检测分析,就可得出该样品的遗传信息。基因芯片技术目前国内

基因芯片技术及其研究现状和应用前景

  生物芯片技术是随着"人类基因组计划"(human genome project, HGP)的进展而发展起来的,它是90年代中期以来影响最深远的重大科技进展之一,它融微电子学、生物学、物理学、化学、计算机科学为一体的高度交叉的新技术,具有重大的基础研究价值,又具有

基因芯片的应用

1998 年底美国科学促进会将基因芯片技术列为 1998 年度自然科学领域十大进展之一,足见其在科学史上的意义。现在,基因芯片这一时代的宠儿已被应用到生物科学众多的领域之中。它以其可同时、快速、准确地分析数以千计基因组信息的本领而显示出了巨大的威力。这些应用主要包括基因表达检测、突变检测、基因组多态

生物芯片入门(五):应用

基因芯片技术及其研究现状和应用前景生物芯片技术是随着“人类基因组计划”(human genome project,HGP)的进展而发展起来的,它是90年代中期以来影响最深远的重大科技进展之一,它融微电子学、生物学、物理学、化学、计算机科学为一体的高度交叉的新技术,具有重大的基础研究价值,又具

DNA microarray相关的基因表达数据处理攻略

基因表达谱 的发展有助于科研工作人员进一步的理论知识充实及应用到研发等领域中。基因芯片是最近几年发展起来的基因表达重要工具,本文主要对这种技术的数据分析和管理方法作具体介绍。一、引言DNA微阵列(DNA microarray),也叫基因芯片,是近几年发展起来的一种能快速、高效检测DNA片段序列、基因

生物芯片应用领域

最大用途在于疾病检测基因表达水平的检测 用基因芯片进行的表达水平检测可自动、快速地检测出成千上万个基因的表达情况。谢纳(M.Schena) 等用人外周血淋巴细胞的cDNA文库构建一个代表1046个基因的cDNA微阵列,来检测体外培养的T细胞对热休克反应后不同基因表达的差异,发现有5个基因在处理后存在

高通量芯片技术在细胞遗传学检测领域的划时代飞跃

  细胞遗传学是从细胞的角度,主要是从染色体的结构和行为来研究遗传现象,并找出遗传机制和遗传规律。目前和基础理论与临床医学紧密结合对于遗传咨询和产前诊断具有重要意义。而迅速发展的芯片技术在检测通量、分辨率、灵敏度等方面都远远超过了传统的细胞遗传学方法。因此可以说高通量芯片技术是细胞遗传学检测领域的一

中外学者Science解析对抗致死真菌的新基因

  来自澳大利亚联邦科学与工业研究组织(CSIRO),中国农业科学院等处的研究人员发表了题为“The Gene Sr33, an Ortholog of Barley Mla Genes, Encodes Resistance to Wheat Stem Rust Race Ug99”的文章

生物芯片入门(一):生物芯片及应用简介

生物芯片(biochip)是指采用光导原位合成或微量点样等方法,将大量生物大分子比如核酸片段、多肽分子甚至组织切片、细胞等等生物样品有序地固化于支持物(如玻片、硅片、聚丙烯酰胺凝胶、尼龙膜等载体)的表面,组成密集二维分子排列,然后与已标记的待测生物样品中靶分子杂交,通过特定的仪器比如激光共聚焦扫描或

展望2015生命科学仪器市场:将迎来爆发性增长

  20世纪80年代初,曾经有人预言:“21世纪将是生物学的世纪”。这一预言如今已经成为现实,美国《科学》周刊评选的2014年全世界十大科技突破中,一半的成果都来自生命科学领域。2014年,科学家们在衰老研究、生物进化、遗传疾病基因分析、干细胞、脑和神经细胞研究领域取得了众多突破,有助于人们揭示有关

生物芯片概念及发展历史和前景

生物芯片(biochip)是指采用光导原位合成或微量点样等方法,将大量生物大分子比如核酸片段、多肽分子甚至组织切片、细胞等等生物样品有序地固化于支持物的表面,组成密集二维分子排列,然后与已标记的待测生物样品中靶分子杂交,通过特定的仪器对杂交信号的强度进行快速、并行、高效地检测分析,从而判断样品中靶分

microRNA 芯片与表达谱芯片的联合应用

microRNA 芯片与表达谱芯片的联合应用——探究胃癌细胞株的原发性耐药的分子机制药物耐受是肿瘤治疗领域的一大难题,一般分为两种类型:其一为原发性耐药,即先前未经治疗的肿瘤细胞天生就对某种药物不敏感;其二是获得性耐药,指经过治疗的肿瘤细胞再次接受该药物治疗时变得不敏感。 目前, 国际上许多科研

中国烟草局联合Affymetrix成功研发烟草全基因组基因芯片

  烟草全基因组基因芯片(Tiling)目前由中国烟草制作完成。该芯片是全球第一套基于全基因组水平的高密度表达谱芯片,是现有烟草基因芯片中探针密度最高、覆盖基因数最多的一款芯片。这是在绒毛状烟草和林烟草全基因组序列精细图谱绘制完成基础上,我国烟草基因组计划重大专项取得的又一项重要的标志性成果。

直击化妆品,护肤品:基因组学和芯片新技术

  科技的发展越来越贴近生活,譬如化妆品,护肤品之类也更多的加入了高科技元素,目前科学家们正利用基因芯片等生物学技术分析年轻肌肤的秘密,了解为何衰老的皮肤会出现凹陷,皱纹,以及斑点,然后寻找能激活在衰老或日照受损过程中丢失的基因分子,从而令肌肤恢复紧致和肤色均匀。一些市面上的皮肤护理产品,如Olay

生命科学仪器市场将迎来爆发性增长 生物育种市场现状

  20世纪80年代初,曾经有人预言:“21世纪将是生物学的世纪”。这一预言如今已经成为现实,美国《科学》周刊评选的2014年全世界十大科技突破中,一半的成果都来自生命科学领域。2014年,科学家们在衰老研究、生物进化、遗传疾病基因分析、干细胞、脑和神经细胞研究领域取得了众多突破,有助于人

实质等同性(转录组学)实验

实验材料小麦试剂、试剂盒β-巯基乙醇氯仿异戊醇SSTE 缓冲液仪器、耗材SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤3.1 芯片背景我们使用了 19846 个点,包含 9246 个 Unigene 序列的小麦 cDNA 芯片(http://www . cerealsdb. uk. net/index. htm

新的SNP芯片助力水牛、小麦和观赏植物的研究

  在每年的圣地亚哥PAG(Plant and Animal Genome)会议上,新的SNP基因分型芯片都会被推出。今年也不例外。水牛、小麦、观赏植物及其他物种的一系列SNP芯片被介绍给了农业研究人员。  众多的学术会议和海报强调了SNP基因分型芯片的使用,而多家公司的研讨会也以它们为中心,因此A

Affymetrix水稻芯片在水稻强弱势颖花异步灌浆分子机制...

Affymetrix水稻芯片在水稻强弱势颖花异步灌浆分子机制研究中的应用Guohui Zhu, Nenghui Ye, Jianchang Yang, Xinxiang Peng, and Jianhua ZhangRegulation of expression of starch synthes

《细胞》子刊11篇文章重磅回顾,这些年兴起的大牛技术

  还记得CRISPR-Cas9基因组编辑技术,cryo-EM,甚至高通量测序技术未出现之前,我们是怎样进行研究的吗?其实大家不用回忆太久,因为这不是很久以前的事。在过去几年间,生物学研究技术进步步伐快的让人难以置信。  Cell出版社旗下Molecular Cell杂志推出了技术特刊,介绍了新技术

11月初重大事件一览:悄然走近的无创基因检测

  11月以来,伴随着APEC在京如火如荼地召开,我们的基因检测行业也爆发了许多新鲜的大事。本文由测序周报(资讯篇)重点搜集了与无创基因检测相关的国内外最新资讯,回顾了9条上周关注及13条综合资讯。大家品读完之后,一定会觉得基因检测离我们已真的不远了!  上周关注  01 达安基因测序仪和唐筛试剂盒

国际知名生物芯片技术公司及其研发重点

现在全世界已有几十家公司专门从事芯片的研究和开发工作,而且已有较为成型的产品和设备问世。其中,基因芯片的商业化开发相对成熟,美国的Affymetrix公司是世界上最有影响的基因芯片开发制造商。目前Affymetrix公司已开发全套的生物芯片技术相关产品,包括* 研究应用系列芯片及相关试剂和试

开放医学研究所利用芯片开发慢性疲劳综合征的检测

  来自GenomeWeb的消息——美国开放医学研究所(Open Medicine Institute,OMI)上周宣布,它将使用Affymetrix的表达芯片来开发检测,以便诊断并协助治疗肌痛性脑脊髓炎(ME)和慢性疲劳综合征(CFS)。  此外,位于加利福尼亚州山景城的OMI还表示,它已成为Af

ChIP-Chip技术的介绍与应用

人类基因组计划的完成开启了一个新的纪元——功能基因组时代来临,与基因信息相比较,人们更关注于基因的功能、调控网络与信号通路等信息。表观遗传学研究与核内蛋白因子的功能分析成为基因表达调控研究的重要组成部分。结合了染色质免疫共沉淀与基因芯片技术的ChIP-chip技术的浮现使得全基因组范围内DNA与蛋白

基因芯片发展历史

俄罗斯科学院恩格尔哈得分子生物学研究所和美国阿贡国家实验室(ANL)的科学家们最早在文献中提出了用杂交法测定核酸序列(SBH)新技术的想法。当时用的是多聚寡核酸探针。几乎与此同时英国牛津大学生化系的Sourthern等也取得了在载体固定寡核苷酸及杂交法测序的国际专利。在这些技术储备的基础上,1994

ACMG:基因芯片分析技术研究进展

  1-   采用基因芯片分析技术揭示慢性淋巴细胞白血病(Chronic Lymphocytic Leukemia)与10q24.32复发性等位基因缺失有关   Genomic microarray analysis of chronic lymphocytic leukemia reveals

生物芯片及其在基因体研究上的应用

生物芯片概论 DNA分子在大多数生物体中是以双股的型态存在(少数病毒、噬菌体除外)。在某些特殊生理状态下,例如:细胞分裂、基因表现等,双股DNA会解开变成单股,然后再回复成双股。而生物学家很早就把这单股DNA利用氢键结合成双股DNA分子的特性应用在生物相关的研究,称之为杂合反应(Hybridizat

比较分子生理基因组学 —cDNA阵列的异种杂交实验

近几年来, DNA 微阵列已经被公认是分子生物学研究的一种标准方法。特别是在生物医学研究方面,常用物种的微阵列一面世就得到广泛应用。但是对于非模式生物来说 ,微阵列的应用尚未得到充分开展,而这些物种往往表现出一些很有趣的生理表型。对大多数比较生物学的研究者来说,制备一个新物种的 D N A 阵列或微