4D蛋白质组学:如何通过软件创新变得更强大?

在过去的二十年中,新技术、新方法的重大进步使蛋白质组学成为蛋白质科学家、生物学家和临床研究人员的一个极其强大的工具1。随着分析仪器的不断发展,蛋白质组学研究的每一项技术进步都会产生更多的数据。与此同时也给生物信息学软件的开发带来了新挑战。 当代基于高通量质谱的蛋白质组学方法使人们对生命过程获得更深入的了解,同时产生大量的数据。这些原始数据需要高效自动化的计算机算法来保障蛋白质的定性定量结果的可靠性。 全球许多实验室正在使用MaxQuant处理蛋白质组学数据,并借助精确蛋白质和肽定量算法获得可靠结果。MaxQuant由来自德国马克斯·普朗克生物化学研究所(MPIB)的计算系统生物化学组开发,免费提供给学术和非学术研究人员。该小组还开发了Perseus软件平台,用于解释蛋白质定量和相互作用数据以及翻译后修饰(PTMs)数据。 MaxQuant拥有强大的算法,可进行全面的数据分析。它使用肽搜索引擎Andromeda,并与Pe......阅读全文

4D蛋白质组学:如何通过软件创新变得更强大?

  在过去的二十年中,新技术、新方法的重大进步使蛋白质组学成为蛋白质科学家、生物学家和临床研究人员的一个极其强大的工具1。随着分析仪器的不断发展,蛋白质组学研究的每一项技术进步都会产生更多的数据。与此同时也给生物信息学软件的开发带来了新挑战。  当代基于高通量质谱的蛋白质组学方法使人们对生命过程获得

通过软件创新打造更强大的4D蛋白质组学技术

  在过去的二十年中,新技术、新方法的重大进步使蛋白质组学成为蛋白质科学家、生物学家和临床研究人员的一个极其强大的工具1。随着分析仪器的不断发展,蛋白质组学研究的每一项技术进步都会产生更多的数据。与此同时也给生物信息学软件的开发带来了新挑战。  当代基于高通量质谱的蛋白质组学方法使人们对生命过程获得

布鲁克宣布将推进4D蛋白质组学和全新timsTOF-Pro™工作流程

  在EuPA 2019大会上,布鲁克公司发布的timsTOF Pro具有以下新功能:  1、具有出色的肽和蛋白质ID定量分析能力的DIA-PASEF技术。  2、timsTOF Pro能够完成生物制药中完整蛋白质分析的新工作流程。  3、下一代4D代谢组学的新工作流程,利用timsTOF Pro常

布鲁克与合作伙伴联手打造前沿的4D蛋白质组学新方案

  * 布鲁克与Cellenion达成合作协议,将cellenONE®样品制备系统与 timsTOF SCP系统联用,实现全自动单细胞4D-蛋白质组学非标记工作流程;  * Seer的Proteograph™产品与timsTOF Pro 2和timsTOF SCP联合使用,可从人血浆样本鉴定超过30

4D打印:-百变生物材料

  3D打印方兴未艾,来自麻省理工大学建筑学系的蒂比茨(SkylarTibbits)便在今年美国TED(技术、娱乐、设计)大会上提出了“4D打印”的概念。他将一根带有关节的3D打印复合材料长绳扔进水中,长绳便如变形金刚般神奇地自动变形为事先设计好的形状。为3D打印的物体添加“时间”纬度,让物体变得拥

瑞士4D打印技术研发取得进展

  目前3D打印技术已经非常普及,而4D打印就是在三个维度的立体空间中进行的3D打印再增加一个时间维度,使打印的物体能够随时间的延续按照预先设计的要求发生外型和结构的变化,最终形成所需要的物体。4D打印技术属于世界最前沿,目前世界上只有为数不多的科研团队在进行前瞻性研究,瑞士苏黎世联邦理工大学工程设

韩国实现4D观察量子自旋波

  韩国浦项科技大学浦项加速器实验室(PAL)科研团队利用第四代线性同步加速器(X射线自由电子激光器)成功实现了对量子自旋波的4D观察。  随着大数据和人工智能的发展,硬盘等海量存储设备变得更加重要。为提高磁性存储设备的容量和处理速度,需要一种快速控制磁性材料特性的技术。科研团队的核心技术就是利用共

瑞士4D打印技术研发取得进展

   目前3D打印技术已经非常普及,而4D打印就是在三个维度的立体空间中进行的3D打印再增加一个时间维度,使打印的物体能够随时间的延续按照预先设计的要求发生外型和结构的变化,最终形成所需要的物体。4D打印技术属于世界最前沿,目前世界上只有为数不多的科研团队在进行前瞻性研究,瑞士苏黎世联邦理工大学工程

首个4D打印软体机器人!

意大利研究人员创造了一种新颖的4D打印的可生物降解的软体机器人,其形状像一颗种子,能随着湿度的变化而改变形状,并能在土壤中航行。该设备作为监测环境的一种新方式具有很大的潜力。4D打印是使用3D打印技术来创造能够对环境因素(如光线和温度)做出反应而改变其形状或属性的物体的过程。此前,该技术已被用于创建

乌得勒支大学和布鲁克合作开发4D结构蛋白组学方法

Albert Heck 和Richard Scheltema团队与布鲁克共同推进PhoX交联剂和TIMS/PASEF技术联合增强交联质谱(XL-MS)研究  近日,布鲁克宣布与乌得勒支大学合作,共同推进质谱在蛋白质3D结构与相互作用方面的研究工作。在蛋白质组学、用质谱研究蛋白质结构和相互作用方面,合

英国4D制药公司收购Tucana健康公司

  鉴于微生物组(microbiome)有望作为新疗法的基础,它已经引起人们的广泛关注。如今,英国4D制药公司(4D pharma plc,以下简称4D公司)通过收购爱尔兰Tucana健康公司(Tucana Health,以下简称Tucana公司)获得它的微生物组管线。  作为科克大学的衍生公司,T

科学家首次实现陶瓷4D打印

  近日发表在新一期美国《科学进展》杂志上的研究显示,中国香港城市大学吕坚教授研究组首次实现了陶瓷4D打印。这种新技术有望应用于太空探索、电子产品和航空发动机制造等领域。  4D打印,就是在3D打印基础上增加了时间维度。4D打印直接将设计内置到物料当中,让材料在设定的时间自动变形为所需要的形状,且可

布鲁克发布timsTOF-fleX™-为空间定位组学配置ESI/MALDI双源

——timsTOF Pro™系统进一步增强用于4D蛋白质组学的MBR-ddaPASEF和diaPASEF性能——timsTOF Pro超高灵敏度的4D蛋白质组学和4D脂质组学性能推进单细胞生物学研究——在ASMS 2019上还发布了用于4D蛋白质组学的新消耗品、软件合作伙伴及软件产品  分析测试百科

4D打印助力静脉血栓栓塞症治疗

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494356.shtm近日,兰州大学第二医院副教授周栋团队和中国科学院兰州化物所研究员张耀明团队共同完成的研究成果《基于聚癸二酸甘油酯丙烯酸酯-甲基丙烯酸羟乙酯(PGSA-HEMA)共聚物4D打印形状记忆下

首次将心脏MRI带入4D智能云端时代

  心血管磁共振成像 (CMR), 俗称心脏MRI,在诊断心脏疾病方面起着至关重要的作用。这项技术,也经历了从2D到3D的发展。目前,有两家公司联合起来想要颠覆现有的心脏MRI,将3D的MRI引入新的时间维度,使其MRI扩展为4D,不仅能够全方位地展示心脏结构,还能够显示血液流动的速度、方向以及流量

新一代!4D蛋白质组学2019大事记

离子淌度分离的引入使得蛋白质组学进入了4D新时代。和常规的3D蛋白组相比,新一代的4D蛋白质组学充分利用了第四维离子淌度(ion mobility)的信息,实现了更加specific的匹配,在扩大检测深度的同时提高了准确性,独特的性能使其成为蛋白组学复杂样本深入研究的利器,使得许多其他科学问题与临床

布鲁克和Radboudumc-TML成立转化组学联合卓越中心

  分析测试百科网讯 2019年4月16日,在荷兰X-omics计划的开幕活动中,布鲁克和拉德堡德大学医学中心(UMC)转化代谢实验室(TML)宣布为转化组学成立联合卓越中心(CoE)。 在Alain van Gool教授的领导下,联合卓越中心将专注于使用各种组学方法进行创新代谢分析的临床转化。该合

布鲁克PASEF技术荣膺EuPA-2019最佳技术奖

  分析测试百科网讯 近日,在德国波兹坦举办的PROTEOMIC FORUM 2019 上,布鲁克在EupPA2019上发布timsTOF Pro 最新功能。布鲁克PASEF技术因其在蛋白组学研究技术上的杰出表现,荣膺EuPA最佳技术奖。  ·最新的DIA-PASEF技术具有出色的肽和蛋白质定量分析

鲁克在-timsTOF-4D蛋白质组学和表观蛋白质组学平台上扩展

  在蛋白质组论坛| EuPA 2022,布鲁克公司(纳斯达克股票代码:BRKR)宣布扩展了更深层次的蛋白质组学和表观蛋白质组学覆盖的能力,包括使用创新的 TIMScore 算法增强磷酸肽分析,该算法现在是基于 GPU 的新 PaSER 2022 平台的一部分。新的 TIMScore 算法利用机器学

吉凯基因—布鲁克“4D+”计划启动暨合作实验室揭牌

  由蛋白质组学驱动的精准医学带来了精确诊断与精准治疗统一的第三代医学革命。离子淌度分离概念的引入,使得蛋白质组学进入4D新时代,定义了蛋白质组学分析新标准。4D-蛋白质组学是新一代蛋白质组学分析技术,由布鲁克公司与蛋白质组学领域的领军人物Matthias Mann,Ruedi Aebersold,

790万!神外所4D高通量高深度蛋白质组学平台采购公告

项目概况  神外所4D高通量高深度蛋白质组学平台建设项目-3质谱仪采购项目 招标项目的潜在投标人应在北京市政府采购电子交易平台  网址:http://zbcg-bjzc.zhongcy.com/bjczj-portal-site/index.html#/home获取招标文件,并于2023-08-11

揭秘4D打印:自动组装-灵感来自生物自我复制

  随着科技的发展,3D打印让人们可以轻松完成对于想象中物体的制作。比如说,你可以利用3D打印机“打”出一个飞机模型。但你听说过4D打印吗?和3D相比,这种更高级的技术除了有“长宽高”这些立体的三维结构,还增加了一个所谓的“时间线”。一旦它进入现实生活,很多科幻电影里才有的场面就会出现在你的面前。 

新技术:中国香港科研团队首次实现陶瓷4D打印

  近日,发表在新一期美国《科学进展》杂志上的研究显示,中国香港城市大学吕坚教授研究组首次实现了陶瓷4D打印。这种新技术有望应用于太空探索、航空发动机制造和电子产品等领域。   4D打印,是在3D打印基础上增加了时间维度。4D打印直接将设计内置到物料当中,让材料在设定的时间自动变形为所需要的形状

美国精准农业领域取得4D作物实时监测技术突破

  美国农业部近日宣布,其“农业和食品研究计划”资助的4D作物监测技术取得重大创新突破,成为美国精准农业领域的又一利器。    这项由佐治亚理工学院、格鲁吉亚大学和佐治亚理工研究院三家合作研究的农作物监测管理系统,超越了目前精准农业应用中广泛使用的2D和3D监测技术,创造性地在3D图像基础上,加入

4D打印:从自组装家具到抗癌机器人

  3D 打印是一个很热的话题。对于消费者来说,3D 打印的一大好处就是个性化的设计。不过,在我们期待 3D 打印普及的时候,科学家们已经开始了新的探索。今年 2 月,在洛杉矶举办的 TED 大会上,MIT 自组装实验室的计算机科学家 Skylar Tibbits 提出了 4D 打印的概念。BBC

4D打印封堵器造福心脏房间隔缺损疾病

  针对心血管内科常见的房间隔缺损疾病,能不能设计出一种生物可降解、组织相容性好、并发症少,且在心脏“漏洞”修补完毕之后即可自动消失的封堵装置,以替代传统的金属封堵器?近日,由哈尔滨工业大学航天学院复合材料与结构研究所冷劲松教授课题组,在国际权威期刊《先进功能材料》上发表的一篇题为《4D打印可生物降

连续纤维复合材料4D打印取得新进展

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505013.shtm4D打印结构能够在外界刺激下产生可编程的形状及性能变化,因而在航空航天、软体机器人、生物医疗等领域具有广泛的应用前景。然而,当前的4D打印结构通常无法兼顾大变形能力和力学承载能力,无法

关于腓骨肌萎缩症4D的基本内容介绍

  CMT4D又为HMSN-Lom,因此病首先发现于Lom镇故命名为HMSNL[10,11]。主要临床特点是发病年龄早,在成年时即发展成严重的残疾。脑干诱发电位(BAEP)显著异常,神经病理学发现有髓纤维数量显著减少,尚存的一部分也都很小,施万细胞功能异常(表现为髓鞘减少和脱髓鞘),而形成典型的洋葱

timsTOF-Pro最新4D高通量超高灵敏度蛋白组学研究技术

  分析测试百科网讯 近日在第15届美国人类蛋白质组学年会上,布鲁克宣布了Evosep One低流速色谱与timsTOF Pro液质联用系统在高灵敏度、高通量血浆蛋白质组学方面取得的进展。布鲁克还重点介绍了PEAKS,Protein Metrics和MaxQuant 4D蛋白质组学软件的进展,这些软

探索蛋白质组学的“第四维度”分析

  就在几年前,蛋白质组学研究人员成功在单个或少量样本中识别出蛋白质、肽段和蛋白质的翻译修饰。十年过去了,这个领域已经发生了翻天覆地的变化。  如今,科学家们希望对蛋白质进行更大范围的分析,使样本数量从数百个扩展到数千个。然而,考虑到蛋白质组学在个性化医学和生物标志物检测领域的应用,这种分析必须具有