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对环境样品（如海水、医院表面和人类肠道）直接进行微生物测序，已经阐明了我们世界中存在的大量微生物。然而，一个微生物物种可能存在遗传多样性，而在宏基因组分析中往往捕获不到这种多样性。最近在《Genome Research》发表的一项研究中，科学家们开发了一种新的工具，来检测细菌物种内的遗传差异，并在母婴微生物组和海洋宏基因组中发现了一种新的传播模式，此前在物种水平的分析中没有发现。 在一个给定的细菌物种中，基因内容可能与参考基因组有50%或更多的不同。本文资深作者、来自Gladstone研究所和加州大学旧金山分校的Katherine Pollard博士说：“这表明在菌株水平上的大量变异可能有真正的功能性后果。因此，迫切需要一种高效的计算工具，量化来自于鸟枪宏基因组学数据的这种变异。” 研究人员开发了一种工具——MIDAS，用于快速分析不同菌株之间的基因内容和单核苷酸变异的差异。为了创建MIDAS，研究人员首先生成一个数据库......阅读全文
当今，研究人员通常依赖新一代测序仪，将独特的DNA碱基序列（只有四个）翻译成字母：A，G，C和T。而DNA链长达数十亿个碱基，这些机器可产生非常短的读数，一次大约50至300个字符。为了从这些字母中提取信息，科学家们需要重建基因组的位置——这个过程类似于重建一本书中文本片段的句子和段落。 但
截至2019年12月23日，中国学者在Cell，Nature及Science在线发表了107篇文章（2019年的Cell ，Nature 及Science 已经全部更新），iNature团队对于这些文章做了系统的总结： 按杂志来划分：Cell 发表了31篇，Nature 发表了44篇，Scie
常用生物软件（windows)全面介绍一、基因芯片1、基因芯片综合分析软件。 ArrayVision 7.0 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件，不仅可以进行图像分析，还可以进行数据处理，方便protocol的管理功能强大，商业版正式版：6900美元。 Arraypro 4.0
2016年11月11-12日，由中国质谱学会主办、华质泰科生物技术（北京）有限公司承办的“2016第四届中国原位电离质谱会议（AIMS2016）”在广州白天鹅宾馆召开。本届会议涵盖原位电离质谱技术前沿基础、原位电离质谱小型化、原位电离质谱产业化和原位电离质谱技术应用新趋势的四大主题，吸引了两百余
为进一步提高中国兽医诊断服务在可靠性、准确性、及时性和高通量等方面的表现，第二届国际兽医检测诊断大会将于2020年9月10-12日在南京国际展览中心举行。大会广泛邀请全球兽医检测诊断的杰出代表与不断进取的中国兽医进行深层次的分享、对话及相互启迪。大会详情时 间：2020年9月
一些研究表明，目前已经公布的基因组存在多种污染，随着这个问题越来越突出，我们需要找出方法来应对 Supratim Mukherjee在进行数据分析的时候，发现数以百计的微生物基因组中会重复出现同一种噬菌体序列，这令他感到很惊讶。这位来自劳伦斯伯克利国家实验室的生物信息学家最开始是为了比对这些微
造血干细胞（hemapoietic stem cell, HSC）是存在于造血组织中的一群原始造血细胞，它不是组织固定细胞，可存在于造血组织及血液中。造血干细胞在人胚胎2周时可出现于卵黄囊，妊娠5个月后，骨髓开始造血，出生后骨髓成为干细胞的主要来源。在造血组织中，所占比例甚少。现代医学中，造血干
人类免疫缺陷病毒（human immunodeficiency virus, HIV），即艾滋病（AIDS，获得性免疫缺陷综合征）病毒，是造成人类免疫系统缺陷的一种病毒。1983年，HIV在美国首次发现。它是一种感染人类免疫系统细胞的慢病毒（lentivirus），属逆转录病毒的一种。HIV通过
Bruce Budowle博士是北德克萨斯大学健康科学中心(UNTHSC)应用遗传学研究所的执行主任。自2009年成立以来，该研究所集中了一大批致力于完善遗传学方法的知名科学家，以增强几个研究领域，包括法医DNA。在UNTHSC的法医科学项目(全美只有14个)
最近，美国福赛思研究所、麻省综合医院（MGH）和哈佛大学公共卫生学院等处的科学家，开发出一种新的方法，收集用于基因组和转录组分析的唾液与粪便。该方法不需要专业人员和设施，同时还能保持样品的完整性。这种方法也为消化道微生物组的基因组成和乳糜泻、口腔癌、牙周炎和肥胖症相关的细菌，提供了重要的见解。
最近，美国福赛思研究所、麻省综合医院（MGH）和哈佛大学公共卫生学院等处的科学家，开发出一种新的方法，收集用于基因组和转录组分析的唾液与粪便。该方法不需要专业人员和设施，同时还能保持样品的完整性。这种方法也为消化道微生物组的基因组成和乳糜泻、口腔癌、牙周炎和肥胖症相关的细菌，提供了重要的见解。
人体中最多的组成部分是什么？基因还是细胞呢？NO，NO，是机体的微生物！它们的数量与人体细胞的比例达到10∶1。仅在我们人体肠道中，就含有超过100万亿个细菌，这些细菌有助于人体消化食物，产生维生素以预防食物中细菌所诱发的疾病。 肠道菌群是指机体肠道的正常微生物群的总和，近年来关于肠道菌群的研
正常情况下，人排出的粪便中，有1/3到2/3的固体成分是肠道细菌。近年来，越来越多的证据显示肠道微生物组对人体健康有着重要影响，也有越来越多的科学研究试图从粪便中分析肠道菌群的特点，获知有关疾病的线索。 本周刚刚在《自然·医学》上在线发表的最新一批论文里，两个跨国科学家团队就在这一领域做出了新
微生物几乎是无所不在的，它们对生态环境和人体健康起到了不容忽视的作用。然而人们对微生物的了解还相当匮乏，因为许多微生物是无法在实验室中培养的。科学家们想了很多方法来探索这些“微生物暗物质”，但还不能同时鉴定微生物的身份和活性。 现在，加州理工（Caltech）和美国能源部联合基因组研究所（DO
CRISPR领军人物、加州大学伯克利分校的Jennifer Doudna研究团队开始探索新型且高效的Cas系统。他们分析了宏基因组数据集，试图确定是否天然存在更小巧的Cas酶。他们最终发现了比Cas9小得多的Cas14。 CRISPR-Cas或许连自己都想不到，如今会变得这么红。它原本只是细菌
过去100年发生的多起事件让世人密切关注未来发生传染病大流行的风险。2018年是1918年流感流行的100周年，估计有数千万人死于100年前那次流感。现在拥有比一个世纪前更好的干预措施，季节性流感疫苗，但不一定完全有效预防。每年需要接种或选择接种的人所占比例较小。世界上还有抗生素可以帮助治疗细菌
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术，可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多，但是，仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列，从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前，去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列，还是一个手动和耗时的过程，为了去除污染
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术，可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多，但是，仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列，从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前，去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列，还是一个手动和耗时的过程，为了去除污染
2019年3月份即将结束了，3月份Cell期刊又有哪些亮点研究值得学习呢？小编对此进行了整理，与各位分享。 1.Cell：迄今为止最大规模人体微生物组研究揭示出数千种新型微生物物种 doi:10.1016/j.cell.2019.01.001 在一项新的研究中，来自意大利特兰托大学计算宏基
经过1500位左右的读者投票，最后iNature编辑部得到了2019年中国生命科学领域20大进展，其中结构有2项，植物3项，生物机理研究4项，新方法/技术/动物模型6项，生物医学5项。 结构：颜宁团队Cav通道结构，这些结构为未来针对Cav通道病的药物发现奠定了基础； 中科院生物物理所饶子和
人体是由自身细胞及共生的大量微生物细胞所共同组成的复杂共生生命体。人体肠道微生物数量庞大、种类繁多，被称为“第二基因组”。在人体微生物组学中，96-99%的微生物聚集在胃肠道，肠道微生物与机体健康有着极为密切的联系。 本文，我们整理了肠道微生物行业的产业现状，包括肠道微生物的应用场景、产业化
2019年上半年很快就结束了，iNature盘点了中国学者在Cell，Nature及Science发表的成果，我们发现总共有86篇（截至2019年6月24日），具体介绍如下： 4-6月发表的文章 【1】2019年6月21日，西北工业大学王文，中科院昆明动物研究所/BGI 张国捷及丹麦哥本哈根
新产品将Illumina Genome Analyzer的读长和安捷伦SureSelect平台有效结合，大大简化实验操作流程 2009年4月30日，北京——Illumina公司（NASDAQ：ILMN）和安捷伦科技（NYSE：A）于日
时光总是匆匆易逝，转眼间，2019年就要结束了，在即将过去的一年里，科学家们在肠道微生物组研究领域取得了哪些重要的研究成果呢？本文中，小编对相关重要的研究成果进行整理，分享给大家！ 图片来源：6xc.com.au 【1】Nat Biotechnol：突破！科学家在人类肠道微生物组中鉴别出10
5月份就要过去了，生物谷小编根据本站报道的Cell、Nature和Science文章的点击量，对读者们关注度比较高的文章进行了盘点，这三大期刊虽然不能完全代表整个生物学领域的进展，但仍然十分具有指导性，囊括了生物学各个领域的部分最前沿进展。癌症，HIV以及肠道微生物仍然是读者们最为关注的几个领域
1977年，Science的两篇论文描述了第一种用于确定DNA片段中化学碱基顺序方法。而在这些文章发表之前，分子生物学家已经能够排列片段。四十年过去了，如今，DNA测序技术正以惊人的速度向前发展。在过去十年中，高通量测序技术使数据生成呈指数级增长态势。 由此产生的大量数据在基础生物学领域的应用已经产
CRISPR-Cas或许连自己都想不到，如今会变得这么红。它原本只是细菌体内的适应性免疫系统，现在却能够编辑几乎任何生物的基因组。近年来几种Cas酶陆续进入人们视线，但这也许只是冰山一角，科学家预测还有许多酶是未知的。 于是，CRISPR领军人物、加州大学伯克利分校的Jennifer Doud
截至2019年12月13日，中国学者在Cell，Nature及Science在线发表了105篇文章（2019年的Cell已经全部更新完毕，而对于Nature及Science只剩下了一期，将分别会12月19日及20日进行更新），小编对于这些文章做了系统的总结： 按杂志来划分：Cell 发表了30
截至2019年12月31日，中国学者在Cell，Nature及Science在线发表了186篇文章，其中生命科学领域有109篇，材料学有30篇，物理学有20篇，化学有12篇，地球科学有15篇。iNature团队对于这些文章做了系统的总结： 按杂志来划分：Cell 发表了31篇，Nature 发
一、基因检测公司梳理 目前全国涉及基因检测概念的公司有200余家，按照业务范围划分，这些公司可以分为：①最上游的基因检测仪器开发企业（测序仪、芯片扫描仪、PCR设备），②提供样本处理试剂和耗材的中上游企业（建库试剂盒、检测试剂盒、工具酶、基因芯片），③提供第三方基因检测服务的中游企业