揭示病毒对土壤有机质矿化的作用

病毒是地球上丰富的生物实体,侵染原核微生物的病毒被称为噬菌体。已有研究表明,在海洋等水体环境中,病毒在调控微生物死亡、微生物群落组成、碳和养分循环等方面发挥关键作用,而目前对土壤病毒生态功能的认识较为缺乏。一方面,噬菌体可杀死细菌从而抑制土壤有机质的矿化;另一方面,噬菌体裂解细胞促进胞内物质(如可溶性有机物)释放到土壤中,从而促进土壤有机碳的矿化。然而,二者之间的权衡如何影响土壤有机质的矿化尚不清楚。 中国科学院亚热带农业生态研究所研究员吴金水团队在灭菌土壤中加入稀释不同梯度的未灭菌土壤悬浊液进行微宇宙培养试验,利用qPCR检测总细菌丰度和活性细菌丰度(叠氮溴化丙锭预处理去除非活菌DNA),利用g23标记基因丰度指示T4型噬菌体丰度,阐明T4型噬菌体与土壤有机碳矿化之间的关系。结果表明,g23基因丰度与总细菌16SrRNA基因丰度和活性细菌16SrRNA基因丰度之间存在显著的负相关关系,总g23基因丰度降低了活细菌16Sr......阅读全文

揭示病毒对土壤有机质矿化的作用

  病毒是地球上丰富的生物实体,侵染原核微生物的病毒被称为噬菌体。已有研究表明,在海洋等水体环境中,病毒在调控微生物死亡、微生物群落组成、碳和养分循环等方面发挥关键作用,而目前对土壤病毒生态功能的认识较为缺乏。一方面,噬菌体可杀死细菌从而抑制土壤有机质的矿化;另一方面,噬菌体裂解细胞促进胞内物质(如

东北地理所旱地黑土T4型噬菌体研究取得突破

 不同生态环境下T4型噬菌体群落分布特征的Unifrac分析   病毒是地球上数量最多的生命体,在控制寄主群落演替、遗传基因的水平移动、生物进化和地球生物化学循环中起到重要的作用。细菌病毒(噬菌体)数量上一般是细菌的10倍左右,被认为是地球上数量最多的病毒类型。尽管噬菌体广泛存在,

东北地理所在东北稻田噬藻体基因多样性研究中获进展

  噬藻体是侵染蓝藻的细菌病毒,在调控蓝藻丰度、多样性及群落结构演替、生物地球化学循环方面起到重要作用,是一种不可忽视的战略生物资源。尽管噬藻体在自然环境中广泛存在,但对其遗传基因多样性研究一直滞后。近年来,海洋、湖泊等水生环境中病毒生态学研究在国际上进展迅速,相继发现一些标记基因可用于解析水生环境

中外科学家全方位分析全球微生物群落

  6月14日,第一届地球环境微生物计划(EMP)会议在深圳召开。世界各国科学家将携手全方位分析全球范围内微生物群落的多样性及功能。项目将对全球典型的环境样本进行宏基因组测序,其中包括土壤、海洋、空气、淡水生态系统等整个地球表面的绝大多数的微生物群落。   会上,来自各国的专家学者相互分享了

第一届地球环境微生物计划会议在深圳召开

  6月14日,第一届地球环境微生物计划(EMP)会议在深圳召开。世界各国科学家将携手全方位分析全球范围内微生物群落的多样性及功能。项目将对全球典型的环境样本进行宏基因组测序,其中包括土壤、海洋、空气、淡水生态系统等整个地球表面的绝大多数的微生物群落。   会上,来自各国的专家学者相互分享了微生物

概述噬菌体的基因重组

  历史:1936年F. M. Burnet发表了噬菌体能产生突变体,其噬菌斑的外形和野生型的有明显区别,可惜的未能引起重视,以致噬菌体遗传学延迟了十年才得以建立。  1946年第11届冷泉港学术讨论会上,在宣布一基因一酶学说的胜利,及Ledernerg、Tatum细菌杂交实验报告的同时,Hersh

基因重组的噬菌体的相关介绍

  历史:1936年F. M. Burnet发表了噬菌体能产生突变体的观点,其噬菌斑的外形和野生型的有明显区别,可惜未能引起重视,以致噬菌体遗传学延迟了十几年才得以建立。  1946年第11届冷泉港学术讨论会上,在宣布一基因一酶学说的胜利,及Ledernerg、Tatum细菌杂交实验报告的同时,He

辅助噬菌体的特性和分布来源

噬菌体是由D.Herelle和Twort各自独立发现的。噬菌体(bacteriophage, phage)是感染细菌、真菌、放线菌或螺旋体等微生物的病毒的总称,因部分能引起宿主菌的裂解,故称为噬菌体。本世纪初在葡萄球菌和志贺菌中首先发现。噬菌体具有病毒的一些特性:个体微小。噬菌体分布极广,凡是有细菌

前噬菌体介导耐药基因水平传播新机制

  前噬菌体(Prophages)在包括毒力因子在内的多种功能性状的转导中发挥重要作用,但在携带和传播抗微生物抗性基因(ARGs)方面仍存在争议。  2023年6月27日,南京农业大学动物医学院兽药残留与耐药性风险评估中心王丽平教授团队联合动物科技学院刘金鑫教授在 ISME Journal (IF=

概述RNA噬菌体的基因组结构和功能

  研究最清楚的大肠杆菌RNA噬菌体是MS2,R17,f2和Qβ。它们的基因组小,只有3600到4200个核苷酸,包含四个基因。MS2.R17和f2具有几乎一样的基因组结构。在四个基因中有两个基因编码噬菌体的结构蛋白:一个是A蛋白的基因,长1178个核苷酸。A蛋白(称为成熟蛋白)的功能是使噬菌体能识

λ噬菌体的局限性λ噬菌体

实验方法原理 本实验以含原λ噬菌体和缺陷噬菌体λdg的双重溶原菌gal+作为供体,经紫外线诱导后,获取能转导半乳糖发酵基因的高频转导噬菌体裂解液,然后让这些转导噬菌体将gal+基因转移到受体菌gal-中去。实验材料 供体菌 : Escherichia coli K12 F2 gal + (带有原噬菌

对抗土传病害:来杯噬菌体“鸡尾酒”

  噬菌体是专门“吃”某一种细菌的一类微生物,具有高度的宿主特异性。通常它们不会侵染非宿主细菌。由于这种专一性,科学家一直想利用噬菌体防控土壤中那些对作物生长有害的病原细菌。  2月1日,《微生物组》(Microbiome)在线发表南京农业大学资源与环境科学学院沈其荣院士团队的最新研究成果。该研究发

浙大团队绘制土壤基因组基因相关性网络-解码土壤“黑箱”

  土壤微生物是元素生物地球化学循环过程及其他土壤生态过程的关键驱动因子。由于土壤结构和组成的复杂性,土壤微生物生态过程在研究中一直以来都被作为“黑箱”看待,要清楚阐明土壤生态功能是土壤生态学研究当前面临的一个重大挑战。  近日,浙江大学环境与资源学院徐建明教授团队在微生物学顶级期刊《国际微生物生态

基因编辑、噬菌体疗法与抗生素耐药性

  一项概念验证研究提出,噬菌体疗法可能提供一种方法从而解决长期以来难以处理的抗生素耐药性问题。以瞄准病原细菌的定制病毒为基础的噬菌体疗法可能帮助应对抗生素耐药性的激增,但是这种策略也受到一些缺点的影响,尤其是向受感染组织提供噬菌体的困难,以及耐噬菌体基因在细菌之间的频繁转移。Udi Qimron及

Lambda噬菌体

·         Lambda DNA Preparation (Stanford DNA Sequence & Technology Center)Detailed protocol for lambda DNA preparation with recipes·         Isolati

通过噬菌体ELISA鉴定得到的噬菌体克隆

经过3~4轮的筛选后,应该能够富集到能与受体特异性结合的噬菌体群体。通常而言,在后几轮的筛选中,每次获得的噬菌体总量都会增加,但是单就这个现象并不一定能说明已经筛选到了受体特异性结合的肽段。能与靶分子非特异性结合或者能与筛选基质的噬菌体克隆也会造成这一现象。噬菌体ELISA可以说是最灵敏的鉴定所获取

污泥农用致土壤抗性基因污染

  日前,中国科学院城市环境研究所城市土壤和生物地球化学研究组朱永官团队采用高通量荧光定量PCR系统和高通量测序,研究了长期使用污泥和鸡粪对土壤抗生素抗性基因丰度和多样性的影响。研究成果近日发表在《国际环境》杂志上。  抗生素抗性基因(ARGs)污染的两个主要源头是集约化养殖业和城市污水处理系统。未

关于土壤基因组DNA提取

土壤样品含有大量的微生物,其中绝大部分的微生物都是无法直接培养进行繁殖和研究。从土壤样品中提取 DNA 是研究土壤微生物zui为有效的方法。目前从土壤样品中提取微生物 DNA 的方法主要有直接法和间接法。直接法是指把土壤样品放在裂解液中,经过有效的破壁方法使微生物的DNA 全部释放到裂解液中,然后再

PLOS-ONE报道一种新噬菌体——巨型长尾病毒

  目前,一个国际研究小组,在南部非洲纳米比亚平原的一具斑马尸体中,发现了一种新的巨型长尾病毒(或噬菌体),这种病毒能够感染引起炭疽病的细菌。这种新的噬菌体,最终可能会为检测、治疗或净化炭疽杆菌(anthrax bacillus)及其引起食物中毒的近缘菌种,开辟新的途径。这项研究成果发

专家提出噬菌体防御系统基因的影响应引起重视

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498420.shtm

烈性噬菌体(virulent-phage)和温和噬菌体(temperate-phage)

噬菌体(bacteriaphage or phage)是病毒的一类,结构很简单,基本上由一个蛋白质外壳包裹着一些核酸组成的。噬菌体的多样性来自于组成其外壳的蛋白质的种类,以及其染色体的类型和结构的不同。(一)烈性噬菌体( virulent phage)遗传学上应用最广泛的烈性噬菌体是大肠杆菌( E.

噬菌体的概述

  噬菌体(bacteriophage, phage)是感染细菌、真菌、藻类 、放线菌或螺旋体等微生物的病毒的总称,因部分能引起宿主菌的裂解,故称为噬菌体。本世纪初在葡萄球菌和志贺菌中首先发现。作为病毒的一种,噬菌体具有病毒的一些特性:个体微小;不具有完整细胞结构;只含有单一核酸。可视为一种“捕食”

噬菌体的生长

Preparing Lawn Cells for M13 Cloning (Life Technologies)Lawn cells require the F' episome for M13 infection and may be prepared  Streaking Lambda

什么是噬菌体

噬菌体是感染细菌、真菌、藻类 、放线菌或螺旋体等微生物的病毒的总称,因部分能引起宿主菌的裂解,故称为噬菌体。本世纪初在葡萄球菌和志贺菌中首先发现。作为病毒的一种,噬菌体具有病毒的一些特性:个体微小、不具有完整细胞结构、只含有单一核酸。可视为一种“捕食”细菌的生物。噬菌体基因组含有许多个基因,但所有已

噬菌体的介绍

  噬菌体(bacteriophage, phage)是感染细菌、真菌、藻类 、放线菌或螺旋体等微生物的病毒的总称,因部分能引起宿主菌的裂解,故称为噬菌体。本世纪初在葡萄球菌和志贺菌中首先发现。作为病毒的一种,噬菌体具有病毒的一些特性:个体微小;不具有完整细胞结构;只含有单一核酸。可视为一种“捕食”

λ噬菌体DNA提取

   λ噬菌体是最早使用的克隆载体,λ噬菌体的基因组是一长度约为50kb的双链DNA分子,它在宿主细胞有两种生活途径,其一是裂解生长,环状DNA分子在细胞内多次复制,合成大量噬菌体基因产物,装配成噬菌体颗粒,裂解宿主菌再进行下一次感染;其二是溶源性生长,即感染细胞内λ噬菌体DNA整合到宿主菌染色体D

噬菌体如何培养

用大肠杆菌来培养。先制备培养大肠杆菌的培养基,培养大肠杆菌。然后用噬菌体再感染大肠杆菌。噬菌体就是细菌病毒,他是严格的活细胞寄生生物,所以要用活细胞来培养。

什么是噬菌体

噬菌体是感染细菌、真菌、藻类 、放线菌或螺旋体等微生物的病毒的总称,因部分能引起宿主菌的裂解,故称为噬菌体。本世纪初在葡萄球菌和志贺菌中首先发现。作为病毒的一种,噬菌体具有病毒的一些特性:个体微小、不具有完整细胞结构、只含有单一核酸。可视为一种“捕食”细菌的生物。噬菌体基因组含有许多个基因,但所有已

噬菌体抗体ELISA

实验概要噬菌体ELISA是一种快速而便捷的方法,尤其是因为pⅧ有多拷贝会导致信号的扩增。主要试剂1. 2%MPBS2. PBS/Tween3. 辣根过氧化物酶(HRP)标记的小鼠抗噬菌体单克隆抗体(mAb)(Amer Sham BiOSCiences)4. 3,3’,5,5’-四甲基联苯胺(TMB)

噬菌体检查

  病原体是许多疾病的主要诱因,对人类健康构成了严重威胁。近年来,食品、水源和环境中致病微生物已造成世界上许多流行病的爆发。因此,为了控制病原体的传播并减少流行病的发生,检测致病微生物的技术的成熟可行性显得尤为重要。  培养物细菌分离和鉴定是实验室检测病原体的“金标准”方法。该检测方法虽然足够灵敏,