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空间蛋白质组学:一种强大的细胞生物学发现工具

真核细胞高度区室化,生物过程被分隔在不同的区室进行。蛋白质功能与亚细胞定位密切相关,不同的区室提供不同的化学环境(例如pH和氧化还原条件)、不同的潜在作用配体或底物。因此,对蛋白质亚细胞定位的严格控制是细胞生理学的重要调控内容。大多数细胞生物学过程涉及蛋白质亚细胞定位的变化,例如转录因子在细胞核-胞浆的穿梭、细胞凋亡过程中线粒体蛋白的重新定位,以及细胞表面信号传导受体的内吞等。相反,蛋白质的错误定位通常与细胞功能障碍和疾病相关,包括神经变性、癌症和代谢紊乱等。以蛋白质空间定位为研究方向的空间蛋白质组现在已经用于揭示人类蛋白质组的复杂结构,如单细胞变异、动态蛋白质易位,相互作用网络改变,以及蛋白定位改变等。一些研究者也已成功运用空间蛋白质组学来研究疾病,包括急性病毒感染、肝病等。2019年5月,KTH 瑞典皇家理工学院的 Emma Lundberg 教授和德国马克斯-普朗克研究所的 Georg H. H. Borner 教授,在国......阅读全文

PNNL发表开源蛋白质组学软件Informed-Proteomics

  分析测试百科网讯 一则消息可能对蛋白组学研究者们最头痛的事有一定的缓解。美国一机构介绍了一款用于分析鉴定完整蛋白质的新型开源软件。  ProMex中的LS-MS特征查找,该功能是Informed-Proteomics软件套件的第一个组件的特征检测算法。 它被开发用于检测完整蛋白质离子的同位素包膜

MRM Proteomics同Biodesix合作开发蛋白质组肺癌精准诊断法

蛋白质组学领头公司MRM Proteomics和分子诊断公司Biodesix于近期签署了一项合作协议。根据协议条款,MRM Proteomics将授予Biodesix使用其专有iMALDI技术的权利,以进一步推进其基于血液的肺癌诊断。在此之前,Biodesix的测试菜单包括GeneStrat®基因组

10x Genomics收购空间基因组学领先者Spatial Transcriptomics

  近日,10x Genomics公司宣布收购位于瑞典斯德哥尔摩的Spatial Transcriptomics公司。Spatial Transcriptomics公司是空间基因组学(spatial genomics)领域的领先公司。空间基因组学是一个新兴领域,它不但让研究人员可以获得单细胞内的基因

Protocol for Protein Extraction for proteomics

Protocol for Protein Extraction10 % w/v TCA/ acetone/ 0.07 % v/v -MercaptoethanolPlant cells are rich in compounds that interfere with the 2DE separat

PROTEOMICS:O-GalNAc糖基化修饰蛋白质的系统发现

  近日,上海交通大学系统生物医学研究院张延课题组在国际知名蛋白质组学研究期刊PROTEOMICS上发表题为《Systematic identification of the protein substrates of UDP-GalNAc: polypeptide N-acetylgalactos

蛋白质组和蛋白质组学分析

 随着人类基因 组计划研究成果的公布,人们对基因的认识逐渐清晰,但基因数量的有限性和基因结构的相对稳定性,与生命现象的复杂性和多样性之间存在巨大反差。如何了解众多的基因与危害人类身心健康的疾病之间的关系,对生命科学研究者来说仍是一项长期而艰巨的任务。因此,作为生命活动的直接承担者――蛋白质,成为后基

Bruker推出新一代ultrafleXtreme MALDI-TOF/TOF质谱仪

  2009年4月27日,布鲁克道尔顿公司推出新一代ultrafleXtreme MALDI-TOF/TOF质谱仪,这是市场上唯一的,在TOF和TOF/TOF模式下都能获得真正的1 kHz采样速度的仪器,可用于广泛的研究、临床、和应用蛋白质组学。   布鲁克的新型ultrafleXtreme质

蛋白质组与蛋白质组学简介-2

3 甲基化干扰实验用来检测蛋白质的结合位点。甲基化修饰的DNA探针可以干扰蛋白质的结合。结合位点上未被修饰的DNA片段才能与蛋白结合,然后将DNA从被修饰的碱基处切割,电泳分离,结合蛋白的DNA在结合位点上不能被修饰,不能切断,可确定结合位点的位置。 4 Dnase I 足纹分析 蛋白

蛋白质组与蛋白质组学简介-1

一、蛋白质组概念:一个细胞、一个组织或一个机体全部基因所表达的全部蛋白质。 二、蛋白质组学研究范畴 1.蛋白质和蛋白质间 2.蛋白质和核酸之间 3.蛋白质及其组成质点的分离、分析、鉴定 4.蛋白质结构分析 5.生理、病理或不同发育状态下蛋白质组表

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类