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近日，一项刊登在国际杂志Genome Research上的研究报告中，来自西班牙的研究人员通过研究提出了一种复杂的计算机框架来分析单细胞的基因表达水平，这一技术可以扩展到对数百万个独立的细胞进行分析处理，这项研究中，研究人员首次开发了一种工具来分析诸如大规模的单细胞RNA序列数据库，这或能极大地扩展单细胞基因组学的研究范围。图片来源：xoomtrainings。com 人类机体中所有的细胞都能共享相同的基因组，但由于基因表达的不同，每一个细胞都有潜力转变成为组织或器官中的特殊部分，全球的科学家们都在寻找不同细胞之间的差异所在。当前基因组学研究中所面临的挑战之一就是分析许多单个细胞来来寻找并且识别这些细胞之间的差异，而利用单细胞RNA测序技术来分析单一细胞就能帮助科学家们面对挑战，并且理解组织、器官和有机体的复杂性。通过观察每个细胞的基因表达情况，研究人员就能在极高的分辨率下来描述样本的异质性。 大规模的单细胞计划常常能够......阅读全文
单细胞测序被评为2013年年度技术 2014 年首刊，《Nature Methods》杂志将2013年度技术(Method of the Year 2013)授予了单细胞测序(single-cell sequencing)。同时，杂志还介绍了2014年值得关注的技术，包括
当你读到这篇文章时，又一波CRISPR工具将会浮出水面。它们将需要接受测试和优化。不过，如果你询问开发者你在开展概念验证研究时是否应当试用它们时，你将仅获得鼓励。毕竟，迄今为止它们还不能从Addgene公司获得，但是将会很快上市了。 最新发布的一系列CRISPR工具包括新的谱系追踪方法，该方法
上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。 一、大规模基因功能的筛选 尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展，但是解析复杂的基
上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。 一、大规模基因功能的筛选 尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展，但是解析复杂的基因型-表型关系仍
细胞是生物学的基本单位，近年来研究人员正努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。而应用而生的就是单细胞测序技术，该技术是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组，更大更复杂的人类细胞基因组。而随着测序成本的大幅度下降，破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并对逐个细胞进行序列比较已经开始
每个月都有一大波新的CRISPR工具来袭。比如，Cas9抑制剂的出现可在各种场景下防止脱靶效应。人们也将CRISPR-Cas9系统与前沿的单细胞测序技术相结合，开发出新的策略。与此同时，研究人员开发出Cas9以外的效应物核酸酶，比如C2c2，靶向RNA以实现编辑和成像应用。 对于这些热门的技术
截止2020月7月27日，中国学者在Cell，Nature 及Science 发表了共计102项生命科学的研究成果，其中新冠肺炎领域占了近一半（共43篇）。iNature系统总结了这些研究成果： 按杂志来划分：Cell 发表了30篇，Nature 发表了45篇，
自2009年汤富酬研究员首次报道其开创性工作【1】以来，单细胞RNA测序技术已经逐渐成为生物医学研究的重要方法，其在发育生物学和干细胞领域展现出强大的应用前景。随着单细胞转录组扩增方法的不断优化，以及测序通量的持续提升，研究人员已经不再满足于几十甚至几百个单细胞所提供的信息量。2015年以来，一
澳大利亚加文医学研究所的科学家开发了一种新的单细胞测序方法RAGE-Seq（Repertoire and Gene Expression by Sequencing），该方法兼备高通量、靶向、长读长和单细胞测序特征，能够高准确度和灵敏度的识别全长抗原受体序列，追踪与癌症免疫反应相关的免疫细胞。7
近年来，随着精准医疗的发展，癌症治疗已经取得了长足的进步，其中借助免疫系统开发的多种治疗方法被人们寄予厚望。虽然部分治疗方法在临床治疗中已经获得一定的成功，但大多数只对部分患者有效，并且还会导致耐药、超进展以及免疫相关严重不良反应等问题。因此，了解免疫系统在癌症治疗中的表现，准确筛选最有可能获益
基因修饰动物是研究在发育和疾病中基因功能的重要工具。CRISPR/Cas9系统有效的应用于构建基因敲除和敲入小鼠。而杨辉团队正好专注于该领域。 杨辉，30岁时，就成为中科院上海生科院神经所研究员；2015年，入选国家“青年千人计划”；2019年，杨辉博士获得国家杰出青年基金资助。 由杨辉创办
【50】2019年4月12日，中科院上海药物所徐华强，王明伟，浙江大学张岩及匹兹堡大学医学院Jean-Pierre Vilardaga共同通讯在Science发表题为“Structure and dynamics of the active human parathyroid hormone r
【51/52】2019年4月4日，清华大学柴继杰课题组、中科院遗传发育所周俭民课题组和清华大学王宏伟课题联合同期背靠背发表两篇重量级Science文章，完成了植物NLR蛋白复合物的组装、结构和功能分析，揭示了NLR作用的关键分子机制，是植物免疫研究的里程碑事件。两篇文章分别是： "Li
本文中，小编整理了近年来科学家们在甲基化研究领域取得的重要研究成果，与大家一起学习！ 【1】Science：重大进展！揭示DNA甲基化增强基因转录机制 doi：10.1126/science.aar7854 DNA甲基化（DNA methylation）为DNA化学修饰的一种形式，能够在不
《Nature Methods》盘点2015年度技术，选出了最受关注的技术成果：单粒子低温电子显微镜（cryo-EM）技术。 除此之外，也整理出了2016年最值得关注的几项技术，分别为：细胞内蛋白标记（Protein labeling in cells）、细胞核结构（Unraveling nuc
环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种新兴的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)，是继microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非编码RNA家族中极具研究潜力的新成员。越来越多的研究表明，环状RNA具
二、DNA标记与细胞谱系示踪发育生物学的重点包括构成器官或生物体的细胞类型的多样性以及这些细胞的发育谱系历史。这些方面通常作为一个方向被单独研究，但最近的四篇新论文报道了一种将单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术与基于CRISPR的谱系示踪技术相结合来同时解剖转录组细胞表型和谱系历史的方法。近
截至2019年12月23日，中国学者在Cell，Nature及Science在线发表了107篇文章（2019年的Cell ，Nature 及Science 已经全部更新），iNature团队对于这些文章做了系统的总结： 按杂志来划分：Cell 发表了31篇，Nature 发表了44篇，Scie
Aviv Regev是一位生物分析专家。现在，她正致力于绘制人体的每一个细胞。 计算生物学家Aviv Regev喜欢做一些看似不可能完成的任务。2011年，她与分子遗传学家Joshua Levin合作，测试了RNA测序的几种方法。科学家们在测试几种技术的极限，以查看哪种方法表现最佳。他们用降解
在自然科学中，没有一个领域受到如此强烈的关注。 “物理当中我们尚未解的、最重要的部分是暗能量，它大约占整个物质世界的70%，非编码序列在整个人类遗传密码中实际上也是这个数量级的。”6月23日，在中国第一届分子诊断技术大会上，生物信息学家、中国科学院院士陈润生说。
基因产业正受到前所未有的重视。今年，精准医学不仅被纳入“十三五”规划，作为精准医学的“排头兵”，基因组学也被纳入“十三五”百大项目名单，要“加速推动基因组学等生物技术大规模应用”。 对著名基因组学专家、中国基因组学奠基人于军教授来说，基因组学引领的技术应用得到如此重视，既让他感到欣慰———20
计算生物学家Aviv Regev 喜欢挑战一些看似不可能完成的任务。2011年，她与分子遗传学家Joshua Levin合作，测试了RNA测序的几种方法。科学家希望找到这几种技术的极限，以查看哪种方法表现最佳。最终，Levin指出，一些技术的灵敏度非常高，能检测含量低于单细胞中含有的RNA量的样
RNA测序已经在生物学和医学的各个领域取得了前所未有的发展。在包括癌症在内的诸多疾病中，转录异构体的表达和用途是健康组织和患病组织之间变异的重要来源。鉴定差异剪接的异构体和融合转录本，可以为疾病的诊断和治疗提供信息。RNA测序还有助于揭示从单细胞到整个组织的转录组动力学。同时，cDNA测序也极大
RNA测序已经在生物学和医学的各个领域取得了前所未有的发展。在包括癌症在内的诸多疾病中，转录异构体的表达和用途是健康组织和患病组织之间变异的重要来源。鉴定差异剪接的异构体和融合转录本，可以为疾病的诊断和治疗提供信息。RNA测序还有助于揭示从单细胞到整个组织的转录组动力学。同时，cDNA测序也极大
解析细胞表型是免疫学中一个共同的单细胞分析目标。然而，T细胞受体V(D)J基因区域的随机重排带来了T细胞群体的复杂变化。这形成了庞大的T细胞部队，以便识别特定的外源蛋白，引发有效的免疫反应。 为了在单细胞水平实现深度的T细胞分析，Fluidigm近日在C1™系统上推出了一个全新的免疫学应用 –
随着大数据和全基因组测序的发展成熟和大量研究的广泛开展，有时不免让人觉得研究人员将他们的显微镜（microscope）更换为宏观镜（macroscope）。但是，《科学家》杂志举办的2018年十大创新竞赛讲述了一个不同的故事：单个细胞。在《科学家》杂志的独立评审团评选出的2018年十大创新产品中，它
7．等位基因特异性扩增 在设计引物时，根据已知突变位点的特征，在引物3’端或中间设计一错配碱基，使之仅能与突变型或野生型基因互补，而只扩增相对应的突变型或野生型基因。主要用于点突变导致的遗传病的检测。其优点是只需一步PCR，而无需电泳和标记，摆脱了分子生物学方法中必经电泳的现象。在相互竞争的突变
它是个非常了不起的工具。我想知道这个系统从头到尾如何工作。 Francisco Mojica并非第一个看见CRISPR的人，但他可能是第一个为它着迷的人。他还记得1992年当他首次瞥见可能引发一场生物技术革命的这个微生物免疫系统的那一天。他在评估地中海嗜盐菌的基因测序数据，注意到14个不寻常的
原核生物利用CRISPR-Cas抵抗在细胞上形成图中结构的病毒。 它是个非常了不起的工具。我想知道这个系统从头到尾如何工作。Francisco Mojica并非第一个看见CRISPR的人，但他可能是第一个为它着迷的人。他还记得1992年当他首次瞥见可能引发一场生物技术革命的这个微生物免疫系
近日，基因检测初创公司10x Genomics又筹集了3500万美元。本次融资是该公司D轮融资的延续，10x Genomics将用这笔资金继续推进研发工作和扩大产品营销。 在2018年4月，10x Genomics就已筹集了5000万美元的D轮融资，由Meritech Capital领投，Fi