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汤富酬最新综述:单细胞测序与干细胞

干细胞能够分化成为机体内任何类型的细胞,既是研究人体早期发育的理想工具,也是细胞治疗的宝贵资源。细胞间差异和异质性是干细胞群体固有的基本特性。如果我们对一群细胞进行组学分析,这些关键的信息就会被掩盖。 单细胞测序技术是近几年备受关注的强大工具,可以在同种干细胞中全面剖析细胞异质性,鉴定不同表型的细胞。北京大学的研究员汤富酬和文路在四月十五日的Genome Biology杂志上发表文章,深入浅出的介绍了干细胞生物学研究中的单细胞测序技术。 单细胞基因组、表观基因组、转录组测序技术最近发展得很快。这些方法被广泛用于不同的干细胞研究,促成了许多激动人 心的新发现。汤富酬和文路的这篇文章以表格形式对各种单细胞组学测序技术进行了总结,着重介绍了这些技术在干细胞领域(包括多能干细胞和组织特异性干细 胞)的应用。文章末尾还简单探讨了单细胞测序在干细胞领域的未来前景。 汤富酬研究员的研究团队最近陆续发表了多项研究成果。他们与首都医科大......阅读全文

【盘点】单细胞测序研究进展一览

  细胞是生物学的基本单位,近年来研究人员正努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。而应用而生的就是单细胞测序技术,该技术是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。而随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并对逐个细胞进行序列比较已经开始

单细胞测序技术“遍地开花”,精准医疗“如虎添翼”!

作者:Carrie  单细胞测序技术  基因测序在体外诊断市场中的重要性日益突出。其中,单细胞测序技术自2009年问世,2013年被Nature Methods评为年度技术以来,越来越多地被应用在科研领域。2015年以来,10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、S

Countstar Rigel 荧光分析仪在单细胞测序中的应用

1.单细胞测序单细胞测序(Single Cell Squencing):简称SCS,是指从单个细胞提取DNA或RNA样品进行DNA或RNA的测序。该技术自2009年问世,2013年被Nature Methods评为年度技术以来,越来越多地被应用在科研领域。2015年以来,10X Geno

2017单细胞扩增测序技术的最新进展

  细胞是构成生命体的结构和功能的基本单位,不同类型的细胞形态迥异,功能也各不相同。即使是同类细胞间看似相同,相互间也存在着广泛的细胞异质性。传统的群体细胞分析检测能更快速方便的获得大量数据并利于进行有效的统计学分析,但是随着研究的深入,这种基于群体细胞分析所获得的平均性数据,往往忽略了细胞个体间的

单细胞测序的重要性及应用方向(一)

单细胞测序研究一直是当今的热门话题,想知道单细胞技术有哪些重要的应用?想深入了解当今主流的单细胞测序技术吗?华大智造《单细胞测序技术讲堂》开讲啦!跟着小造一起寻找这些问题的答案。单细胞测序的重要性随着第二代测序(next generation sequencing,NGS) 技术和第三代测序(

单细胞基因组学:通往个体化医疗之门

  随着第二代测序技术的普及,单细胞测序迎来了迅猛发展。  近日,南方科技大学生物学系副教授贺建奎在美国冷泉港参加了单细胞分析会议后,在科学网博客里写道:“这是一个非常令人激动的前沿学术会议,我深深地体会到了单细胞基因组学时代的来临。”  他对《中国科学报》表示:“单细胞基因测序技术的突破,只是开了

新型微流控芯片可提高单细胞转录组测序效率

近日,中国科学院深圳先进技术研究院医工所微纳系统与仿生医学研究中心研究员陈艳和南加州大学教授钟江帆合作,在针对稀有细胞样本的单细胞测序技术方面取得新进展。相关研究成果以Improving single-cell tranome sequencing efficiency with a microfl

单细胞研究指南:测序方法大比拼

  多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过,近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们,每一个细胞都是独一无二的。不同类型的细胞激活特定组合的机制,即使是同类型细胞,基因表达也会出现差异。  那么,细胞之间的哪些差异有生物学意义,哪些差异来自于技术偏好呢?要获得可靠的结果又需要研究多少细胞呢?这

Analyst:新型微流控芯片可实现100%单细胞捕获率!

  近日,中国科学院深圳先进技术研究院医工所微纳系统与仿生医学研究中心研究员陈艳和南加州大学教授钟江帆合作,在针对稀有细胞样本的单细胞测序技术方面取得新进展。相关研究成果以Improving single-cell transcriptome sequencing efficiency with a

华人学者Nature Methods发布单细胞测序重要工具

  新一代测序技术(NGS)大大增进了我们对疾病(比如癌症)的理解。不过NGS的研究对象是细胞群体,会掩盖细胞之间的异质性。正因如此,单细胞测序(SCS)技术受到了越来越多的关注。  德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员开发了首个用于单细胞DNA测序的突变检出程序,Monovar。这一重要成果发

单细胞研究指南:测序方法大比拼

  多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过,近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们,每一个细胞都是独一无二的。The Scientist杂志最近联系了单细胞研究领域的一些专家,请他们分享了在单细胞中进行转录研究的秘诀。希望帮助研究者们更好地构建文库,处理和分析结果数据。  那么,细胞之间的哪

针对稀有样本——新方法提高单细胞转录组测序的效率

  近日,中国科学院深圳先进技术研究院医工所微纳系统与仿生医学研究中心研究员陈艳和南加州大学教授钟江帆合作,在针对稀有细胞样本的单细胞测序技术方面取得新进展。相关研究成果以Improving single-cell transcriptome sequencing efficiency with a

单细胞测序新突破: 北大绘制出人类胚胎基因调控图谱

  北京大学第三医院的汤富酬研究员等采用先进的单细胞RNA测序技术,绘制出人类植入前胚胎和胚胎干细胞的转录组图谱,有望在干细胞领域改善人类辅助生殖技术,以及预测潜在遗传病产生的健康影响。研究成果发表在8月11日《自然结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecu

多篇研究共同解读近期单细胞测序重磅级研究成果

  本文中,小编整理了近年来单细胞测序领域的重磅级研究成果,与大家一起学习!  【1】Cell:开发出空间单细胞测序技术,有助揭示早期乳腺癌产生浸润性之谜  doi:10.1016/j.cell.2017.12.007  在一项新的研究中,来自美国德州大学MD安德森癌症中心的研究人员报道一种新的遗传

单细胞转录组测序研究热点和发文锦囊

  从Top50期刊2000余篇文献统计:  在刚刚发布的“十四五”规划中,“基因与生物技术”作为前沿科技攻关领域之一。而在这个领域,近年来最具里程碑的技术突破必然不能忽略“单细胞转录组测序”。本文通过对PubMed数据库中Top50期刊的共计2357篇单细胞转录组测序的引文进行数据分析,帮助读者了

80后浙大教授《Cell》全球首次绘制哺乳动物细胞图谱

   来自浙江大学医学院干细胞与再生医学中心,浙江大学生命科学研究院等处的研究人员发表了题为“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-Seq”的文章,利用低成本、高效率、完全国产化的高通量单细胞测序平台,全球首次绘制出了哺乳动物细胞图谱。  这一研究成果公

单细胞RNA测序,众多研究都pick它

  多细胞测序和单细胞测序,你pick谁?如今,大多数研究人员也许会选择后者,因为不一样的角度,会带来不一样的见解。  多细胞测序和单细胞测序,你pick谁?如今,大多数研究人员也许会选择后者,因为不一样的角度,会带来不一样的见解。单细胞测序的最初动力来自癌症研究,可帮助人们了解肿瘤异质性和肿瘤微环

华人学者Nature Methods发布单细胞测序重要工具

  新一代测序技术(NGS)大大增进了我们对疾病(比如癌症)的理解。不过NGS的研究对象是细胞群体,会掩盖细胞之间的异质性。正因如此,单细胞测序(SCS)技术受到了越来越多的关注。  德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员开发了首个用于单细胞DNA测序的突变检出程序,Monovar。这一重要成果发

单细胞RNA测序发现新的免疫细胞

  最近在《Nature Immunology》发表的一项新研究,详细检测了一组新发现的免疫细胞(被称为ILC)。通过对单个扁桃体细胞的基因表达进行分析,瑞典卡罗林斯卡学院的科学家们,发现了三个以前未知的ILC子群,并揭示了关于“这些细胞在人体中如何发挥功能”的更多信息。  先天淋巴细胞(ILC)是

Science最新报道:单细胞测序助跑癌症精准分型

  麻省综合医院(MGH)、MIT布罗德研究所、哈佛大学近日在Science杂志上发表了一篇文章(3月31日),使用单细胞RNA测序技术,并结合癌症基因组图谱分析了星形细胞瘤(astrocytomas)和少突神经胶质瘤(oligodendrogliomas)两种脑神经胶质瘤(gliomas)的细胞组

Nature | 肝硬化单细胞病理学全解析

  酗酒和乙型、丙型肝炎病毒感染是肝硬化最常见的原因。肝硬化最常见的症状是疲劳、虚弱、食欲不振和黄疸。世界上约有8亿4千万人患有各种肝脏疾病,每年的死亡人数高达两百万并且呈逐渐上升姿态【1】。无论何种原因导致的反复性肝损伤都会导致肝脏的纤维化,并最终引起肝硬化。而且,肝脏的纤维化程度越重,患者的预后

华人学者Nature子刊单细胞基因组测序新突破

  在加州大学圣地亚哥分校生物工程师们的领导下,研究人员生成了来自单个大肠杆菌细胞以及人类大脑单个神经元的最完整基因组序列。采用一项新的单细胞基因组测序技术,他们在只有12纳升体积、充满液体的小孔中完成了基因组扩充,从而获得了这一突破性的成果。该项研究发表在11月10日的《自然生物技术》(Natur

单细胞mRNA测序揭示早熟树突状细胞在炎症反应中的作用

单细胞mRNA测序揭示早熟树突状细胞在炎症反应中的作用        ——研究表明单细胞测序在发现通常隐藏在海量细胞样本中的稀有细胞群的重要性波士顿和南旧金山,加州,2014年6月30——在本月Nature上发表的一篇文章中,Br

3月单细胞转录组重要研究文献汇总

  1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热   精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程,继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐,本月在《Nature

3月单细胞转录组重要研究文献汇总

  1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热   精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程,继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐,本月在《Nature

Cell Stem Cell巧用单细胞测序解析生发过程深层次调控机制

  单细胞转录组测序是这两年来非常流行的高通量组学研究工具,然而,是不是所有的研究都适合用该方法?是不是所有的问题都可以通过该方法来解释?这是一个值得探讨的问题。从现有的研究报道来说,单细胞转录组学研究很好地解决了细胞图谱,发育过程等重要的生物学问题。但是在相对比较传统的研究方向,是否也能利用单细胞

《Cell Stem Cell》巧用单细胞测序解析生发过程的调控机制

单细胞转录组测序是这两年来非常流行的高通量组学研究工具,然而,是不是所有的研究都适合用该方法?是不是所有的问题都可以通过该方法来解释?这是一个值得探讨的问题。从现有的研究报道来说,单细胞转录组学研究很好地解决了细胞图谱,发育过程等重要的生物学问题。但是在相对比较传统的研究方向,是否也能利用单细胞转录

强强合作研发针对晚期肝脏疾病的细胞治疗方案

  2020年2月20日,全球领先的单细胞分离系统提供商美国Namocell公司与Takara Bio及HepaTx联合宣布三方合作研发针对晚期肝脏疾病的细胞治疗方案,将HepaTx研发的可发育成肝脏细胞的脂肪组织内干细胞,首先利用Namocell专有的单细胞分离仪进行分离,然后用Takara Bi

三方合作研发针对晚期肝脏疾病的细胞治疗方案

  2020年2月20日,全球领先的单细胞分离系统提供商美国Namocell公司与Takara Bio及HepaTx联合宣布三方合作研发针对晚期肝脏疾病的细胞治疗方案,将HepaTx研发的可发育成肝脏细胞的脂肪组织内干细胞,首先利用Namocell专有的单细胞分离仪进行分离,然后用Takara Bi

科学家发现膀胱癌干细胞起源的重要遗传学机制

  肿瘤干细胞在肿瘤细胞的发生、自我更新、耐药性和转移中扮演着重要角色。作为泌尿系统最常见的恶性肿瘤——膀胱癌干细胞(Bladder Cancer Stem Cells)的起源和遗传学基础目前仍不明确。  中国科学院生物物理研究所蛋白质科学研究平台抗体工程实验室李翀与中国科学院微生物研究所、深圳大学