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PLOSGenet:单分子测序技术助力原核生物DNA甲基化研究

近日,刊登在国际杂志PLoS Genetics上的一项研究论文中,来自美国能源部联合基因组研究院的研究人员对230种古细菌和细菌基因组进行了测序,旨在研究DNA甲基化在原核生物中所扮演的关键角色。 细胞的表观基因组是基因组DNA特殊剪辑发生改变的一个特殊集合,这些表观基因组的改变会影响基因组的实际用途,而表观基因组的产生和变化一般是通过化学修饰而引发的。深入剖析地球微生物表观基因组的多样性或可帮助科学家深入理解微生物在地球营养循环中的作用,同时也可以利用基因组的调节系统来进行能量和环境相关领域的研究。 DNA甲基化是一种常见的表观基因组改变,其通常是真核生物用来调节基因表达的一种过程,比如维持特殊基因持续表达等;然而诸如细菌和古细菌等原核生物实际上也存在甲基化的DNA,但DNA甲基化的过程以及其在单细胞有机体中的功能目前研究人员并不清楚。 这项研究中,研究人员就对230种细菌和古细菌细胞基因组中的DNA甲基化模式进行了......阅读全文

Cell Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破

  2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

Cell Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破

  2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

Nature Genetics:全基因组测序领域的开拓性进展

  当我们提到DNA的甲基化,通常是指胞嘧啶(C)碳环上5号碳原子的甲基化,5-甲基胞嘧啶(5mC)。实际上,在原核生物中存在着3种DNA甲基化型式,5mC、4mC(4-甲基胞嘧啶)和6mA(6-甲基腺嘌呤),6mA起主导作用,缺乏6mA可导致一些细菌的死亡。科学家们曾经以为具有重要生理功能的DNA

纳米孔直接RNA和cDNA长读长测序概述

  RNA测序已经在生物学和医学的各个领域取得了前所未有的发展。在包括癌症在内的诸多疾病中,转录异构体的表达和用途是健康组织和患病组织之间变异的重要来源。鉴定差异剪接的异构体和融合转录本,可以为疾病的诊断和治疗提供信息。RNA测序还有助于揭示从单细胞到整个组织的转录组动力学。同时,cDNA测序也极大

纳米孔直接RNA和cDNA长读长测序概述

  RNA测序已经在生物学和医学的各个领域取得了前所未有的发展。在包括癌症在内的诸多疾病中,转录异构体的表达和用途是健康组织和患病组织之间变异的重要来源。鉴定差异剪接的异构体和融合转录本,可以为疾病的诊断和治疗提供信息。RNA测序还有助于揭示从单细胞到整个组织的转录组动力学。同时,cDNA测序也极大

科学家解析大豆灰斑病菌基因组信息

  大豆灰斑病又称褐斑病、蛙眼病,由真菌Cercospora sojina Hara引起,是世界性的病害,同时也是我国大豆主产区的一个主要病害,尤其在东北三省的发病最重。大豆灰斑病菌引起的病害在东北地区造成的产量损失在10%至30%之间。在阿根廷和巴西等国,据报道损失可达60%以上。灰斑病可在大豆的

刘伯宁:后基因组时代10年间生命科学的发展与挑战

  8月2日,我国科学家利用“全基因组关联分析”的方法,在人类1号染色体上发现了肝癌的易感基因区域。这将为肝癌的风险预测、早期预防和个体化治疗提供理论依据。  事实上,自2000年人类基因组草图绘制完成迄今,科学家已经相继发现70余种疾病的易感基因,基于此的基因诊断产业已经初现端倪,但10

魏文胜:基因组编辑平台技术及未来产业运用发展趋势

  “基因组编辑未来产业运用发展是如今的热点,利用这个技术,不管做动植物转化改造还是医药领域应用,可以做的事情非常多,但是具体怎么落地?我跟大家一样,有的时候会觉得无从下手,所以今天我会更多从技术层面给大家做一个简单的介绍。”  △魏文胜 北京大学生命科学学院教授  以下是正文:  各位下午好!谢谢