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6月王牌聚焦:技术的进步破解多项生命科学之谜

二代测序技术解开了不少未解之谜,也令一些研究领域重焕生机,这就是技术的力量,同样在过去几年间,一些技术的进步也帮助科学家们回答了以前未曾解答的问题,本月就有不少此类成果。 要通过X射线衍射确定蛋白的原子结构时,首先得有大的、结构良好的蛋白质晶体。这说来容易做来难。许多蛋白质,尤其是膜蛋白,无法形成大的晶体,往往形成纳米或微米大小的晶体。来自亚利桑那州立大学的研究人员利用一种称为X射线自由电子激光(X-ray free electron laser,XFEL)的设备,通过发光元件分析了一种有潜力的药物靶标。 最新这项研究利用阿岗国家实验室(Argonne National Laboratory)先进光子源(Advanced Photon Source),SLAC国家加速器实验室的设备,发现了血管紧张素(angiotensin)II受体AT2R的新结构细节,这一结构已经困扰了科学家们20年。AT2R是两种血管紧张素II受体之......阅读全文

什么是X射线自由电子激光?

X射线自由电子激光(X-ray free electron laser, XFEL)是由直线加速器产生的X射线。XFEL是直线加速器中的电子束加速至接近光速,成为相对论电子,在波荡器作用下产生正弦运动路径,在运动轨迹切线方向产生同步辐射光,同步辐射光与电子束运动周期相同,于是得到相干叠加的光场,这种

“欧洲X射线自由电子激光”项目动工

  位于德国汉堡的“欧洲X射线自由电子激光”项目的核心工程——3条地下隧道30日正式动工,预计2014年完工,2015年可进行首次科研实验。   据德国媒体报道,欧洲X射线自由电子激光设施是世界上首个能产生高强度短脉冲X射线的激光设施。这一大型科研项目由德国牵头,欧洲11个国家共同

专家聚焦“硬X射线自由电子激光”

  以“紧凑型硬X射线自由电子激光装置与应用”为主题的S23次香山科学会议日前在上海召开,杨国帧等6位院士和多位来自中国科学院,国内高等院校以及美国斯坦福大学、布鲁克海文国家实验室和欧洲X射线自由电子激光等国际国内的专家学者与会。  中国科学院物理所的杨国帧院士作了X射线自由电子激光,在科技上重要意

硬X射线自由电子激光装置启动建设

  上海张江综合性国家科学中心又一重大装置项目——“硬X射线自由电子激光装置”日前获批启动。据悉,该项目作为《国家重大科技基础设施建设“十三五”规划》优先布局的、国内迄今为止投资最大的重大科技基础设施项目,在国家发展改革委、上海市和中科院的共同关心与支持下,在项目各参建单位的共同努力下,取得了阶段性

“硬X射线自由电子激光装置”在上海启动建设

  4月27日, “硬X射线自由电子激光装置”建设启动。这标志着国内迄今为止投资最大、建设周期最长的国家重大科技基础设施项目——硬X射线自由电子激光装置自此迈入全面建设时期。  当天上午, “X射线自由电子激光的科学机遇与技术挑战”学术论坛在上海科技大学举行。目前,X射线自由电子激光装置已成为发达国

Optica:X射线自由电子激光振荡器研究获进展

  上海光源科学中心自由电子激光团队在X射线自由电子激光振荡器研究方面取得重要进展,理论提出了一种产生涡旋X光的方法。研究表明,仅仅通过增益失谐的调节,X射线自由电子激光振荡器的输出就可以从传统的高斯光变为涡旋光。7月17日,相关研究成果以Generating X-rays with orbital

软X射线自由电子激光装置实验研究取得新进展

  近日,中国科学院上海高等研究院、上海应用物理研究所自由电子激光团队,在外种子自由电子激光研究方面取得重要进展,理论提出了一种相干能量调制的自放大机制,并基于上海软X射线自由电子激光装置(SXFEL)完成实验验证。研究表明,这一新机制可降低外种子自由电子激光对外种子激光的功率需求,解决了外种子自由

英国出资564万英镑参与X射线自由电子激光装置项目

  据悉,英国生物技术与生物科学研究理事会、英国医学研究理事会和英国维康集团将在未来5年内(2014-2019)共同出资564万英镑参与位于德国汉堡的欧洲X射线自由电子激光装置(XFEL)项目。  2014年被联合国确定为“国际晶体学年”。联合国呼吁让晶体学发挥更大的作用以造福人类。晶体学被用于确定

软X射线自由电子激光装置实现水窗波段放大出光

  近日,我国首台X射线自由电子激光用户装置——上海软X射线自由电子激光装置(简称SXFEL)调试工作连续取得突破性进展,先后在5.6纳米、3.5纳米、2.4纳米和2.0纳米波长实现自由电子激光放大出光,实现了“水窗”波段全覆盖,并在3.5纳米实现饱和,输出峰值功率超过500MW,X射线贯通光束线传

二代测序技术

人们常说“事后诸葛亮”,可见“料事如神”是一个让人艳羡的能力。现代科技的发展让人们无限接近这种能力,天气预报就是现代人诸多“料事如神”本领中的一种,不断进步中切实提高了生活品质与舒适度。个人体会进步主要体现在两个方面:1.越来越说人话。印象里小时候听天气预报感觉听的是中文,但是这些中国话想表达什么听

二代测序原理

第二代测序(Next-generation sequencing,NGS)又称为高通量测序(High-throughput sequencing),是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。我们都知道一代测序为合成终止测序,而二代测序开创性的引入了可逆终止末端,从而实现边合成边测序(Seque

X射线自由电子激光原理和生物分子结构测定研究中应用

  1 X射线的产生  X射线本质上是电磁波,其波长范围大致从0.01 nm 到 10 nm,与可见光(400—700 nm)不同,X 射线的短波长可以探测物质内部的精细结构,因此自从被伦琴发现以来就被用来观测物质的内部结构。随着人造 X射线光源的亮度和稳定性的提高,其应用范围涵盖物理、化学、生物、

上海软X射线自由电子激光用户装置通过HLSS运行模式测试

  上海软X射线自由电子激光(SXFEL)用户装置完成并通过自由电子激光谐波驱动自种子(HLSS)先进运行模式的工艺测试。测试以线上线下相结合的方式进行,测试专家组由中国科学院近代物理研究所、中科院高能物理研究所、中国科学技术大学、北京大学、清华大学、上海交通大学、中科院大连化学物理研究所、中科院上

二代测序及其应用

二代测序为高通量测序,采用微珠或高密度芯片边合成边测序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次获得数G数据,相对与第三代,都仍然需要扩增的方法放大信号,扩增后再检测。二代测序应用如下:1、Illumina 原理:桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像。2、Roche 454:油包

不卑不亢看待二代测序

  人们常说“事后诸葛亮”,可见“料事如神”是一个让人艳羡的能力。现代科技的发展让人们无限接近这种能力,天气预报就是现代人诸多“料事如神”本领中的一种,不断进步中切实提高了生活品质与舒适度。个人体会进步主要体现在两个方面:  1.越来越说人话。印象里小时候听天气预报感觉听的是中文,但是这些中国话想表

二代测序及其应用

二代测序为高通量测序,采用微珠或高密度芯片边合成边测序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次获得数G数据,相对与第三代,都仍然需要扩增的方法放大信号,扩增后再检测。二代测序应用如下:1、Illumina 原理:桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像。2、Roche 454:油包

软X射线源上X射线能谱与X射线能量的测量

本文介绍了国内首次利用针孔透射光栅谱仪对金属等离子体Z箍缩X射线源能谱的测量结果及数据处理方法。同时用量热计对该源的单脉冲X射线能量进行了测量并讨论了其结果。

二代测序分析未来如何

二代测序数据分析越来越热但是我觉得虽然在这个大环境下还是应该冷静思考一下。数据分析和数据分析员,我觉得要先弄清这两者的区别,数据分析,现在注重的算法和生物学的结合,优化现有的分析流程和对大数据背景下的深度挖掘(其实对计算机和算法的要求更高一些),如果数据分析员其实说白了就是一个重复分析流程的搬砖工。

什么是二代测序技术

二代测序技术又称为高通过量测序技术,是对传统Sanger测序(称为一代测序技术)革命性的改变。二代测序技术的核心思想是边合成边测序,可以一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,所以又被称深度测序。由于二代测序技术具有多样本、多位点同时进行测序并且具有较高的覆盖率等优势,在生命科学领域已经被

什么是二代测序技术

二代测序技术又称为高通过量测序技术,是对传统Sanger测序(称为一代测序技术)革命性的改变。二代测序技术的核心思想是边合成边测序,可以一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,所以又被称深度测序。由于二代测序技术具有多样本、多位点同时进行测序并且具有较高的覆盖率等优势,在生命科学领域已经被

诊断性二代测序指南

   通过二代测序(next-generation sequencing,NGS)能够快速地对某个个体患者的数千个甚至数百万个DNA碱基对进行测序。这一技术快速出现并且获得成功,这预示着一个遗传学诊断的新的时代的到来。但是,新技术也带来了新的挑战,一方面是技术层面上的,即数据处理问题,另一方

什么是基因二代测序

第二代测序为高通量测序,采用微珠或高密度芯片边合成边测序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次获得数G数据,相对与第三代,都仍然需要扩增的方法放大信号,扩增后再检测。第二代测序技术的核心思想是边合成边测序(Sequencing by Synthesis),即通过捕捉新合成的末端的标

二代测序原理及应用

二代测序原理及应用如下:一、原理二代测序原理也就是文库构建,PCR产生的片段或基因组打断的片段两端需要添加接头修饰才能进行测序。1、末端修饰。打断的片段是随机断裂,其末端可能是不平的。因此,建库第一步是补齐不平的末端。2、添加接头。经过末端修饰后的DNA片段3’末端具有突出的A尾,而接头具有突出的T

X射线光谱

1914年,英国物理学家莫塞莱(Henry Moseley,1887-1915)用布拉格X射线光谱仪研究不同元素的X射线,取得了重大成果。莫塞莱发现,以不同元素作为产生X射线的靶时,所产生的特征X射线的波长不同。他把各种元素按所产生的特征X射线的波长排列后,发现其次序与元素周期表中的次序一致,他称这

X射线散射

美国物理学家康普顿(Arthur Holy Compton,1892~1962)在大学生时期就跟随其兄卡尔·康普顿开始X射线的研究。后来他到了卡文迪什实验室,主要从事g射线的实验研究。他用精湛的实验技术精确测定了γ射线的波长,并确定γ射线在散射后波长会变得更长。但他没能从理论上解释这个实验事实。他到

X 射线激光

X 射线激光指的是 XFEL (x-ray free-electron laser),X 射线自由电子激光。而这种激光,是将自由电子激光技术(FEL)产生的激光,拓展到 X 射线范围内而产生的一种 X 射线激光。这种激光的强度可达传统方法产生的激光亮度的十亿倍,因此可让较小晶体产生出足够强的衍射图样

X射线诊断

  X射线应用于医学诊断[6],主要依据X射线的穿透作用、差别吸收、感光作用和荧光作用。由于X射线穿过人体时,受到不同程度的吸收,如骨骼吸收的X射线量比肌肉吸收的量要多,那么通过人体后的X射线量就不一样,这样便携带了人体各部密度分布的信息,在荧光屏上或摄影胶片上引起的荧光作用或感光作用的强弱就有较大

X射线治疗

  X射线应用于治疗[7],主要依据其生物效应,应用不同能量的X射线对人体病灶部分的细胞组织进行照射时,即可使被照射的细胞组织受到破坏或抑制,从而达到对某些疾病,特别是肿瘤的治疗目的。

X射线原理

X射线定义X射线是由于原子中的电子在能量相差悬殊的两个能级之间的跃迁而产生的粒子流,是波长介于紫外线和γ射线之间的电磁波。其波长很短约介于0.01~100埃之间。X射线具有很高的穿透本领,能透过许多对可见光不透明的物质,如墨纸、木料等。这种肉眼看不见的射线可以使很多固体材料发生可见的荧光,使照相底片

x射线衍射仪和x射线机有什么不同

X射线衍射仪和X射线机有什么不同我觉得X射线机是用来照射X光线X射线衍射线一他是用来衍射的他俩不同