发布时间:2015-09-11 17:45 原文链接: BioTechniques:无细胞表达究竟哪家强?

  无细胞表达系统让研究人员能够快速生成蛋白质,从而受到人们的青睐。来自真核细胞的裂解物能够对蛋白质进行翻译后修饰,但不同翻译系统的细微差别也会导致蛋白生产的变化。无细胞表达究竟哪家强?亚利桑那州立大学的研究人员近日在《BioTechniques》上发表了他们的比较结果。

  在目前的无细胞蛋白合成而言,大肠杆菌仍然是首选。不过,由于对人类和哺乳动物蛋白及其翻译后修饰的兴趣日益增加,真核系统也逐渐受到人们的欢迎。此外,对于某些技术,如mRNA展示和核酸可编程的蛋白芯片(NAPPA),研究人员倾向于使用真核表达系统来研究蛋白质互作。

  在这项研究中,研究人员比较了市场上三种常用的真核无细胞表达系统:麦胚提取物(WGE,Promega)、兔网织红细胞裂解物(RRL,Promega)和HeLa细胞裂解物(HCL、赛默飞世尔)。

  对于每个系统,研究人员定量了环状质粒和线性DNA所产生的萤光素酶蛋白的量。这些DNA模板的5’非翻译区(UTR)包含三种不同的翻译增强元件,包括脑心肌炎病毒(EMCV)内部核糖体进入位点,以及来自烟草花叶病毒(TMV)和苜蓿花叶病毒(AMV)的两个最小翻译增强元件。而模板的3’端也带有或不带62个核苷酸的poly-A尾巴。

  研究人员发现,质粒DNA产生的蛋白大约是线性DNA的500倍。对于模板上的元件,5’ UTR上的序列偏好对表达量有明显的影响,相比之下,3’ poly-A尾巴就没那么重要。他们认为,最有效的蛋白翻译系统是HeLa细胞裂解物,配合含有EMCV内部核糖体进入位点的质粒。线性模板效率不高,可能是因为它在细胞裂解物中被降解。线性模板的环化可防止降解,并提高产量。

  在一些应用中,人们必须使用特定的裂解物或DNA模板。为此,研究人员给出了一些建议。对于麦胚提取物,当5’ UTR中存在AMV或TMV时,质粒和线性DNA模板都能发挥最佳作用。对于HeLa细胞裂解物,情况则刚好相反,它表现出对EMCV的强烈偏好。此外,若3’端出现poly-A尾巴,则带有EMCV的线性DNA模板的翻译增加10倍。兔网织红细胞裂解物对质粒5’ UTR的序列没有明显的偏好,但同样偏爱线性模板中的AMV和TMV。

  为了说明这个结果并非萤光素酶特有的,研究人员也检验了其他几种人类蛋白,得出了相似的结论。作者在文中写道,为了尽可能提高蛋白产量,他们建议使用HeLa细胞裂解物以及5’ UTR上携带EMCV内部核糖体进入位点的质粒。尽管这个系统的成本比较高,但所产生的蛋白量也是其他系统的20-50倍。这使其成为高通量蛋白表达分析的理想选择。

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