发布时间:2015-06-19 15:00 原文链接: Cell公布最新基因组测序结果

  去年夏天西非埃博拉爆发的早期阶段,科学家们以空前的规模和速度测序了这种致命病毒的基因组,为人们揭示了许多疫情蔓延的关键信息,比如说病毒只通过人与人接触传播,病毒在多次传播中获得了许多新突变等等。

  虽然埃博拉爆发最糟糕的时期已经过去,但这场疫情并未结束,还有许多问题需要人们去解答。为此,哈佛大学、Broad研究所、美国疾控中心(CDC)、美国国家过敏和传染病研究所(NIAID)等研究机构测序了两百多个埃博拉病毒样本的基因组,进行了迄今为止最全面的分析。这项研究发表在六月十八日的Cell杂志上,展示了病毒在这么长时间里发生的改变。

  “我们之前的工作反映了埃博拉爆发后三周的病毒行为,”文章的资深作者Sabeti说。“现在这项研究跟踪了病毒在七个月内的变化,有助于理解埃博拉的长期演化。”

  “这些高分辨率的测序数据显示,在埃博拉疫情爆发的后期,病毒跨境传播是非常少的,”文章第一作者Danny Park指出。“这是一个重要的信息,因为塞拉利昂、利比里亚和几内亚(三个受疫情影响的主要国家)的国境被认为是千疮百孔的。”

  跨境行为在埃博拉爆发初期推动了疫情的发展,但后来病毒并没有像人们预测的那样迁移,Park说。“在国境上实施的控制措施的确有效,这是令人欣慰的好消息,”他说。“人们也应当把关注国内的迁移行为。”

  研究人员通过测序分析了埃博拉在持续性爆发中出现的演化。随着病毒在早期阶段快速扩散,它们累积了许多突变,其中有不少可以影响蛋白质功能。去年的测序研究表明,这些突变大多对病毒是有害的,但当时疫情持续的时间还不长,不足以通过自然选择将其清除。

  现在研究人员看到,许多突变并没有存留多久,病毒的基因组变化速度符合人们的预期。“这一次埃博拉在人类中传播得最久规模也最大,它已经开始清除对自己不利的突变了,” Park说。

  这项研究还证实了人们的一些其他推测,比如说有患者体内出现了人类酶编辑病毒基因组的现象。这是首次在埃博拉中发现这类事件,该事件一般只出现在和人类长期互作的病毒中。

相关文章

科学家发现西瓜抗黄瓜绿斑驳花叶病毒的基因

近日,中国农业科学院郑州果树研究所瓜果质量安全监测与控制技术创新团队发现西瓜抗黄瓜绿斑驳花叶病毒的基因。相关研究成果发表于《分子植物病理》(MolecularPlantPathology)。ClAGO......

给忙碌的你一本病毒世界“观光指南”

经过了一年多的时间,新冠肺炎疫情仍然没有平息,有观点认为,它或将与流感一样,成为人类生活中的常态疾病。那么,我们应该怎样与它长期共存呢?《给忙碌者的病毒科学》或许能给我们一些启示。该书作者王立铭是浙江......

突变之谜:揭开COVID19快速传播背后的秘密

理化学研究所的研究人员发现,SARS-CoV-2病毒的一个早期突变(D614G)可能通过改变尖峰蛋白的形状,提高病毒适应人类宿主的能力,从而促成了它的快速传播。这一发现可能有助于为下一代疫苗和抗病毒药......

许多人仍未接受丙型肝炎的治疗

悉尼大学领导的一个新项目希望通过鼓励人们接受新的、治疗性很强的治疗,来研究如何在澳大利亚消除丙型肝炎。丙型肝炎是一种血液传播的病毒,是导致肝硬化、癌症和肝衰竭的主要原因之一。治疗很重要,因为它有助于阻......

人工智能:防止下一次传染病全球大流行的秘密武器

早在2016年,也就是在一场呼吸道传染性疾病大流行让世界陷入停滞的四年前,联合国环境规划署(UNEP)就对人畜共患病敲响了警钟,将其确定为全球关注的关键新兴问题。现在,根据世界卫生组织的数据,每年约有......

COVID19疫苗产生的抗体持续时间远比预期的长

发表在《BMC传染病》杂志上的这项研究发现,长COVID-19患者接受COVID-19疫苗后,他们产生了针对导致COVID-19的病毒的抗体,时间比预期的长。当一个人受到感染时,免疫系统通常会通过制造......

Nature高福武桂珍刘军在华南海鲜市场样本中发现新冠病毒

武汉市华南海鲜市场与2019年12月发现的早期人类新冠肺炎(COVID-19)病例存在关联,并于2020年1月1日关闭。为了调查市场内新冠病毒的流行情况,2020年1月1日至3月30日期间,市场内及周......

Nature高福武桂珍刘军在华南海鲜市场样本中发现新冠病毒

武汉市华南海鲜市场与2019年12月发现的早期人类新冠肺炎(COVID-19)病例存在关联,并于2020年1月1日关闭。为了调查市场内新冠病毒的流行情况,2020年1月1日至3月30日期间,市场内及周......

新冠病毒最可能来自哪里?官方最新回应:人类!

央视新闻4月8日下午,国新办就我国新冠溯源研究情况举行发布会。发布会上,国家疾控局副局长、中国疾控中心主任沈洪兵表示,距离2019年年底新冠疫情被发现以来,已经过去了三年多的时间。在此期间,我们一直在......

“新生儿基因组”计划拟对10万名婴儿测序

据美国有线电视新闻网(CNN)20日报道,英国将于今年晚些时候开始对10万名新生儿的基因组进行测序,绘制婴儿完整的遗传指令集。这将成为同类研究中规模最大的研究,有望对儿童医学产生深远影响。耗资1.05......