Cell子刊挑战教科书，嵌合突变并不罕见

　　 一个人大多数的新突变被认为起源于生殖系细胞。其他的突变，体细胞嵌合突变――只存在于人类一小部分细胞中，可以通过从父母一代一代传下去，或是起源于早期发育。这种嵌合突变被认为是相当罕见的，但是根据六月五日发表在《美国人类遗传学杂志》（The American Journal of Human Genetics）的一项研究表明，它们可能引起高达6.5%的基因组变异。如果得到证实，这些结果可能会影响研究人员评估“一个人的疾病相关基因传递给他们孩子的风险”。

　　牛津大学遗传学家Anne Goriely没有参与这项工作，他评论称，这项研究的主要价值在于，它试图量化这一过程。

　　在胚胎形成后当一个新生突出现变时，可能会产生嵌合体。最近，研究人员开始使用更新、更敏感的测序技术来确定嵌合突变。在目前这项研究中，荷兰内梅亨大学医学中心的Alexander Hoischen及其同事们，用四种不同的测序方法，来估计这种现象在孩子中的发生率。

　　研究人员基于以前的一项测序研究，通过把50名智力障碍儿童与其不受影响的双亲的基因组进行比较，确定了疾病相关的新生突变。他们产生了另外三个深度测序数据集，来评估107个有代表性的突变的等位基因比值。在分析的107个基因突变中，有七个（6.5%）在父母的生殖细胞系中未检测到。有四个新生突变――来自共4081个已确定的疑似新生突变，以50%的频率发生在孩子中，但是出现在父母一方血液样本中的频率却较低（约3.5%）。研究人员指出，尽管在频率上存在差异，父母双亲可能通过生殖细胞系将这种突变传递给孩子。

　　加拿大安大略省癌症研究所和多伦多大学的Philip Awadalla从事人类群体和医学基因组学研究，他没有参与这项工作，但是他指出，鉴于目前测序技术的局限性，这个嵌合突变频率可能只是冰山一角。

　　Hoischen赞成：“这可能是对这些突变事件的一个保守估计。”而20%和40%之间的一个等位基因比值，暗示了一种嵌合突变，目前全基因组方法还不能将噪声，和这些在10%比例（或更少）上检测到的突变的低频率区别开来。

　　研究小组也用模型来确定每种测序技术的最小等位基因比值，可能反映了一种真正的嵌合突变而不是测序相关噪声。然而，目前的基因组测序标准需要至少30倍的覆盖率，作者认为，要确定存在于40%以下等位基因频率的嵌合突变，需要至少100倍的覆盖率。

　　这些结果引发了一系列质疑：其他组织中的嵌合体水平如何？这些变异遗传给下一代的频率多高？它们是否会导致疾病？

　　Hoischen称，教科书上的知识认为我们身体每个细胞中的基因都是相同的，这可能并不是真的。

　　Goriely说，我们把自己看作“个体”，部分是因为我们的基因组成是独特的。但我们是多细胞生物，包含许多细胞群，它们精确组织成不同的组织和器官。这项研究表明，我们的一些细胞携带我们基因组的不同版本。无论从临床角度还是从哲学角度来说，这一发现的意义都是深远的。